Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7L9

SUDS3, Sin3 histone deacetylase corepressor complex component SDS3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUDS3Q9H7L9 RNA5SP85-201ENST00000365378 119 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SUDS3Q9H7L9 CYP2AC1P-201ENST00000407830 1173 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SUDS3Q9H7L9 AC009965.1-201ENST00000411436 570 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SUDS3Q9H7L9 RANP6-201ENST00000413691 644 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SUDS3Q9H7L9 AC010086.1-201ENST00000437359 1052 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SUDS3Q9H7L9 RPL23AP64-201ENST00000469465 435 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SUDS3Q9H7L9 TAS2R50-201ENST00000506868 1000 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SUDS3Q9H7L9 AC092436.4-201ENST00000510905 483 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SUDS3Q9H7L9 AF235103.1-201ENST00000530223 439 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SUDS3Q9H7L9 KLRK1-204ENST00000540818 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SUDS3Q9H7L9 ASXL1-208ENST00000555343 1034 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SUDS3Q9H7L9 AL390718.1-201ENST00000566904 506 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SUDS3Q9H7L9 AP003115.1-201ENST00000569849 463 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SUDS3Q9H7L9 AC135178.4-201ENST00000585275 548 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SUDS3Q9H7L9 AC005180.2-201ENST00000585620 562 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SUDS3Q9H7L9 LIPF-205ENST00000608620 1290 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SUDS3Q9H7L9 GAPDHP41-201ENST00000613707 975 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SUDS3Q9H7L9 SOX9-AS1-218ENST00000628742 733 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SUDS3Q9H7L9 GCNT2-201ENST00000265012 4214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SUDS3Q9H7L9 NRDE2-201ENST00000354366 14208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SUDS3Q9H7L9 UPRT-207ENST00000530743 1636 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SUDS3Q9H7L9 SLC1A2-203ENST00000395753 11689 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SUDS3Q9H7L9 FBXO38-218ENST00000513826 3585 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SUDS3Q9H7L9 TENM1-202ENST00000422452 12891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SUDS3Q9H7L9 SEPT7-AS1-203ENST00000437235 3810 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SUDS3Q9H7L9 NUP210L-201ENST00000271854 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SUDS3Q9H7L9 DTNA-230ENST00000598334 3201 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SUDS3Q9H7L9 IFRD1-217ENST00000621379 3232 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SUDS3Q9H7L9 GPATCH11-201ENST00000281932 3570 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SUDS3Q9H7L9 AC006511.3-201ENST00000624929 1783 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SUDS3Q9H7L9 SULT1C2-205ENST00000437390 1359 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SUDS3Q9H7L9 RFX3-204ENST00000382004 9307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SUDS3Q9H7L9 RFX4-203ENST00000392842 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SUDS3Q9H7L9 ADAMTS9-AS2-203ENST00000481312 1970 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SUDS3Q9H7L9 VNN3-203ENST00000392393 1603 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SUDS3Q9H7L9 ENTPD1-AS1-202ENST00000416301 4241 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SUDS3Q9H7L9 ADAM29-203ENST00000445694 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SUDS3Q9H7L9 CSMD1-215ENST00000537824 13512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SUDS3Q9H7L9 AC015971.1-203ENST00000426549 1948 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SUDS3Q9H7L9 RNU1-46P-201ENST00000384425 164 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SUDS3Q9H7L9 AL451046.1-201ENST00000406097 534 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SUDS3Q9H7L9 OR2A2-201ENST00000408979 1051 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SUDS3Q9H7L9 RPL6-202ENST00000424576 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SUDS3Q9H7L9 LINC00352-201ENST00000425800 552 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SUDS3Q9H7L9 HSPE1P27-201ENST00000430808 296 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SUDS3Q9H7L9 AL133465.1-201ENST00000432942 512 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SUDS3Q9H7L9 LINC00328-2P-201ENST00000436585 219 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SUDS3Q9H7L9 TMEM244-202ENST00000438392 565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SUDS3Q9H7L9 GAPDHP33-201ENST00000443168 1013 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SUDS3Q9H7L9 AC095033.1-201ENST00000451611 