Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 PRH1-204ENST00000539853 837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 AC116158.2-201ENST00000559544 553 ntTSL 4 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 AC010266.1-201ENST00000568962 442 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 RN7SL208P-201ENST00000577964 296 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 TVP23B-209ENST00000581733 1258 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 AC119868.1-202ENST00000584741 347 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 AC005856.1-201ENST00000585921 286 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 AC020914.2-201ENST00000598220 430 ntTSL 4 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 AC247036.1-201ENST00000605005 389 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 AC116165.3-201ENST00000614524 400 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 RNASE11-211ENST00000620912 883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 AC244517.6-202ENST00000623884 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 MBD5-221ENST00000637159 902 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 EXD1-201ENST00000314992 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 CUBN-202ENST00000377833 11949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 AC079601.1-201ENST00000547824 2791 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 CSMD1-215ENST00000537824 13512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 MECOM-201ENST00000264674 4900 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 SLC35A5-201ENST00000261034 2444 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 CX3CR1-201ENST00000358309 3151 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 SLCO1C1-207ENST00000540354 2529 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 CNGA1-207ENST00000514170 2837 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 TBC1D23-202ENST00000394144 3677 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 PNISR-202ENST00000438806 3142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 LINC02141-201ENST00000568279 6586 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 AC023245.2-201ENST00000530760 2978 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 NBPF26-201ENST00000609741 3671 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 ORC4-214ENST00000535373 6710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 RPS29-201ENST00000245458 296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 GSTA5-201ENST00000284562 845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 OR1Q1-201ENST00000297913 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 OR5B2-201ENST00000302581 1049 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 OR2M4-201ENST00000306687 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 RNU1-5P-201ENST00000362684 144 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 TP63-205ENST00000392461 1251 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 CCL7-202ENST00000394627 696 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 MORN2-202ENST00000409077 465 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 AL035401.1-201ENST00000420572 871 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 IGKV3OR2-268-201ENST00000421835 350 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 RPL23AP85-201ENST00000421838 433 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 VN1R53P-201ENST00000429536 957 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 AC079117.1-201ENST00000445178 1000 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 MTND4LP12-201ENST00000448237 295 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 RN7SL655P-201ENST00000486087 298 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 AC093801.1-201ENST00000504017 307 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 AC013724.1-201ENST00000511962 783 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 AP002498.1-201ENST00000530190 568 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 AC005519.1-201ENST00000554490 601 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 AC010809.1-201ENST00000560268 562 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 AC010531.4-201ENST00000570286 576 ntTSL 4 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 AC019322.1-201ENST00000571869 389 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 AC023389.2-201ENST00000580031 955 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 AC015911.2-201ENST00000585536 396 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 AC005757.1-201ENST00000591432 472 ntTSL 4 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 MIR6070-201ENST00000613967 103 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 AL445649.1-201ENST00000615941 691 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 MALAT1-209ENST00000616691 587 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 CDKN2B-AS_3.1-201ENST00000617587 144 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 AC091059.2-201ENST00000623355 614 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 AC073488.9-201ENST00000631601 754 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 MAP3K19-206ENST00000392918 1460 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 VWC2L-201ENST00000312504 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 AGO2-201ENST00000220592 14581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 BABAM2-206ENST00000379632 1752 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 AL355488.2-201ENST00000609909 2850 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 LRRC37B-204ENST00000543378 3091 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 CDKAL1-201ENST00000274695 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 C16orf62-204ENST00000448695 3353 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 C16orf62-216ENST00000543152 3352 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 NOS1-201ENST00000317775 12158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 SLC1A3-215ENST00000612708 3832 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 AC009804.2-201ENST00000637566 3032 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 RFX3-204ENST00000382004 9307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 PSG9-202ENST00000270077 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 CABS1-201ENST00000273936 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 PPFIBP1-201ENST00000228425 5933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 ZNF605-204ENST00000392321 6156 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 LINC01277-201ENST00000419957 2398 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 MPDZ-208ENST00000447879 6262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 TTC21B-201ENST00000243344 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 ROR1-204ENST00000545203 5362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 MAPK10-338ENST00000641647 3362 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 AC021092.1-201ENST00000592946 3199 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 OR4D5-201ENST00000307033 1095 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 IMPA1-202ENST00000311489 1106 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 AC010894.1-201ENST00000313760 361 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 SULT1C3-201ENST00000329106 915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 CAV1-204ENST00000393470 598 ntTSL 4 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 RPL5P20-201ENST00000403848 896 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 OR52N3P-201ENST00000413417 934 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 RANP6-201ENST00000413691 644 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 AL137847.1-201ENST00000416473 444 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 AL589794.1-201ENST00000424971 390 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 AL606534.4-201ENST00000427176 792 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 AL139220.2-214ENST00000437643 614 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 AL022237.1-201ENST00000446663 358 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 MID1-209ENST00000453318 6393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 AKR1D1P1-201ENST00000457236 936 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 AC018980.1-201ENST00000457848 862 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 AC104233.1-201ENST00000458107 339 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
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