Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 CKLF-CMTM1-206ENST00000616804 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 MIR6729-201ENST00000618194 65 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 LINC01955-201ENST00000626392 792 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 UOX-205ENST00000640983 544 ntTSL 4 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 OR7A1P-202ENST00000641542 1158 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 LRBA-201ENST00000357115 9899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 LINC00702-203ENST00000608792 6300 ntTSL 4 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 TCF7L2-220ENST00000543371 4037 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 LINC01043-201ENST00000565936 6897 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 PRICKLE1-202ENST00000445766 4075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 LRRC37A16P-202ENST00000586022 3725 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 EIF3EP1-201ENST00000433978 1316 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 LINC00102-201ENST00000445785 1340 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 NBPF12-205ENST00000617614 4630 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 PIGN-220ENST00000638167 4195 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 ABCB5-203ENST00000406935 1483 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 NUP93-202ENST00000542526 8257 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 ZNF542P-202ENST00000467807 3209 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 ARL6-204ENST00000463745 4231 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 ATXN2-202ENST00000389153 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 AL627309.5-201ENST00000484859 4860 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 LGSN-204ENST00000622415 1612 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 NUP210L-201ENST00000271854 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 ESRRG-203ENST00000361395 5216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 ESRRG-209ENST00000408911 5216 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 ANAPC10-201ENST00000309439 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 OR52B6-201ENST00000345043 1008 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 SNORA43.1-201ENST00000364863 140 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 OR2W1-201ENST00000377175 1028 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 GSTM2-205ENST00000414179 982 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 RPL6P30-201ENST00000443382 862 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 OR13K1P-201ENST00000444577 975 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 AL122019.1-202ENST00000458070 546 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 RPL36A-206ENST00000471855 399 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 OR7E99P-201ENST00000505750 922 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 LINC02512-201ENST00000509548 429 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 MGC32805-204ENST00000509993 783 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 AC027343.2-201ENST00000513219 343 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 AC008705.1-201ENST00000518837 489 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 AC027369.2-201ENST00000528030 440 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 RPL36A-209ENST00000553110 429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 AC024361.3-201ENST00000570919 333 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 LINC01908-201ENST00000583148 555 ntTSL 4 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 TRIM37-212ENST00000584889 353 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 AC008543.3-201ENST00000586983 491 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 TEX41-218ENST00000596540 882 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 Z98949.1-210ENST00000597548 766 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 AL021368.3-201ENST00000607119 578 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 LINC02362-201ENST00000608785 516 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 AC092681.3-201ENST00000609463 678 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 LINC02362-202ENST00000610683 724 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 Metazoa_SRP.94-201ENST00000612609 250 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 AL096712.1-201ENST00000614561 159 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 SNX18P12-201ENST00000624821 759 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 AL391117.1-201ENST00000640003 1186 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 LARP7-210ENST00000509061 2332 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 HSDL2-201ENST00000398803 2983 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 NAV3-202ENST00000536525 7386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 ZNF107-201ENST00000344930 5174 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 AC011416.1-201ENST00000514947 1732 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 AOX3P-204ENST00000491025 2107 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 AL589993.1-201ENST00000407450 2524 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 CHN1-201ENST00000295497 2047 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 SEC61A2-202ENST00000304267 2030 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 CAST-202ENST00000325674 3356 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 KIAA0040-206ENST00000619513 4340 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 TBC1D15-201ENST00000319106 2159 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 OSBPL9-203ENST00000428468 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 CHD6-202ENST00000373222 2477 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 AC096921.2-201ENST00000561507 1916 ntBASIC6.21□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 AC119674.1-213ENST00000641177 1386 ntBASIC6.21□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 FOCAD-202ENST00000380249 6096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 BLOC1S2-205ENST00000614731 2634 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 MLLT10-217ENST00000631589 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 MEPE-209ENST00000560249 2206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 LINC01748-203ENST00000634836 3229 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 LINC01920-201ENST00000441356 2528 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 MT4-201ENST00000219162 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 ELOC-201ENST00000284811 683 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 TAF13-201ENST00000338366 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 MDGA2-201ENST00000357362 2965 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 SNORD8-201ENST00000363915 110 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 RN7SKP78-201ENST00000364711 318 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 TRAV8-4-201ENST00000390438 469 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 AC000058.1-201ENST00000415249 536 ntTSL 4 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 LINC00310-202ENST00000419881 910 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 MS4A6A-202ENST00000420732 863 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 AL031186.1-201ENST00000433125 385 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 LINC00483-204ENST00000502517 940 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 LINC02196-201ENST00000512838 568 ntTSL 4 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 Y_RNA.710-201ENST00000516975 110 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 IGLVIV-64-201ENST00000518581 301 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 OR4A40P-201ENST00000533878 948 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 TSSK4-207ENST00000556621 896 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 LINC01476-202ENST00000584262 635 ntTSL 4 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 LINC00907-202ENST00000585639 915 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 AP001823.1-201ENST00000604056 1003 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 AP001885.1-201ENST00000621658 558 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 EXPH5-203ENST00000525344 6542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 BDNF-203ENST00000395978 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
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