Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 AC040914.1-201ENST00000518674 318 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 FLVCR2-207ENST00000555027 938 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 AC024270.3-201ENST00000565513 396 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 PMM2-213ENST00000566983 907 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 AC003965.1-201ENST00000575693 667 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 USP2-AS1-205ENST00000578923 895 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 MIR3650-201ENST00000581972 60 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 AC092364.1-201ENST00000598561 471 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 AL513327.3-201ENST00000602618 469 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 RN7SL726P-201ENST00000605957 299 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 AC018690.1-201ENST00000608144 626 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 GNAS-AS1_5.1-201ENST00000614281 121 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 AC023509.5-201ENST00000617434 807 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 OR4X2-201ENST00000624868 1025 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 BPNT1-205ENST00000469520 2737 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 UNC119-205ENST00000484980 4189 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 MEIS2-203ENST00000340545 3056 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 UGT2B27P-201ENST00000505092 1620 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 SNX13-203ENST00000428135 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 NRXN1-212ENST00000412315 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 VPS35P1-201ENST00000563400 1518 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 ACVR1-202ENST00000409283 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 INTS4-206ENST00000529807 1845 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 LINC00907-205ENST00000589068 1812 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 OR7A10-202ENST00000641129 1847 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 SLC8A1-205ENST00000405901 3139 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 OR1S1-202ENST00000641544 1474 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 AL390036.1-202ENST00000634635 2439 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 AL109811.4-201ENST00000614757 1793 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 NCEH1-205ENST00000538775 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 CLCC1-206ENST00000369970 2078 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 VIT-208ENST00000497382 2650 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 PIEZO2-204ENST00000538948 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 CYP4A22-201ENST00000294337 1725 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 MSC-AS1-201ENST00000457356 4220 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 CTPS2-202ENST00000380241 3526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 CPT1B-201ENST00000312108 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 SCMH1-202ENST00000337495 3108 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 C11orf54-201ENST00000331239 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 MYH13-202ENST00000418404 6067 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 FSD1L-203ENST00000394926 1947 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 LINC02128-205ENST00000641755 1334 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 GHR-212ENST00000620156 4529 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 TMEM35A-201ENST00000372930 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 GIT2-205ENST00000457474 5291 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 SERPINB6-202ENST00000380520 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 RAET1G-201ENST00000367360 1107 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 ZNF788-202ENST00000397759 777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 EFCAB9-201ENST00000398186 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 MAGEB6P1-201ENST00000416929 1224 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 AC093107.1-201ENST00000422772 609 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 AC064875.1-203ENST00000422996 582 ntTSL 4 BASIC10.41□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 LINC00502-201ENST00000423621 445 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 AC121158.1-201ENST00000425645 239 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 AC083862.1-201ENST00000427378 1242 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 AC006548.1-201ENST00000427470 102 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 HLA-T-206ENST00000429813 450 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 AL590094.1-203ENST00000435649 828 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 LRRC23-208ENST00000436789 796 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 RPL7P14-201ENST00000449851 741 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 AC108868.2-201ENST00000451464 511 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 SLC17A1-203ENST00000468082 1242 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 RN7SL144P-201ENST00000475761 295 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 AC016968.1-201ENST00000479610 697 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 AC048341.1-201ENST00000480482 403 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 LINC02006-201ENST00000488210 524 ntTSL 4 BASIC10.41□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 AC090311.1-201ENST00000490739 249 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 AC091805.1-201ENST00000498395 342 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 AC008967.1-201ENST00000504843 163 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 GAPDHP61-201ENST00000507324 1005 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 SELENOP-204ENST00000507920 786 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 AC026784.1-201ENST00000507986 352 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 AC002456.2-201ENST00000509356 380 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 AC124854.1-202ENST00000513779 339 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 AP001961.1-201ENST00000515782 526 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 MBP-228ENST00000527041 582 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 OR4P1P-201ENST00000530808 1136 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 RASA4-217ENST00000538869 483 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 ASB8-211ENST00000539528 839 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 LINC02389-202ENST00000540024 557 ntTSL 4 BASIC10.41□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 OR8R1P-201ENST00000543943 764 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 AC093525.4-201ENST00000562232 459 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 AC010650.1-201ENST00000567559 494 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 AC026458.2-201ENST00000589323 531 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 AC011894.1-201ENST00000603255 456 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 AC007450.2-201ENST00000614160 290 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 GPC6-202ENST00000617456 792 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 AP002748.4-201ENST00000419755 3547 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 KIF1B-212ENST00000622724 8588 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 ABCB1-201ENST00000265724 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms