Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 CEACAM1-203ENST00000352591 3170 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
COL24A1Q17RW2 CTNND1-221ENST00000529873 5931 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
COL24A1Q17RW2 CTNND1-227ENST00000530748 5925 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
COL24A1Q17RW2 HAUS3-201ENST00000243706 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
COL24A1Q17RW2 AC092692.1-201ENST00000623625 2595 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
COL24A1Q17RW2 TEX41-210ENST00000451774 2098 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
COL24A1Q17RW2 CAPRIN1-209ENST00000530820 3454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
COL24A1Q17RW2 MUSK-206ENST00000416899 3344 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
COL24A1Q17RW2 AC096582.3-201ENST00000636578 3716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
COL24A1Q17RW2 OR2A5-202ENST00000641693 8681 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
COL24A1Q17RW2 LY75-201ENST00000263636 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
COL24A1Q17RW2 RPS15AP30-201ENST00000420976 390 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
COL24A1Q17RW2 AC004990.1-201ENST00000431722 564 ntTSL 4 BASIC7.59□□□□□ -1.19
COL24A1Q17RW2 RPS27AP3-201ENST00000453803 454 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
COL24A1Q17RW2 RN7SL583P-201ENST00000475692 287 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
COL24A1Q17RW2 RN7SL184P-201ENST00000488308 297 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
COL24A1Q17RW2 AC139720.1-201ENST00000509497 512 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
COL24A1Q17RW2 RNA5SP400-201ENST00000517155 111 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
COL24A1Q17RW2 SNORA43.3-201ENST00000517240 103 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
COL24A1Q17RW2 LINC02451-201ENST00000546982 565 ntTSL 4 BASIC7.59□□□□□ -1.19
COL24A1Q17RW2 AC090457.1-201ENST00000579775 211 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
COL24A1Q17RW2 ELOCP28-201ENST00000590044 317 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
COL24A1Q17RW2 AL121612.2-201ENST00000612261 482 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
COL24A1Q17RW2 NADK2-211ENST00000617628 744 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
COL24A1Q17RW2 SETDB1-205ENST00000368969 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
COL24A1Q17RW2 AC105235.1-201ENST00000623208 1816 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
COL24A1Q17RW2 ARMC8-210ENST00000469044 4790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
COL24A1Q17RW2 JADE1-203ENST00000452328 5544 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
COL24A1Q17RW2 NAT1-209ENST00000541942 1948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
COL24A1Q17RW2 PARN-201ENST00000341484 2100 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
COL24A1Q17RW2 PTPRO-208ENST00000542557 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
COL24A1Q17RW2 NLRP8-201ENST00000291971 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
COL24A1Q17RW2 API5-210ENST00000534600 1760 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
COL24A1Q17RW2 CELF2-209ENST00000631460 5538 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
COL24A1Q17RW2 AC024587.1-201ENST00000505925 2157 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
COL24A1Q17RW2 NRXN1-211ENST00000406859 2553 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
COL24A1Q17RW2 TMC5-201ENST00000219821 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
COL24A1Q17RW2 KIF4A-201ENST00000374403 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
COL24A1Q17RW2 LINC02092-201ENST00000455366 2472 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
COL24A1Q17RW2 ZNF253-201ENST00000355650 2268 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
COL24A1Q17RW2 PMFBP1-202ENST00000355636 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
COL24A1Q17RW2 FAS-205ENST00000357339 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
COL24A1Q17RW2 U8.4-201ENST00000363626 134 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
COL24A1Q17RW2 AL807761.1-201ENST00000417622 171 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
COL24A1Q17RW2 AC068491.2-201ENST00000438897 617 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
COL24A1Q17RW2 AL137076.1-201ENST00000441046 551 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
COL24A1Q17RW2 CUBNP2-201ENST00000443534 1139 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
COL24A1Q17RW2 CASP12-208ENST00000448103 1071 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
COL24A1Q17RW2 AL445238.1-201ENST00000450029 712 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
COL24A1Q17RW2 AL606490.1-201ENST00000452266 765 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
