Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

Predictions only

Length 4,861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 DLG2-209ENST00000418306 3027 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 KCNA1-201ENST00000382545 7997 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.38□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 DAZ3-202ENST00000382365 3503 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 CREM-208ENST00000361599 2170 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 UGT2B4-201ENST00000305107 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 PIK3CB-208ENST00000477593 4658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 FGF10-201ENST00000264664 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 ACSL5-203ENST00000356116 3353 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 OR1L6-202ENST00000373684 1044 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 IGLV7-43-201ENST00000390298 385 ntAPPRIS P1 BASIC3.38□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 AC069213.2-201ENST00000420238 366 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 TTC3-AS1-201ENST00000424733 1097 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 AP000365.1-201ENST00000438850 546 ntTSL 4 BASIC3.38□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 AL049649.1-201ENST00000444792 1105 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 snoU13.20-201ENST00000459180 104 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 AC134511.1-201ENST00000535721 192 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 C7-201ENST00000313164 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 RAP1GDS1-204ENST00000408900 1942 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 XIAP-205ENST00000434753 8415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 RASGRF1-201ENST00000394745 2850 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 PCDH15-229ENST00000616114 5846 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 AL583808.2-201ENST00000418078 1382 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 ADA2-203ENST00000399837 4505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 ZNF107-204ENST00000423627 5773 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 SLX4-201ENST00000294008 7307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 C15orf40-201ENST00000304177 11244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 EIF4G2-205ENST00000525681 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 OR5F1-201ENST00000278409 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.38□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 LMO7-205ENST00000377534 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 TRAV12-2-201ENST00000390437 445 ntAPPRIS P1 BASIC3.38□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 AL022100.2-201ENST00000422548 389 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 AL590723.1-201ENST00000426030 629 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 AL139819.1-201ENST00000429420 471 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 NEDD9-208ENST00000504387 3211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 AC091563.1-201ENST00000520544 490 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 AC024681.2-201ENST00000523525 204 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 PPP6R3-206ENST00000524904 4292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 AC133555.2-201ENST00000550213 292 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 AC021351.1-202ENST00000561394 701 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 AC005670.2-201ENST00000571841 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 SNORA70D-201ENST00000578836 135 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 AC024255.1-201ENST00000614376 102 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 SLC35F5-213ENST00000638402 1554 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 PPFIA2-205ENST00000541570 2976 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 SLC13A1-201ENST00000194130 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 EML5-207ENST00000554922 9570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 ZNF841-201ENST00000389534 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 PTPRB-209ENST00000550857 5839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 GBP3-202ENST00000370481 3067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 ZNF407-201ENST00000299687 7948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 AC138915.4-201ENST00000565549 4147 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 NEDD4L-204ENST00000382850 8251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 NXPE3-205ENST00000491511 8074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 AC010531.4-202ENST00000569872 1718 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 AGPAT4-201ENST00000320285 7865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 NPM1-202ENST00000351986 1237 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 AL049697.3-201ENST00000406493 982 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 GAS5-208ENST00000425771 242 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 LINC00390-201ENST00000432331 340 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 ANKRD54P1-201ENST00000433115 471 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 AC002465.1-201ENST00000436097 349 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 AC019185.1-201ENST00000442718 389 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 CRYGGP-201ENST00000443337 145 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 RPL6P5-201ENST00000445678 828 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 AC090638.1-201ENST00000498296 909 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 FRMD6-AS2-201ENST00000556617 548 ntTSL 4 BASIC3.38□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 AC012050.1-201ENST00000558185 472 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 C15orf41-205ENST00000563167 772 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 AC109460.2-201ENST00000569974 544 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 AC040162.2-201ENST00000573092 157 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 AC017100.2-201ENST00000584628 355 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 ZNF260-202ENST00000523638 5666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 HMMR-203ENST00000393915 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 IGSF11-201ENST00000354673 3206 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 NOL8-208ENST00000442668 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 GABPB2-202ENST00000368918 8964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 DNAJC18-201ENST00000302060 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 ARID4A-203ENST00000395168 4051 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 KNG1-202ENST00000287611 1720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 MYO18B-202ENST00000407587 8090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 DDX46-201ENST00000354283 3821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 RNF150-206ENST00000515673 9805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 DISP1-201ENST00000284476 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 MEIS1-201ENST00000272369 4291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 CUBNP3-201ENST00000457461 1784 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 OLFM4-201ENST00000219022 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 OR7E25P-202ENST00000641088 5937 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 IGIP-201ENST00000333305 3458 ntAPPRIS P1 BASIC3.37□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 AL607077.1-201ENST00000401718 499 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 AC233289.1-201ENST00000403700 508 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 RPL36AP15-201ENST00000444514 266 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 COX6B1P5-201ENST00000509843 249 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 AP001999.2-201ENST00000529417 389 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 AC068993.1-201ENST00000546724 589 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 AC016144.1-201ENST00000548175 1087 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 AC012181.3-201ENST00000565861 601 ntTSL 4 BASIC3.37□□□□□ -1.87
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