Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 ARG1-203ENST00000368087 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 AKAP3-206ENST00000545990 3318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 GNPAT-201ENST00000366647 2643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 SORCS1-203ENST00000369698 2638 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 NUSAP1-212ENST00000560747 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 NOS1-202ENST00000338101 4462 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 AC097375.3-201ENST00000515329 2652 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 EOGT-208ENST00000540764 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 SOX9-AS1-217ENST00000623935 1563 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 NCR3LG1-201ENST00000338965 6438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 ZNF20-201ENST00000334213 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 EIF4BP2-201ENST00000416702 1794 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 AC009044.1-201ENST00000624577 1798 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 YY1AP1-203ENST00000347088 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 TAPT1-AS1-201ENST00000570786 2165 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 VPS8-204ENST00000424463 2359 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 UTY-210ENST00000538878 6574 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 FAT1-212ENST00000614102 14758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 ABCC4-201ENST00000376887 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 SELENON-205ENST00000630065 2994 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 TNPO3-202ENST00000471166 3019 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 FAM186A-201ENST00000327337 7127 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 MS4A12-201ENST00000016913 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 OR13C4-201ENST00000277216 957 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 SPATA19-201ENST00000299140 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 PMCH-201ENST00000329406 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 HYPM-201ENST00000341016 501 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 POU1F1-201ENST00000344265 1149 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 RN7SKP93-201ENST00000363838 309 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 SNORA58.1-201ENST00000364133 136 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 OR5V1-215ENST00000377154 1266 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 RNU6-297P-201ENST00000384636 107 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 MTCO3P40-201ENST00000392516 676 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 RNU6-248P-201ENST00000410720 107 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 LINC01646-201ENST00000420522 682 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 AC092647.1-201ENST00000420654 287 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 LINC00851-201ENST00000423033 727 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 CASP12-204ENST00000433738 709 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 PA2G4P6-201ENST00000438325 1197 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 AP006216.1-201ENST00000439104 419 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 AC002553.1-201ENST00000442828 802 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
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C4orf17Q53FE4 LINC01474-202ENST00000449235 628 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 NIPA2P5-201ENST00000452282 464 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 PRMT8-203ENST00000452611 1204 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
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C4orf17Q53FE4 AC016489.1-201ENST00000461109 375 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
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C4orf17Q53FE4 LINC01438-201ENST00000512794 556 ntTSL 4 BASIC7.46□□□□□ -1.22
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C4orf17Q53FE4 LINC01170-201ENST00000519703 406 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 AC013644.1-202ENST00000523166 499 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
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C4orf17Q53FE4 AP002336.1-201ENST00000531426 422 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
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C4orf17Q53FE4 AC004241.1-203ENST00000552502 460 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 AL136501.1-201ENST00000555913 790 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 PTCSC3-201ENST00000556013 571 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 NIFKP8-201ENST00000560500 874 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 MIR3714-201ENST00000579507 65 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
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C4orf17Q53FE4 APOC1-202ENST00000588750 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
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C4orf17Q53FE4 LINC02391-201ENST00000615716 800 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
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C4orf17Q53FE4 AC120349.2-201ENST00000625002 298 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 AC131649.2-201ENST00000624925 4439 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 C14orf2-203ENST00000553430 1659 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 MAPK10-301ENST00000641313 2482 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 ZNF215-202ENST00000414517 3257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 PIGA-201ENST00000333590 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 HNRNPU-219ENST00000639628 4546 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 GULP1-202ENST00000409580 3544 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 IMPG1-204ENST00000611179 3324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 SLAMF6-203ENST00000368059 2743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 TMED8-201ENST00000216468 7784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 CFI-205ENST00000512148 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 STAT2-202ENST00000418572 1548 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 DDX11L16-201ENST00000507418 1306 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 PDLIM5-201ENST00000317968 6083 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 CCR3-208ENST00000545097 1786 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 PPP2R1B-206ENST00000527614 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 ABLIM3-201ENST00000309868 4326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 NPL-203ENST00000367553 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 AL353132.1-201ENST00000415260 2043 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 AC125603.4-201ENST00000621942 2699 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
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