Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 DNAL1-202ENST00000553645 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 KCNJ15-201ENST00000328656 8399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 MEIS1-201ENST00000272369 4291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 TMPRSS11BNL-202ENST00000510782 3202 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 AC009804.2-201ENST00000637566 3032 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 OSBPL9-206ENST00000453295 2842 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 CSTF3-201ENST00000323959 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 FAR2-201ENST00000182377 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 AL020995.1-201ENST00000427524 1680 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 CCDC186-203ENST00000369287 7245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 DYNC2LI1-201ENST00000260605 1399 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 TERB2-201ENST00000340827 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 KIF16B-202ENST00000355755 606 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 RNA5SP346-201ENST00000363541 121 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 OR2W4P-201ENST00000406496 926 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 HMGA1P8-201ENST00000414130 321 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 RPS17P17-201ENST00000419392 409 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 AC245884.2-201ENST00000426257 404 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 AL583839.2-201ENST00000443716 641 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 TIMM8BP2-201ENST00000445940 251 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 SEPHS1P4-201ENST00000446112 1176 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 RARRES2P3-201ENST00000457739 473 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 L3HYPDH-206ENST00000487285 700 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 AC114728.1-201ENST00000488289 483 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 AL117692.1-201ENST00000494283 713 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 SNX18P25-201ENST00000510539 758 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 AC108103.1-201ENST00000511286 446 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 AP001208.1-201ENST00000518612 408 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 AC036111.2-201ENST00000533247 901 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 AP001858.2-201ENST00000536213 601 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 AC127522.1-201ENST00000560531 751 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 AC023389.2-201ENST00000580031 955 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 ZNF682-208ENST00000596019 552 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 AL139041.1-201ENST00000605480 610 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 AL359091.2-201ENST00000609303 556 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 AL135999.3-201ENST00000610501 812 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 AC097641.3-201ENST00000613523 464 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 COPS7B-225ENST00000631349 189 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 TTC33-206ENST00000636863 1149 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 BCORP1-202ENST00000441139 3461 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 MUSK-206ENST00000416899 3344 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 RIMKLB-207ENST00000538135 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 AC021092.1-201ENST00000592946 3199 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 ZEB2-244ENST00000638007 9140 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 EFNA5-206ENST00000611503 4933 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 SMIM21-203ENST00000584508 2554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 MR1-209ENST00000617803 7584 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 SOS1-201ENST00000395038 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 FGF1-216ENST00000621536 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 AL391704.1-201ENST00000422206 2368 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 SEC61A2-202ENST00000304267 2030 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 DAAM1-202ENST00000395125 5806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 AC007114.2-201ENST00000576014 4281 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 SPRY3-201ENST00000302805 9019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 CLEC6A-201ENST00000382073 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 MYPN-202ENST00000358913 6013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 PLEKHH2-201ENST00000282406 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 ZNF735-201ENST00000429565 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 PTPRZ1-202ENST00000449182 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 RANBP3L-204ENST00000515759 1532 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 C11orf1-203ENST00000529270 1437 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 LARP7-210ENST00000509061 2332 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 CRYBA1-201ENST00000225387 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 OR2G3-201ENST00000320002 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 RN7SKP77-201ENST00000363261 353 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 RNU1-49P-201ENST00000363468 159 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 SPRR2B-201ENST00000368755 617 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 TINAG-203ENST00000370869 782 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 RNU6-233P-201ENST00000410845 141 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 RN7SKP144-201ENST00000411108 279 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 AL139158.1-201ENST00000424719 340 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 AC016908.1-201ENST00000442571 1219 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 HIGD1AP16-201ENST00000450986 258 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 AL133351.3-201ENST00000454998 193 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 YRDCP3-201ENST00000456507 480 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 PEX5L-AS2-201ENST00000462801 630 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 MARK2P8-201ENST00000476069 952 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 AC106822.1-201ENST00000502647 526 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 ZNF519P4-201ENST00000514008 125 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 TMEM68-213ENST00000522576 826 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 NPIPB14P-203ENST00000532298 987 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 LRTOMT-218ENST00000541614 726 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 AL132989.1-201ENST00000557322 576 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 PWRN1-208ENST00000567647 561 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 AC135050.4-201ENST00000568708 504 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 MIR3189-201ENST00000578735 73 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 LINC01476-202ENST00000584262 635 ntTSL 4 BASIC6.36□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 SMIM12P1-201ENST00000603004 274 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 AP001823.1-201ENST00000604056 1003 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 AC005828.7-201ENST00000607331 556 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 MIR6889-201ENST00000613185 59 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 AC239809.3-202ENST00000628902 686 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 LINC02341-201ENST00000637043 824 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 CASP1-215ENST00000533400 2001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 MED12L-206ENST00000474524 10744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 ZNF766-201ENST00000439461 6298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 AP002004.1-203ENST00000531091 1768 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 VCAM1-201ENST00000294728 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 DHRS9-204ENST00000428522 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 GTSF1-209ENST00000552397 1621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 170.9 ms