Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 RNA5SP280-201ENST00000411230 115 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 NUCB1-AS1-201ENST00000416432 433 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 KCNMA1-AS3-201ENST00000418515 701 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 SNRPEP5-201ENST00000425442 278 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 AF274573.1-201ENST00000430535 494 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 AC138761.5-201ENST00000433967 325 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 AC074367.1-201ENST00000438685 1125 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 AL162739.1-201ENST00000450606 307 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 AL354953.1-201ENST00000457852 479 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 RPL22L1-202ENST00000463836 506 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 MTND3P24-201ENST00000506306 329 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 AC019133.1-201ENST00000508292 420 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 AC090958.1-201ENST00000511122 351 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 AC131953.1-201ENST00000513127 477 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 HMMR-AS1-201ENST00000514724 697 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 AC025524.2-206ENST00000517953 439 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 XAGE1B-205ENST00000518075 472 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 AC009879.1-201ENST00000520029 839 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 AP002370.2-202ENST00000533669 908 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 AC025252.2-201ENST00000537470 502 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 AC027544.2-201ENST00000539313 630 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 AP002383.3-201ENST00000545958 593 ntTSL 4 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 AL118556.1-201ENST00000555257 502 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 CNIH1-205ENST00000556113 523 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 AC027020.1-202ENST00000557839 429 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 AL132640.1-201ENST00000559594 619 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 AC026464.3-201ENST00000563634 564 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 AC007923.1-201ENST00000577970 505 ntTSL 4 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 ZNF814-214ENST00000600634 461 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 AC245052.7-201ENST00000601161 359 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 AL136139.1-201ENST00000605568 222 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 LY86-AS1-206ENST00000607278 677 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 AC135803.1-201ENST00000608748 565 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 Metazoa_SRP.180-201ENST00000612546 322 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 AC097641.3-201ENST00000613523 464 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 AC021766.1-201ENST00000624404 741 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 CR589904.1-203ENST00000636515 318 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 AC123767.1-201ENST00000519537 1439 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 PTPRR-204ENST00000440835 2818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 ZNF546-201ENST00000347077 7987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 C3orf35-203ENST00000425564 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 PSG2-202ENST00000406487 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 CD47-201ENST00000355354 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 NAT1-201ENST00000307719 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 INSL4-201ENST00000239316 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 OR7A5-201ENST00000322301 4216 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 AL034546.1-201ENST00000623740 3693 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 ZNF766-201ENST00000439461 6298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 HSP90AA2P-201ENST00000530115 2196 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 LRRK2-201ENST00000298910 9158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 UGT2B24P-201ENST00000514441 1597 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 VDAC2-214ENST00000543351 1424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 AP002833.3-201ENST00000625075 2265 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 IFNA7-201ENST00000239347 737 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 SLC25A51-201ENST00000242275 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 ATP6V1G3-201ENST00000281087 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 ATP6V1G3-202ENST00000309309 678 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 MIR345-201ENST00000362114 98 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 RNA5SP114-201ENST00000363780 113 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 AL626787.1-201ENST00000366136 594 ntTSL 4 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 STATH-202ENST00000381060 534 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 TRAV10-201ENST00000390432 379 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 AL391419.1-201ENST00000398901 1275 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 AL024497.1-201ENST00000412954 631 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 TRBV30-201ENST00000417977 447 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 MTND4LP14-201ENST00000429447 288 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 AL138733.2-201ENST00000431947 804 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 MTND2P25-201ENST00000449028 610 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 AC019080.2-201ENST00000453859 394 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 RN7SL815P-201ENST00000470970 290 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 L3HYPDH-206ENST00000487285 700 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 SEC22A-210ENST00000492595 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 AC106806.2-201ENST00000509365 500 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 NPM1P52-201ENST00000518264 846 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 AC011333.1-201ENST00000520587 436 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 AC084026.1-201ENST00000522028 564 ntTSL 4 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 AC012574.1-201ENST00000523874 252 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 AP000873.2-209ENST00000528083 547 ntTSL 4 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 AP003049.1-201ENST00000529418 457 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 PCED1B-AS1-202ENST00000547600 523 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 CR383656.14-201ENST00000551951 406 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 LINC00687-203ENST00000558175 696 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 ZNF322P1-201ENST00000568013 1209 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 AC027281.1-201ENST00000574178 758 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 AC008764.5-201ENST00000597851 190 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 AC092960.1-201ENST00000604762 351 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 AC093635.1-201ENST00000609028 555 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 AL031777.2-201ENST00000611953 196 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 CU638689.1-201ENST00000623225 897 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 CU634019.4-201ENST00000623347 897 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 LINC00216-201ENST00000623548 1126 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 AC061999.1-201ENST00000624454 177 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 AC005154.1-203ENST00000626245 451 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 AC026108.1-201ENST00000635444 547 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 AL160396.1-201ENST00000637433 575 ntTSL 4 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 TRAPPC6B-201ENST00000330149 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 AIG1-209ENST00000629020 3636 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 MYBPC1-214ENST00000549145 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 TRPC4-202ENST00000355779 2784 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
CTF1Q16619 ZNF189-201ENST00000259395 3115 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.3 ms