Protein–RNA interactions for Protein: P19838

NFKB1, Nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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NFKB1P19838 AC087045.3-201ENST00000623046 2468 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
NFKB1P19838 HEPH-202ENST00000343002 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
NFKB1P19838 OR2F1-203ENST00000641412 4829 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
NFKB1P19838 SLC26A5-206ENST00000393727 2270 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
NFKB1P19838 SPOCK1-201ENST00000282223 4488 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
NFKB1P19838 ZNFX1-202ENST00000371752 7212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
NFKB1P19838 TMEM116-201ENST00000355445 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
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NFKB1P19838 EPGN-201ENST00000332112 847 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
NFKB1P19838 MIR181C-201ENST00000384881 110 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
NFKB1P19838 CAV1-203ENST00000393468 845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
NFKB1P19838 CAV1-204ENST00000393470 598 ntTSL 4 BASIC7.63□□□□□ -1.19
NFKB1P19838 C1D-204ENST00000410067 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
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NFKB1P19838 OR4A16-201ENST00000314721 1081 ntAPPRIS P1 BASIC7.62□□□□□ -1.19
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NFKB1P19838 LARP1P1-201ENST00000407692 292 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
NFKB1P19838 RN7SKP225-201ENST00000410405 352 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
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