1096 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SUDS3Q9H7L9 SEPT7P3-201ENST00000455017 621 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SUDS3Q9H7L9 AL035443.1-201ENST00000456631 304 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SUDS3Q9H7L9 RN7SL393P-201ENST00000463588 296 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SUDS3Q9H7L9 AC005165.2-201ENST00000466070 380 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SUDS3Q9H7L9 C21orf62-202ENST00000479548 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SUDS3Q9H7L9 RN7SL741P-201ENST00000482473 289 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SUDS3Q9H7L9 AC005699.1-204ENST00000509244 747 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SUDS3Q9H7L9 AC083906.1-201ENST00000509298 406 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SUDS3Q9H7L9 LINC02055-205ENST00000521090 774 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SUDS3Q9H7L9 IGLV3-6-201ENST00000523937 250 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SUDS3Q9H7L9 OR52K3P-201ENST00000531655 943 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SUDS3Q9H7L9 TMEM126B-211ENST00000534341 1273 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SUDS3Q9H7L9 AC078778.2-201ENST00000553061 567 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SUDS3Q9H7L9 AC087721.1-201ENST00000559959 476 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SUDS3Q9H7L9 ADAMTS7P4-205ENST00000560651 453 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SUDS3Q9H7L9 AC023813.1-201ENST00000565055 306 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SUDS3Q9H7L9 AC245052.7-201ENST00000601161 359 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SUDS3Q9H7L9 NDUFB9P1-201ENST00000604683 510 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SUDS3Q9H7L9 HNRNPA3P9-201ENST00000604913 979 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SUDS3Q9H7L9 AC005828.7-201ENST00000607331 556 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SUDS3Q9H7L9 OR51C1P-201ENST00000608504 942 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SUDS3Q9H7L9 Metazoa_SRP.77-201ENST00000616915 252 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SUDS3Q9H7L9 Metazoa_SRP.81-201ENST00000618466 316 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SUDS3Q9H7L9 RAB28P4-201ENST00000622233 665 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SUDS3Q9H7L9 TEX41-255ENST00000626404 610 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SUDS3Q9H7L9 GYPA-212ENST00000616983 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SUDS3Q9H7L9 MYBPC1-223ENST00000553190 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SUDS3Q9H7L9 MEIOC-202ENST00000409464 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SUDS3Q9H7L9 KLHL13-202ENST00000371876 5331 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SUDS3Q9H7L9 C4orf26-201ENST00000311623 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SUDS3Q9H7L9 ZNF300P1-202ENST00000520773 3115 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SUDS3Q9H7L9 STON1-201ENST00000404752 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SUDS3Q9H7L9 AC099654.3-201ENST00000447087 1546 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SUDS3Q9H7L9 GBP1-201ENST00000370473 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SUDS3Q9H7L9 DSC3-201ENST00000360428 6939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SUDS3Q9H7L9 AC217777.1-201ENST00000570034 1471 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
SUDS3Q9H7L9 LINC02119-201ENST00000508853 2573 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
SUDS3Q9H7L9 RAB3B-201ENST00000371655 12844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
SUDS3Q9H7L9 TNRC6B-201ENST00000301923 15958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
SUDS3Q9H7L9 PTK2-213ENST00000519465 3279 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
SUDS3Q9H7L9 AP002370.1-201ENST00000528055 1602 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
SUDS3Q9H7L9 ZNF283-203ENST00000588797 2428 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
SUDS3Q9H7L9 DDAH1-204ENST00000535924 3909 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
SUDS3Q9H7L9 CCL2-201ENST00000225831 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
SUDS3Q9H7L9 PPIAP24-201ENST00000328558 471 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
SUDS3Q9H7L9 OR51J1-201ENST00000332043 951 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
SUDS3Q9H7L9 FCGR1B-202ENST00000369383 570 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
SUDS3Q9H7L9 ZNF385D-AS1-201ENST00000412369 705 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
SUDS3Q9H7L9 NR1I3-208ENST00000412844 989 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
SUDS3Q9H7L9 CPB2-AS1-201ENST00000415033 747 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
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