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| MTMR3 | Q13615 | VEZF1P1-201 | ENST00000423931 | 1541 nt | BASIC | 8.05 | □□□□□ -1.12 | | |
| MTMR3 | Q13615 | ZMYND11-215 | ENST00000558098 | 1859 nt | TSL 1 (best) BASIC | 8.05 | □□□□□ -1.12 | | |
| MTMR3 | Q13615 | INTS2-207 | ENST00000617492 | 5805 nt | TSL 5 BASIC | 8.05 | □□□□□ -1.12 | | |
| MTMR3 | Q13615 | MPEG1-201 | ENST00000361050 | 4442 nt | APPRIS P1 BASIC | 8.05 | □□□□□ -1.12 | | |
| MTMR3 | Q13615 | USPL1-201 | ENST00000255304 | 3814 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 8.05 | □□□□□ -1.12 | | |
| MTMR3 | Q13615 | RNU4-4P-201 | ENST00000364588 | 130 nt | BASIC | 8.05 | □□□□□ -1.12 | | |
| MTMR3 | Q13615 | RNU6-413P-201 | ENST00000384115 | 107 nt | BASIC | 8.05 | □□□□□ -1.12 | | |
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| MTMR3 | Q13615 | AC019178.2-201 | ENST00000423595 | 505 nt | BASIC | 8.05 | □□□□□ -1.12 | | |
| MTMR3 | Q13615 | BACH1-IT3-201 | ENST00000429843 | 406 nt | TSL 2 BASIC | 8.05 | □□□□□ -1.12 | | |
| MTMR3 | Q13615 | LINC02476-202 | ENST00000431071 | 559 nt | TSL 4 BASIC | 8.05 | □□□□□ -1.12 | | |
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| MTMR3 | Q13615 | AC023512.1-201 | ENST00000444513 | 499 nt | BASIC | 8.05 | □□□□□ -1.12 | | |
| MTMR3 | Q13615 | AC007327.1-201 | ENST00000447461 | 264 nt | BASIC | 8.05 | □□□□□ -1.12 | | |
| MTMR3 | Q13615 | AL731661.2-201 | ENST00000448824 | 806 nt | TSL 1 (best) BASIC | 8.05 | □□□□□ -1.12 | | |
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| MTMR3 | Q13615 | AC026348.1-201 | ENST00000462549 | 1053 nt | BASIC | 8.05 | □□□□□ -1.12 | | |
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| MTMR3 | Q13615 | AC073571.1-201 | ENST00000549103 | 475 nt | TSL 3 BASIC | 8.05 | □□□□□ -1.12 | | |
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| MTMR3 | Q13615 | NPIPA2-203 | ENST00000553201 | 1053 nt | TSL 1 (best) BASIC | 8.05 | □□□□□ -1.12 | | |
| MTMR3 | Q13615 | AL121839.1-201 | ENST00000556233 | 1185 nt | BASIC | 8.05 | □□□□□ -1.12 | | |
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| MTMR3 | Q13615 | AC023813.3-201 | ENST00000561876 | 539 nt | TSL 3 BASIC | 8.05 | □□□□□ -1.12 | | |
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| MTMR3 | Q13615 | ZNF561-AS1-208 | ENST00000592851 | 782 nt | TSL 3 BASIC | 8.05 | □□□□□ -1.12 | | |
| MTMR3 | Q13615 | AP005328.2-201 | ENST00000606879 | 657 nt | TSL 3 BASIC | 8.05 | □□□□□ -1.12 | | |
| MTMR3 | Q13615 | OR2BH1P-201 | ENST00000608850 | 864 nt | BASIC | 8.05 | □□□□□ -1.12 | | |
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| MTMR3 | Q13615 | RPSAP68-201 | ENST00000625020 | 438 nt | BASIC | 8.05 | □□□□□ -1.12 | | |
| MTMR3 | Q13615 | AC006453.3-201 | ENST00000635891 | 377 nt | BASIC | 8.05 | □□□□□ -1.12 | | |
| MTMR3 | Q13615 | TMEM132B-206 | ENST00000613307 | 9659 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 8.05 | □□□□□ -1.12 | | |
| MTMR3 | Q13615 | MBTPS2-201 | ENST00000365779 | 4457 nt | TSL 1 (best) BASIC | 8.05 | □□□□□ -1.12 | | |
| MTMR3 | Q13615 | ZNF480-201 | ENST00000334564 | 1843 nt | APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC | 8.05 | □□□□□ -1.12 | | |
| MTMR3 | Q13615 | SAR1A-206 | ENST00000431664 | 2810 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 8.05 | □□□□□ -1.12 | | |
