Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 RNA5SP350-201ENST00000363298 111 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 RN7SKP59-201ENST00000410520 314 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 Z98742.1-201ENST00000419801 632 ntTSL 3 BASIC9.15□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 AC009498.1-201ENST00000419860 541 ntTSL 4 BASIC9.15□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 Z84478.1-201ENST00000438230 1219 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 GMFG-212ENST00000602185 423 ntTSL 3 BASIC9.15□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 SUMO2P15-201ENST00000604285 278 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 AC020765.1-201ENST00000604296 328 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 ASNSD1-209ENST00000607829 581 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 PDE10A-203ENST00000539869 4401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 KAT6B-205ENST00000372725 6944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 DNAH10-201ENST00000409039 14473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 ADGRB3-202ENST00000370598 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 AMD1-203ENST00000368882 3059 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 SETDB1-205ENST00000368969 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 DIAPH3-206ENST00000465066 2735 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 SUPT6H-201ENST00000314616 6523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 AP001636.3-201ENST00000533954 2810 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 XIAP-202ENST00000371199 8591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 U3.7-201ENST00000363668 216 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 RNA5SP30-201ENST00000365552 115 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 TEX36-201ENST00000368821 922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 C6orf48-208ENST00000395788 815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 AL357752.1-201ENST00000412817 349 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 AL139280.1-201ENST00000436340 463 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 AC105021.1-201ENST00000455347 590 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 OARD1-211ENST00000480585 829 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 LINC02006-201ENST00000488210 524 ntTSL 4 BASIC9.14□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 AC109361.2-202ENST00000512514 483 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 TRDV3-201ENST00000535880 425 ntAPPRIS P1 BASIC9.14□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 AC007494.1-201ENST00000562293 760 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 OR7A1P-201ENST00000601206 970 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 AL355916.1-202ENST00000508827 5103 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 ORC4-215ENST00000536575 6328 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 AC123769.1-201ENST00000530992 3192 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 TAF1-201ENST00000276072 5692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 HP1BP3-201ENST00000312239 3938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 AL590763.1-201ENST00000398297 1545 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 POLR1B-203ENST00000409894 4457 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 CCR2-201ENST00000292301 2671 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 SRRM1P3-201ENST00000426911 2678 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 GRIN2A-205ENST00000535259 4118 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 RAD17P2-201ENST00000451754 1977 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 CHD2-215ENST00000628375 3202 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 GIGYF2-205ENST00000409547 5978 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 Z83820.1-201ENST00000456978 1499 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 FAM32BP-201ENST00000344033 333 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 LEMD1-203ENST00000367152 741 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 C1orf194-203ENST00000369948 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 MIR130A-201ENST00000385274 89 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 AL139008.2-201ENST00000420315 395 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 MKLN1-204ENST00000429546 572 ntTSL 4 BASIC9.14□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 AL096678.1-201ENST00000438877 472 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 OR13K1P-201ENST00000444577 975 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 PHC3-208ENST00000481639 1075 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 RN7SL466P-201ENST00000497546 295 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 RNA5SP34-201ENST00000516887 130 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 AC139365.2-201ENST00000517972 253 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 AC134775.1-201ENST00000531268 464 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 AC004948.1-201ENST00000609858 672 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 AL355306.2-206ENST00000635233 1903 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 PKD1L1-201ENST00000289672 9092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 HAT1-201ENST00000264108 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 AL121768.1-201ENST00000613917 2544 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 COL6A4P1-202ENST00000487147 4317 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 KIF20A-205ENST00000508792 2935 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 FGD4-202ENST00000427716 8242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 CARD8-202ENST00000391898 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 AL080276.2-201ENST00000637995 2090 ntTSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 RPL39P5-201ENST00000273411 449 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 RNA5SP131-201ENST00000365452 119 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 AC016769.2-201ENST00000414815 475 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 AC004990.1-201ENST00000431722 564 ntTSL 4 BASIC9.13□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 AC006335.2-201ENST00000437993 330 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 EIF3LP3-201ENST00000495197 822 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 AC124893.1-201ENST00000496247 545 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 DUTP7-201ENST00000507982 486 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 UBA52-209ENST00000597451 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 PPATP2-201ENST00000605635 508 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 AC004808.2-201ENST00000627965 773 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 TEP1-201ENST00000262715 10695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 YES1P1-201ENST00000418510 1628 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 AL359922.2-201ENST00000581788 3017 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 MYOM1-202ENST00000356443 5847 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 BCLAF3-203ENST00000379687 6528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 ZNF605-202ENST00000360187 9340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 PCDH19-201ENST00000255531 7937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 TM9SF4-202ENST00000398022 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 ADGRL3-213ENST00000509896 5069 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 ARHGAP32-202ENST00000392657 6556 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 C5orf24-201ENST00000338051 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 WDYHV1-208ENST00000523984 1491 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 VTA1-202ENST00000367630 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 AL159987.1-201ENST00000347911 293 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 RNA5SP333-201ENST00000363466 118 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 RNA5SP334-201ENST00000364825 118 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 SLC3A1-203ENST00000409294 792 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 LINC01952-202ENST00000450016 281 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 RPS26P41-201ENST00000450370 284 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
LRRIQ1Q96JM4 AL133445.1-201ENST00000467051 452 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.1 ms