Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 OR7A10-201ENST00000248058 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 CLDN10-201ENST00000299339 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 COX6B1P3-201ENST00000312310 260 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 STAG3L4-201ENST00000352103 530 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 ZCCHC6-202ENST00000375947 611 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 RNA5SP156-201ENST00000410250 110 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 RN7SKP240-201ENST00000410583 375 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 AL512622.1-201ENST00000414106 481 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 AL109610.1-201ENST00000414598 431 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 AL137071.1-201ENST00000422150 243 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 BTG3P1-201ENST00000435859 716 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 PNKDP1-201ENST00000435914 430 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 AL359644.1-204ENST00000440807 440 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 AC016908.1-201ENST00000442571 1219 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 AC114814.1-201ENST00000444926 691 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 RBMY2AP-201ENST00000445405 1157 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 AC097463.1-201ENST00000447288 481 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 RBMY2CP-201ENST00000448575 1157 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 RBMY2DP-202ENST00000448881 1157 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 BBIP1-208ENST00000454061 812 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 PPIAP7-201ENST00000454070 489 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 Z83838.1-202ENST00000456225 839 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 AC092925.1-201ENST00000470739 493 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 PRMT5P1-201ENST00000514351 598 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 AP000620.1-201ENST00000527147 504 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 KCTD21-AS1-203ENST00000527321 586 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 TNFRSF17-201ENST00000053243 994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 OLR1-210ENST00000544577 924 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 AC103876.1-202ENST00000561498 369 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 LINC01966-201ENST00000595809 821 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 AC073333.2-201ENST00000603589 769 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 AL591167.1-201ENST00000607321 456 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 AP001437.1-201ENST00000608783 456 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 Metazoa_SRP.207-201ENST00000612254 285 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 AC010809.3-201ENST00000621310 641 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 AC079753.1-201ENST00000623243 3868 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 THRB-203ENST00000396671 7506 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 CDK14-206ENST00000436577 4787 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 USP40-202ENST00000409945 1946 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 NAV3-201ENST00000397909 9821 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 AC024651.2-201ENST00000562480 2098 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 EXD1-202ENST00000458580 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 LARP7-210ENST00000509061 2332 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 PSMB2-202ENST00000621781 4217 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 KIAA0586-203ENST00000423743 5339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 ADH1B-205ENST00000625860 4059 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 TBC1D23-202ENST00000394144 3677 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 VCAN-203ENST00000343200 9455 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 NCOR1-202ENST00000395848 3106 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 BICD1-204ENST00000548411 8811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
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CDH18Q13634 YPEL5-201ENST00000261353 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 ETF1-203ENST00000503014 1736 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 ZNF192P1-201ENST00000440790 1628 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 AC093225.1-201ENST00000506867 1408 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 ZNF624-201ENST00000311331 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 SSX5-201ENST00000311798 1384 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 HHLA1-201ENST00000414222 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
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CDH18Q13634 EEF1A1P9-201ENST00000514975 1383 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 AC119674.1-213ENST00000641177 1386 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
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CDH18Q13634 AL442071.1-201ENST00000289890 558 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 OR11H13P-201ENST00000359695 979 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 RNU11-6P-201ENST00000391127 133 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
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CDH18Q13634 CYP4F30P-202ENST00000420048 405 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
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CDH18Q13634 LINC00483-203ENST00000450727 686 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
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CDH18Q13634 AP003469.1-202ENST00000521884 478 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 TMEM68-213ENST00000522576 826 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 AC016405.1-202ENST00000524348 758 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 AP005639.1-201ENST00000526939 192 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 AC002056.2-201ENST00000532913 284 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 AC092332.1-201ENST00000563684 829 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 AC090415.2-201ENST00000584078 374 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 PRELID3BP3-201ENST00000584963 545 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 AC067852.5-201ENST00000589299 310 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 AC010320.2-201ENST00000593857 551 ntTSL 4 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 OR7A8P-201ENST00000595427 913 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 AC004801.6-201ENST00000616571 978 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 AL512652.1-201ENST00000619006 500 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 KAT7-203ENST00000435742 3638 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 KLHL2-210ENST00000538127 2907 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 GCNT2-201ENST00000265012 4214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 Z98257.1-202ENST00000431027 2493 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 CEACAM1-207ENST00000403444 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 LINC01793-201ENST00000409590 2036 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 FAM13A-AS1-201ENST00000500765 3210 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
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