| MTMR3 | Q13615 | NACAP1-201 | ENST00000419462 | 1555 nt | TSL 2 BASIC | 8.05 | □□□□□ -1.12 | | |
| MTMR3 | Q13615 | AL390726.6-201 | ENST00000637760 | 1654 nt | TSL 5 BASIC | 8.05 | □□□□□ -1.12 | | |
| MTMR3 | Q13615 | RASSF9-201 | ENST00000361228 | 5682 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 8.05 | □□□□□ -1.12 | | |
| MTMR3 | Q13615 | OR7D2-201 | ENST00000344248 | 3224 nt | APPRIS P1 BASIC | 8.05 | □□□□□ -1.12 | | |
| MTMR3 | Q13615 | ZNF385B-202 | ENST00000409343 | 2750 nt | TSL 2 BASIC | 8.05 | □□□□□ -1.12 | | |
| MTMR3 | Q13615 | CASP12-201 | ENST00000375726 | 1306 nt | APPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC | 8.04 | □□□□□ -1.12 | | |
| MTMR3 | Q13615 | CTNND1-216 | ENST00000527467 | 5071 nt | TSL 1 (best) BASIC | 8.04 | □□□□□ -1.12 | | |
| MTMR3 | Q13615 | CTNND1-229 | ENST00000531014 | 5053 nt | TSL 1 (best) BASIC | 8.04 | □□□□□ -1.12 | | |
| MTMR3 | Q13615 | SLC6A16-202 | ENST00000454748 | 2983 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 8.04 | □□□□□ -1.12 | | |
| MTMR3 | Q13615 | ZNF81-204 | ENST00000376954 | 7933 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 8.04 | □□□□□ -1.12 | | |
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| MTMR3 | Q13615 | CARD8-202 | ENST00000391898 | 5263 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 8.04 | □□□□□ -1.12 | | |
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| MTMR3 | Q13615 | MOB4-205 | ENST00000409916 | 829 nt | TSL 3 BASIC | 8.04 | □□□□□ -1.12 | | |
| MTMR3 | Q13615 | GRM7-AS3-202 | ENST00000417482 | 454 nt | TSL 3 BASIC | 8.04 | □□□□□ -1.12 | | |
| MTMR3 | Q13615 | AC009500.1-201 | ENST00000420684 | 583 nt | BASIC | 8.04 | □□□□□ -1.12 | | |
| MTMR3 | Q13615 | SNX19-202 | ENST00000426933 | 888 nt | TSL 2 BASIC | 8.04 | □□□□□ -1.12 | | |
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| MTMR3 | Q13615 | AL604028.2-201 | ENST00000437848 | 788 nt | BASIC | 8.04 | □□□□□ -1.12 | | |
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| MTMR3 | Q13615 | AC083864.2-201 | ENST00000446024 | 482 nt | TSL 3 BASIC | 8.04 | □□□□□ -1.12 | | |
| MTMR3 | Q13615 | MTND2P19-201 | ENST00000449129 | 1012 nt | BASIC | 8.04 | □□□□□ -1.12 | | |
| MTMR3 | Q13615 | AC108868.2-201 | ENST00000451464 | 511 nt | TSL 2 BASIC | 8.04 | □□□□□ -1.12 | | |
| MTMR3 | Q13615 | ENTPD3-AS1-204 | ENST00000452768 | 724 nt | TSL 2 BASIC | 8.04 | □□□□□ -1.12 | | |
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| MTMR3 | Q13615 | AL355997.1-202 | ENST00000454361 | 610 nt | TSL 3 BASIC | 8.04 | □□□□□ -1.12 | | |
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| MTMR3 | Q13615 | AL391863.1-202 | ENST00000457427 | 612 nt | TSL 5 BASIC | 8.04 | □□□□□ -1.12 | | |
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| MTMR3 | Q13615 | RPL21P42-201 | ENST00000488408 | 464 nt | BASIC | 8.04 | □□□□□ -1.12 | | |
| MTMR3 | Q13615 | AC025459.1-201 | ENST00000504072 | 156 nt | BASIC | 8.04 | □□□□□ -1.12 | | |
| MTMR3 | Q13615 | AC113347.3-201 | ENST00000509113 | 148 nt | BASIC | 8.04 | □□□□□ -1.12 | | |
| MTMR3 | Q13615 | LINC01365-202 | ENST00000512219 | 637 nt | TSL 5 BASIC | 8.04 | □□□□□ -1.12 | | |
| MTMR3 | Q13615 | SNORA31.13-201 | ENST00000516624 | 135 nt | BASIC | 8.04 | □□□□□ -1.12 | | |
| MTMR3 | Q13615 | AC025434.1-201 | ENST00000520705 | 460 nt | TSL 3 BASIC | 8.04 | □□□□□ -1.12 | | |