Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 CEACAM1-207ENST00000403444 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
AP3M2P53677 ZNF254-207ENST00000613065 4244 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
AP3M2P53677 NFX1-201ENST00000318524 3513 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
AP3M2P53677 CFAP70-202ENST00000340329 1403 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
AP3M2P53677 C11orf1-203ENST00000529270 1437 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
AP3M2P53677 LGALSL-202ENST00000409537 3298 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
AP3M2P53677 CCDC129-211ENST00000615280 4142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
AP3M2P53677 TEX9-209ENST00000561221 2297 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
AP3M2P53677 MT4-201ENST00000219162 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
AP3M2P53677 ZCCHC6-202ENST00000375947 611 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
AP3M2P53677 DEFB126-201ENST00000382398 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
AP3M2P53677 YWHAZP6-201ENST00000399764 738 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
AP3M2P53677 AL138733.1-201ENST00000415477 853 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
AP3M2P53677 MED4-AS1-201ENST00000422483 542 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
AP3M2P53677 AC137630.2-202ENST00000429681 555 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
AP3M2P53677 AC002075.1-201ENST00000457396 676 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
AP3M2P53677 AL022319.1-201ENST00000458183 1167 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
AP3M2P53677 MARK2P8-201ENST00000476069 952 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
AP3M2P53677 MRPS22-205ENST00000478464 1065 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
AP3M2P53677 AL117692.1-201ENST00000494283 713 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
AP3M2P53677 AC018709.1-201ENST00000509111 700 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
AP3M2P53677 RNA5SP434-201ENST00000516647 121 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
AP3M2P53677 Y_RNA.710-201ENST00000516975 110 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
AP3M2P53677 LACTB2-AS1-203ENST00000518553 817 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
AP3M2P53677 OR4A40P-201ENST00000533878 948 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
AP3M2P53677 COPZ1-205ENST00000548753 778 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
AP3M2P53677 COPZ1-218ENST00000553231 551 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
AP3M2P53677 AC012050.1-201ENST00000558185 472 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
AP3M2P53677 LRRC36-205ENST00000563189 2104 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
AP3M2P53677 LINC01477-201ENST00000566101 1226 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
AP3M2P53677 AC087392.1-201ENST00000576252 820 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
AP3M2P53677 AP005136.2-201ENST00000583253 1049 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
AP3M2P53677 AC008555.7-201ENST00000605008 583 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
AP3M2P53677 AL080312.2-201ENST00000613001 630 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
AP3M2P53677 ANK2-201ENST00000264366 11775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
AP3M2P53677 VEGFD-201ENST00000297904 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
AP3M2P53677 AC130360.2-201ENST00000533477 1556 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
AP3M2P53677 MS4A7-211ENST00000534016 1378 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
AP3M2P53677 ZNF610-208ENST00000613461 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
AP3M2P53677 DCC-202ENST00000412726 9525 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
AP3M2P53677 GJA9-202ENST00000360786 1901 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
AP3M2P53677 ATP2C1-203ENST00000422190 3386 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
AP3M2P53677 ZNF283-203ENST00000588797 2428 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
AP3M2P53677 WASHC4-214ENST00000620430 5807 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
AP3M2P53677 CPS1-204ENST00000451903 4770 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
AP3M2P53677 AC090181.3-201ENST00000624777 1514 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
AP3M2P53677 SNX24-202ENST00000395451 1050 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
AP3M2P53677 RPL7P58-201ENST00000402913 758 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
AP3M2P53677 AL035422.1-201ENST00000414193 397 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
AP3M2P53677 SLC8A1-AS1-202ENST00000417875 344 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
AP3M2P53677 LINC01291-202ENST00000418204 441 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
AP3M2P53677 AL121885.3-201ENST00000422833 115 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
AP3M2P53677 TAB2-AS1-201ENST00000424421 730 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
AP3M2P53677 AC108479.1-201ENST00000431142 427 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
AP3M2P53677 AC010240.2-201ENST00000445363 1205 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
AP3M2P53677 AC093166.3-201ENST00000448785 303 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
AP3M2P53677 RPL23AP60-201ENST00000450011 454 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
AP3M2P53677 HMGB1P7-201ENST00000450921 612 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
AP3M2P53677 YRDCP3-201ENST00000456507 480 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
AP3M2P53677 AC112484.3-201ENST00000505910 329 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
AP3M2P53677 OCIAD1-216ENST00000509122 1204 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
AP3M2P53677 LINC02196-201ENST00000512838 568 ntTSL 4 BASIC6.68□□□□□ -1.34
AP3M2P53677 CYP4F27P-201ENST00000514557 494 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
AP3M2P53677 AC016405.1-202ENST00000524348 758 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
AP3M2P53677 LDHC-205ENST00000537486 583 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
AP3M2P53677 AC069208.1-201ENST00000540811 676 ntTSL 4 BASIC6.68□□□□□ -1.34
AP3M2P53677 AC009145.2-201ENST00000562685 377 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
AP3M2P53677 MIR4701-201ENST00000583094 63 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
AP3M2P53677 TRIM37-212ENST00000584889 353 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
AP3M2P53677 AL132655.1-201ENST00000601795 1153 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
AP3M2P53677 AL049840.6-201ENST00000604583 345 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
AP3M2P53677 MIR6889-201ENST00000613185 59 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
AP3M2P53677 CKLF-CMTM1-206ENST00000616804 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
AP3M2P53677 AL137067.2-201ENST00000621202 131 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
AP3M2P53677 AC111152.1-202ENST00000635848 339 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
AP3M2P53677 AL357140.4-201ENST00000636827 412 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
AP3M2P53677 OR7A1P-202ENST00000641542 1158 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
AP3M2P53677 LINC02119-201ENST00000508853 2573 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
AP3M2P53677 NCOA4P2-201ENST00000340589 1813 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
AP3M2P53677 SGO2-201ENST00000357799 4214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
AP3M2P53677 FRS2-209ENST00000550389 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
AP3M2P53677 OR14A16-202ENST00000641093 1367 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
AP3M2P53677 CDKL5-205ENST00000623535 12533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
AP3M2P53677 CLASP2-205ENST00000461133 4814 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
AP3M2P53677 ZNF521-201ENST00000361524 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
AP3M2P53677 BLOC1S2-205ENST00000614731 2634 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
AP3M2P53677 PPFIA2-219ENST00000550359 3808 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
AP3M2P53677 USP9YP3-201ENST00000434481 1766 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
AP3M2P53677 AGBL1-201ENST00000441037 3551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
AP3M2P53677 PLCZ1-201ENST00000266505 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
AP3M2P53677 ST7-204ENST00000393444 2113 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
AP3M2P53677 RFX4-203ENST00000392842 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
AP3M2P53677 CDKAL1-202ENST00000378610 3115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
AP3M2P53677 CNTN1-204ENST00000547849 3125 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
AP3M2P53677 SATB1-209ENST00000454909 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
AP3M2P53677 CDKL4-201ENST00000378803 1567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
AP3M2P53677 ZNF669-202ENST00000366500 489 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
AP3M2P53677 RN7SKP151-201ENST00000410230 316 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
AP3M2P53677 RN7SKP108-201ENST00000411367 328 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
AP3M2P53677 LINC00463-201ENST00000413501 1147 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
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