COL24A1Q17RW2 AL645937.3-201ENST00000453647 936 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
COL24A1Q17RW2 AC004692.2-203ENST00000458590 497 ntTSL 4 BASIC7.58□□□□□ -1.2
COL24A1Q17RW2 AL157777.1-201ENST00000468100 304 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
COL24A1Q17RW2 OR7E157P-201ENST00000494376 911 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
COL24A1Q17RW2 CASP12-210ENST00000494737 961 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
COL24A1Q17RW2 RN7SL808P-201ENST00000496066 299 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
COL24A1Q17RW2 MORF4L1-205ENST00000558502 855 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
COL24A1Q17RW2 AC074050.3-201ENST00000569175 441 ntTSL 4 BASIC7.58□□□□□ -1.2
COL24A1Q17RW2 AC141002.1-201ENST00000607025 279 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
COL24A1Q17RW2 AL021918.2-201ENST00000613415 194 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
COL24A1Q17RW2 AC007683.2-201ENST00000624681 714 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
COL24A1Q17RW2 FANCI-201ENST00000300027 4713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
COL24A1Q17RW2 AL080317.3-201ENST00000607434 4315 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
COL24A1Q17RW2 TCF12-214ENST00000559710 1314 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
COL24A1Q17RW2 MFSD4BP1-201ENST00000513330 1552 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
COL24A1Q17RW2 FOXP1-212ENST00000491238 2250 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
COL24A1Q17RW2 CASC19-248ENST00000641674 1356 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
COL24A1Q17RW2 SCAF11-212ENST00000549162 3934 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
COL24A1Q17RW2 SYT14-207ENST00000629778 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
COL24A1Q17RW2 ANGPTL5-201ENST00000334289 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
COL24A1Q17RW2 EXOC5-211ENST00000621441 10589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
COL24A1Q17RW2 GPX8-201ENST00000296734 3245 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
COL24A1Q17RW2 OR4K5-201ENST00000315915 1078 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
COL24A1Q17RW2 CAV1-204ENST00000393470 598 ntTSL 4 BASIC7.58□□□□□ -1.2
COL24A1Q17RW2 NT5C3A-206ENST00000409787 840 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
COL24A1Q17RW2 AL139415.1-201ENST00000424862 352 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
COL24A1Q17RW2 VN1R54P-201ENST00000435210 1049 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
COL24A1Q17RW2 AC108066.1-201ENST00000437261 596 ntTSL 4 BASIC7.58□□□□□ -1.2
COL24A1Q17RW2 RPS21P4-201ENST00000487122 248 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
COL24A1Q17RW2 AC034238.3-201ENST00000512349 591 ntTSL 4 BASIC7.58□□□□□ -1.2
COL24A1Q17RW2 CDC42P3-201ENST00000518493 633 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
COL24A1Q17RW2 IGBP1P1-201ENST00000554337 1009 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
COL24A1Q17RW2 OR51F2-202ENST00000641672 1136 ntAPPRIS P2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
COL24A1Q17RW2 AP000866.6-201ENST00000638898 3579 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
COL24A1Q17RW2 TAF1-201ENST00000276072 5692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
COL24A1Q17RW2 ZNF521-214ENST00000584787 4327 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
COL24A1Q17RW2 CTNNA1P1-201ENST00000515849 2728 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
COL24A1Q17RW2 PKP4-202ENST00000389759 4443 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
COL24A1Q17RW2 DDI2-202ENST00000480945 10625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
COL24A1Q17RW2 B3GALT1-201ENST00000392690 5094 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
COL24A1Q17RW2 SPATS2L-227ENST00000619961 6115 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
COL24A1Q17RW2 CSDE1-201ENST00000261443 3228 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
COL24A1Q17RW2 SPINK5-201ENST00000256084 3535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
COL24A1Q17RW2 RAD18-201ENST00000264926 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
COL24A1Q17RW2 SAMD3-204ENST00000439090 2093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
COL24A1Q17RW2 BMPR1A-201ENST00000372037 11255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
COL24A1Q17RW2 ZNF782-208ENST00000535338 3296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
COL24A1Q17RW2 AL139805.2-201ENST00000455305 2433 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
COL24A1Q17RW2 HEPH-202ENST00000343002 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
COL24A1Q17RW2 TRIQK-214ENST00000521988 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.2 ms