Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 RACK1-201ENST00000376817 965 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC7.72□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 CES5AP1-201ENST00000400418 859 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 CNN2P7-201ENST00000400583 932 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 AL356968.2-201ENST00000412769 1257 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 PPIAP2-201ENST00000414143 492 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 AC107079.1-201ENST00000416509 669 ntTSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 AC110995.1-202ENST00000422914 860 ntTSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 SNHG17-204ENST00000423536 517 ntTSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00160-201ENST00000430635 693 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 AC004039.1-201ENST00000431165 502 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 EIF3IP1-201ENST00000433048 967 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01884-201ENST00000433429 440 ntTSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 TRIM60P16-201ENST00000444048 694 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 AL158214.1-201ENST00000444423 404 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 AC099786.1-201ENST00000446238 670 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 AL353615.1-201ENST00000450850 390 ntTSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 AL354872.1-201ENST00000456361 967 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 ATP5J-207ENST00000457143 589 ntTSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 CDKN3-205ENST00000458126 845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SL870P-201ENST00000460111 296 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SL395P-201ENST00000462960 291 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 AC020636.1-201ENST00000469268 565 ntTSL 4 BASIC7.72□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 VN1R5-201ENST00000472952 1239 ntAPPRIS P1 BASIC7.72□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 RBM43P1-201ENST00000476891 1081 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 AC018695.1-201ENST00000484096 664 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 MYADML-203ENST00000491596 951 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SL792P-201ENST00000496286 305 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 RPL4P1-201ENST00000496596 1278 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 MYL5-205ENST00000505477 584 ntTSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 AC098859.2-201ENST00000506232 563 ntTSL 4 BASIC7.72□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 Z99943.2-201ENST00000507585 266 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01411-204ENST00000510234 938 ntTSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 AC093766.1-202ENST00000513400 718 ntTSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 AC096661.1-201ENST00000515870 822 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 AC105031.3-201ENST00000524359 616 ntTSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 OR5AK1P-201ENST00000524837 922 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 MORF4L1-205ENST00000558502 855 ntTSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 APOOP5-202ENST00000564761 566 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 MYLK-221ENST00000583087 678 ntTSL 4 BASIC7.72□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 C10orf82-203ENST00000588184 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 EDRF1-AS1-205ENST00000601363 712 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 AC068790.7-201ENST00000602347 528 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 C5orf63-208ENST00000607731 478 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 AC131902.3-201ENST00000611767 581 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 ELMO2P1-202ENST00000614283 794 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 AC239809.3-218ENST00000616018 1023 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 AC239859.6-201ENST00000622095 213 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01320-210ENST00000626008 929 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 AC005841.2-201ENST00000637658 1167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01739-205ENST00000641890 573 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 PDE4DIP-205ENST00000369354 8262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 EZH1-201ENST00000415827 4608 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 COL21A1-203ENST00000370819 4094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 C14orf2-203ENST00000553430 1659 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 AL450327.1-201ENST00000430931 2632 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 CUL4AP1-201ENST00000514750 1863 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 AC241584.2-201ENST00000637142 2090 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 SUPT20H-224ENST00000542180 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 UGT2A2-201ENST00000604021 1544 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 PGRMC2-202ENST00000394276 2858 ntTSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 DCAF4-212ENST00000553457 2896 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 DCN-220ENST00000552962 1930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 AL591379.1-201ENST00000315293 3739 ntTSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 SAG-201ENST00000409110 1591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 CTNND1-223ENST00000529986 5727 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 SETDB1-205ENST00000368969 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 USP47-203ENST00000399455 7396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 KPNA1-201ENST00000344337 6830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 SIRPB1-205ENST00000381605 3241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 DAZ4-203ENST00000382432 2405 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 DAZ2-205ENST00000382433 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 TLR6-205ENST00000610323 1443 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 FAR2P1-201ENST00000325390 3679 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00536-201ENST00000505156 2692 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 AC106712.1-201ENST00000483840 1888 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 AC008537.3-201ENST00000623128 1881 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 ANXA2-202ENST00000396024 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 OR1L1-201ENST00000309623 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.71□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 KLRG1-202ENST00000356986 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 DNAJA1P3-201ENST00000399417 1194 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 MORF4L1P1-201ENST00000404582 967 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 RPL21P107-201ENST00000411449 460 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 PLCE1-AS2-201ENST00000419353 459 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 AC023469.2-201ENST00000425983 657 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 USP9YP9-201ENST00000429406 715 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 AC007683.1-201ENST00000432746 591 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 TMX2P1-201ENST00000436507 708 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 TBL1YP1-201ENST00000440297 1026 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 RPL7P36-201ENST00000444633 681 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 AC079760.2-201ENST00000449361 681 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 FAR2P1-206ENST00000449736 709 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 VNN3-210ENST00000450865 596 ntTSL 4 BASIC7.71□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 EZR-AS1-201ENST00000451712 217 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SL854P-201ENST00000459767 295 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 AC123768.1-202ENST00000460684 461 ntTSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 RPS27P12-201ENST00000464146 258 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.2 ms