Protein–RNA interactions for Protein: Q15404

RSU1, Ras suppressor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSU1Q15404 AC004594.1-201ENST00000482375 463 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
RSU1Q15404 AC009567.2-201ENST00000502989 349 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
RSU1Q15404 AC105389.1-201ENST00000510602 561 ntTSL 4 BASIC5.34□□□□□ -1.55
RSU1Q15404 PATE4-203ENST00000534411 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
RSU1Q15404 AC011603.3-201ENST00000549516 279 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
RSU1Q15404 AC068408.1-201ENST00000577406 1144 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
RSU1Q15404 PPIAP14-201ENST00000577627 496 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
RSU1Q15404 RN7SL657P-201ENST00000582431 293 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
RSU1Q15404 ZNF677-211ENST00000601828 719 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
RSU1Q15404 LSM1P2-201ENST00000604911 322 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
RSU1Q15404 AC247036.1-201ENST00000605005 389 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
RSU1Q15404 AL589743.6-201ENST00000611025 117 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
RSU1Q15404 CLK4-214ENST00000611575 1206 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
RSU1Q15404 FGF1-214ENST00000612258 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
RSU1Q15404 AC027506.1-201ENST00000621395 198 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
RSU1Q15404 LINC01822-201ENST00000435682 2098 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
RSU1Q15404 FHL1-218ENST00000543669 2878 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
RSU1Q15404 SLFN5-201ENST00000299977 10591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
RSU1Q15404 ZNF260-204ENST00000592282 5055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
RSU1Q15404 LEKR1-201ENST00000356539 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
RSU1Q15404 RIMS1-219ENST00000523963 3097 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.56
RSU1Q15404 CFAP57-204ENST00000528956 3037 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.56
RSU1Q15404 MECOM-201ENST00000264674 4900 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
RSU1Q15404 FBXW12-201ENST00000296438 1647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
RSU1Q15404 FCGR1B-209ENST00000616817 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
RSU1Q15404 TRPM6-203ENST00000361255 8271 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
RSU1Q15404 SMARCE1-208ENST00000474246 2124 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
RSU1Q15404 PTK2-213ENST00000519465 3279 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
RSU1Q15404 AL356479.1-203ENST00000411798 1440 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
RSU1Q15404 PI15-202ENST00000523773 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
RSU1Q15404 RAB30-212ENST00000533486 9929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
RSU1Q15404 RACGAP1-203ENST00000454520 3080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
RSU1Q15404 HDAC1P2-201ENST00000453661 1398 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RSU1Q15404 OPRM1-217ENST00000522236 2459 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
RSU1Q15404 SPANXN2-201ENST00000598475 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
RSU1Q15404 ACTR3C-201ENST00000252071 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
RSU1Q15404 XAGE3-201ENST00000346279 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
RSU1Q15404 RNA5-8SP5-201ENST00000365304 152 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RSU1Q15404 ZNF669-202ENST00000366500 489 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
RSU1Q15404 AC016745.1-201ENST00000422178 508 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
RSU1Q15404 ELOBP4-201ENST00000423418 296 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RSU1Q15404 AP003385.1-201ENST00000426387 893 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RSU1Q15404 AL158212.1-201ENST00000428766 315 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
RSU1Q15404 NPM1P23-201ENST00000440193 849 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RSU1Q15404 AC016908.1-201ENST00000442571 1219 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RSU1Q15404 MORF4-201ENST00000447135 971 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RSU1Q15404 AL133319.1-201ENST00000447848 777 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
RSU1Q15404 RAB28P2-201ENST00000454299 641 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RSU1Q15404 AC112187.1-201ENST00000455837 479 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RSU1Q15404 snoU13.29-201ENST00000459370 104 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RSU1Q15404 SSBP1-205ENST00000465582 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
RSU1Q15404 RPL5P33-201ENST00000487833 905 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RSU1Q15404 SERF1B-203ENST00000503931 569 ntTSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
RSU1Q15404 SERF1A-204ENST00000504458 569 ntTSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
RSU1Q15404 AC018645.1-201ENST00000505003 109 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RSU1Q15404 AC116345.3-201ENST00000508255 449 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
RSU1Q15404 AC013724.1-201ENST00000511962 783 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
RSU1Q15404 AC108727.2-201ENST00000512277 392 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
RSU1Q15404 BFSP2-AS1-201ENST00000515542 894 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
RSU1Q15404 FBXO16-207ENST00000518734 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
RSU1Q15404 IGHV4-55-201ENST00000520889 368 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RSU1Q15404 DEFB134-202ENST00000526438 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
RSU1Q15404 AC079907.2-202ENST00000547004 423 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
RSU1Q15404 NPIPB1P-201ENST00000547442 1129 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
RSU1Q15404 HMGN2P47-201ENST00000559378 272 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RSU1Q15404 AC009145.2-201ENST00000562685 377 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
RSU1Q15404 AC105243.1-201ENST00000563172 1165 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
RSU1Q15404 AC138907.7-201ENST00000568972 358 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
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RSU1Q15404 AC027229.1-201ENST00000583887 253 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RSU1Q15404 NPIPB1P-202ENST00000588786 828 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RSU1Q15404 AC005332.4-201ENST00000592752 579 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RSU1Q15404 AC010326.3-201ENST00000597780 679 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
RSU1Q15404 AL512430.4-201ENST00000603085 613 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RSU1Q15404 SNORA74.4-201ENST00000607595 199 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RSU1Q15404 MALAT1-209ENST00000616691 587 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
RSU1Q15404 Metazoa_SRP.96-201ENST00000621315 318 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RSU1Q15404 TRAPPC3L-201ENST00000356128 2421 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
RSU1Q15404 NTRK3-205ENST00000394480 19984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
RSU1Q15404 CPSF2-201ENST00000298875 13035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
RSU1Q15404 EBF1-211ENST00000622875 4430 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RSU1Q15404 ANK3-201ENST00000280772 16874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
RSU1Q15404 AL136984.1-201ENST00000607611 1893 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RSU1Q15404 LZIC-203ENST00000400903 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
RSU1Q15404 DYDC2-201ENST00000256039 1842 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RSU1Q15404 PLCH1-202ENST00000340059 6168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
RSU1Q15404 NR2C2-213ENST00000617312 8113 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
RSU1Q15404 AL078595.2-201ENST00000605309 1780 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RSU1Q15404 TCF7L2-206ENST00000355995 4073 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
RSU1Q15404 PTPRD-202ENST00000356435 9472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RSU1Q15404 AL359091.1-201ENST00000449048 1734 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RSU1Q15404 ZNF431-201ENST00000311048 13894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
RSU1Q15404 CTTNBP2NL-201ENST00000271277 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
RSU1Q15404 SCML2-202ENST00000398048 1334 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
RSU1Q15404 RAB30-216ENST00000612684 9783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RSU1Q15404 KRTAP19-6-201ENST00000334046 330 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RSU1Q15404 SPP1-202ENST00000360804 1196 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
RSU1Q15404 AC092634.1-201ENST00000366505 199 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RSU1Q15404 AC121334.1-201ENST00000396414 802 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RSU1Q15404 AL160163.1-201ENST00000417465 403 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
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