Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 MYBPC1-223ENST00000553190 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
USF2Q15853 AC012668.3-202ENST00000417485 1642 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
USF2Q15853 AC098679.1-203ENST00000505532 2227 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
USF2Q15853 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
USF2Q15853 HSPA8P14-201ENST00000552265 1805 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
USF2Q15853 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
USF2Q15853 RPL7A-202ENST00000323345 891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
USF2Q15853 OR5B17-201ENST00000357377 946 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
USF2Q15853 RN7SKP189-201ENST00000365042 330 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
USF2Q15853 NPL-202ENST00000367552 745 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
USF2Q15853 RNU1-46P-201ENST00000384425 164 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
USF2Q15853 MIR187-201ENST00000385062 109 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
USF2Q15853 ATP5E-203ENST00000395663 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
USF2Q15853 AL117344.1-201ENST00000407196 616 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
USF2Q15853 RNA5SP296-201ENST00000410523 111 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
USF2Q15853 AC011752.1-203ENST00000417609 582 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
USF2Q15853 AC091492.1-201ENST00000419844 272 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
USF2Q15853 OR52S1P-201ENST00000427016 937 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
USF2Q15853 RPS10P21-201ENST00000430654 475 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
USF2Q15853 AL162231.2-201ENST00000434627 665 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
USF2Q15853 OSBPL10-AS1-206ENST00000447181 575 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
USF2Q15853 RBMY2TP-201ENST00000451162 947 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
USF2Q15853 RPL21P42-201ENST00000488408 464 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
USF2Q15853 AGGF1P3-201ENST00000493675 1213 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
USF2Q15853 RPL10P7-201ENST00000495649 625 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
USF2Q15853 AC091849.1-201ENST00000509920 121 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
USF2Q15853 AC011405.1-203ENST00000510110 1067 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
USF2Q15853 IGKV2D-38-201ENST00000518423 240 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
USF2Q15853 AC010609.1-201ENST00000519375 569 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
USF2Q15853 AC084026.1-201ENST00000522028 564 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
USF2Q15853 AC069234.3-201ENST00000544939 569 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
USF2Q15853 DYNLRB2-204ENST00000562982 492 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
USF2Q15853 MED31-202ENST00000574128 619 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
USF2Q15853 AC119868.1-202ENST00000584741 347 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
USF2Q15853 AC068254.1-201ENST00000584753 483 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
USF2Q15853 AC011824.3-201ENST00000585093 563 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
USF2Q15853 SOX9-AS1-216ENST00000602213 821 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
USF2Q15853 AC024085.1-201ENST00000604299 432 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
USF2Q15853 AL353807.4-201ENST00000604995 257 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
USF2Q15853 AL445465.1-206ENST00000609544 528 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
USF2Q15853 HOXA11-AS1_3.1-201ENST00000613383 98 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
USF2Q15853 MRPL57P3-201ENST00000619218 176 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
USF2Q15853 AC006328.2-201ENST00000623198 397 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
USF2Q15853 AC012005.2-201ENST00000624333 397 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
USF2Q15853 KIAA0586-203ENST00000423743 5339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
USF2Q15853 SSX5-201ENST00000311798 1384 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
USF2Q15853 CCDC190-202ENST00000367911 1395 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
USF2Q15853 EEF1A1P24-201ENST00000451469 1378 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
USF2Q15853 DNA2-201ENST00000358410 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
USF2Q15853 NFX1-201ENST00000318524 3513 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
USF2Q15853 PTPRR-204ENST00000440835 2818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
USF2Q15853 TMEM217-202ENST00000356757 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
USF2Q15853 Z83820.1-201ENST00000456978 1499 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
USF2Q15853 LINGO2-204ENST00000613945 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
USF2Q15853 LYARP1-201ENST00000436977 1501 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
USF2Q15853 USP46-202ENST00000451218 4622 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
USF2Q15853 CCDC102B-210ENST00000584156 1554 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
USF2Q15853 TCF7L2-217ENST00000536810 3953 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
USF2Q15853 CASC15-207ENST00000607048 1634 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
USF2Q15853 SFT2D2-201ENST00000271375 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
USF2Q15853 LINC01579-207ENST00000557481 3480 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
USF2Q15853 RNF111-212ENST00000561186 4536 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
USF2Q15853 CLUL1-213ENST00000620089 1947 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
USF2Q15853 FYB2-201ENST00000343433 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
USF2Q15853 KLF12-201ENST00000377669 10637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
USF2Q15853 LINC01277-201ENST00000419957 2398 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
USF2Q15853 MTUS1-201ENST00000262102 6160 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
USF2Q15853 IFNK-201ENST00000276943 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
USF2Q15853 CAV1-203ENST00000393468 845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
USF2Q15853 RN7SKP117-201ENST00000410175 264 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
USF2Q15853 AC009362.1-201ENST00000427253 406 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
USF2Q15853 Z68868.1-201ENST00000429048 544 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
USF2Q15853 LINC01889-201ENST00000430692 668 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
USF2Q15853 PUDPP2-201ENST00000431423 643 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
USF2Q15853 AL138733.2-201ENST00000431947 804 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
USF2Q15853 AC239800.1-201ENST00000442049 719 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
USF2Q15853 AL122008.4-201ENST00000446433 388 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
USF2Q15853 NPM1P19-201ENST00000450070 712 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
USF2Q15853 AL591363.1-201ENST00000450091 483 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
USF2Q15853 AC026391.1-201ENST00000450677 537 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
USF2Q15853 AC019084.1-201ENST00000457337 432 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
USF2Q15853 AC007003.1-201ENST00000472463 736 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
USF2Q15853 DEFB109A-201ENST00000482450 265 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
USF2Q15853 AF305872.1-201ENST00000485217 471 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
USF2Q15853 CENPK-211ENST00000510693 1040 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
USF2Q15853 AC022784.1-201ENST00000512942 699 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
USF2Q15853 AC087273.2-201ENST00000519038 634 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
USF2Q15853 VPS37A-208ENST00000521005 479 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
USF2Q15853 TBCA-209ENST00000522370 435 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
USF2Q15853 RACGAP1-216ENST00000548961 387 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
USF2Q15853 AC073896.2-202ENST00000549860 437 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
USF2Q15853 LINC02413-201ENST00000549914 723 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
USF2Q15853 AL445383.1-201ENST00000554689 874 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
USF2Q15853 AC040977.1-201ENST00000573222 343 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
USF2Q15853 AC010761.3-201ENST00000578819 499 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
USF2Q15853 AL031429.2-201ENST00000602605 649 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
USF2Q15853 AL356986.1-201ENST00000604085 341 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
USF2Q15853 AC023206.1-201ENST00000605824 298 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
USF2Q15853 MIR4435-2HG-219ENST00000609220 883 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
USF2Q15853 PTCHD3P1-201ENST00000612350 537 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.2 ms