Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 CYCSP1-201ENST00000604815 315 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 AC244131.2-201ENST00000612592 512 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 AL096712.1-201ENST00000614561 159 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 AL355480.1-201ENST00000629041 99 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 AC119674.1-217ENST00000641942 1086 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 MBNL2-201ENST00000343600 4596 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 BPESC1-201ENST00000418282 3522 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 AC007114.2-201ENST00000576014 4281 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 PBRM1-207ENST00000409767 4849 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 RAD51B-210ENST00000487270 2596 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF227-201ENST00000313040 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM240A-201ENST00000444264 1826 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM240A-202ENST00000640551 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 NOVA1-213ENST00000574031 1431 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 RPGRIP1L-206ENST00000564374 3877 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 IL31RA-202ENST00000354961 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 CSNK1A1-205ENST00000515435 1856 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 CSNK2A1-204ENST00000400227 1499 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 CX3CR1-201ENST00000358309 3151 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 QRSL1-202ENST00000369046 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 ANKRD12-203ENST00000400020 9115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC125-201ENST00000383374 2006 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 MAP3K7CL-209ENST00000399947 2003 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 AC093829.1-201ENST00000506662 1618 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 LGSN-204ENST00000622415 1612 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 FOPNL-201ENST00000255759 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 SNORA21-201ENST00000362423 132 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 RNU1-134P-201ENST00000362935 165 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 CAPSL-201ENST00000397366 969 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 RNA5SP156-201ENST00000410250 110 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 ABCA12-203ENST00000412081 485 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 AP001610.2-201ENST00000415820 422 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 AC068631.1-204ENST00000428501 534 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR205HG-209ENST00000458250 406 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 AC073288.1-201ENST00000466291 469 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 ARPP21-231ENST00000474696 572 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 UGT2A3P7-201ENST00000510485 734 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 AC090958.1-201ENST00000511122 351 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 TPT1-AS1-206ENST00000519454 709 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 AP001858.2-201ENST00000536213 601 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 AC092865.1-201ENST00000544395 1023 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 NPIPB1P-201ENST00000547442 1129 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 AC012555.2-201ENST00000549448 413 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 AL158058.1-201ENST00000549515 647 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 AC233702.7-202ENST00000582941 211 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 AC012370.2-201ENST00000597541 1080 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 SNHG8-202ENST00000602483 309 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 AL591167.1-201ENST00000607321 456 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 AC104836.2-201ENST00000609675 1293 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 AC006924.1-201ENST00000610750 559 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 AC092683.1-207ENST00000620051 837 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 EGFEM1P-205ENST00000483846 2327 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 GUCY1B2-204ENST00000531898 1979 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 ANKRD46-201ENST00000335659 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 AC008163.1-201ENST00000636281 1455 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 AL161901.1-201ENST00000624954 3425 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 TTC3-201ENST00000354749 9084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 DNAJC16-202ENST00000375847 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 LINGO2-202ENST00000379992 3044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 DCC-203ENST00000442544 10206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 UBE3A-205ENST00000566215 3176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 FOCAD-202ENST00000380249 6096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 SREK1IP1-204ENST00000513458 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02010-202ENST00000471638 1829 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC2A14-221ENST00000616981 3366 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 VWA5A-203ENST00000392748 3419 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 MEF2C-225ENST00000625585 3467 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 PLCH1-206ENST00000494598 3525 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 PCDH18-202ENST00000412923 5102 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 AL357568.1-201ENST00000421530 1963 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 TCF4-284ENST00000637169 7553 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 TAF13-201ENST00000338366 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 PTPN20-208ENST00000395727 790 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 AL132875.1-201ENST00000403623 949 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 UBE2V1P14-201ENST00000415815 558 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 RAD23B-202ENST00000416373 3835 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 RPS7P8-201ENST00000418311 581 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 AC066692.1-201ENST00000421721 457 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 IPPKP1-201ENST00000422501 768 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 AL353148.1-202ENST00000424701 551 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 AL356481.1-202ENST00000426704 970 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 SEPT7-AS1-203ENST00000437235 3810 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 SNX18P26-201ENST00000458433 740 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 AC025458.1-201ENST00000506046 166 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02057-202ENST00000511794 577 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 CR383658.1-201ENST00000514609 734 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 IGKV2-4-201ENST00000523070 340 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 TRIM77BP-201ENST00000524985 1119 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 AC089998.2-201ENST00000551856 277 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 AC012050.1-201ENST00000558185 472 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 AC009087.1-201ENST00000561827 369 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 PWRN1-207ENST00000565893 818 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 AP2S1-210ENST00000601649 315 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 AC068768.2-201ENST00000602352 343 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 MALAT1-214ENST00000618925 424 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 AC024884.1-201ENST00000620583 399 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 AL391117.1-201ENST00000640003 1186 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF410-202ENST00000334521 2193 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 PTPN3-202ENST00000374541 6703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF624-201ENST00000311331 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.7 ms