Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR3

KRTAP4-4, Keratin-associated protein 4-4, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-4Q9BYR3 SYPL1-202ENST00000455385 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 PRIMPOL-202ENST00000503752 2168 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 UBE2L3-202ENST00000458578 3007 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 MED24-212ENST00000501516 3037 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 ZNF430-203ENST00000595401 3021 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 RGMA-201ENST00000329082 11350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 AHSG-201ENST00000273784 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 TRIP12-203ENST00000389044 6405 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 FCGR2A-201ENST00000271450 2412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 ARHGAP36-202ENST00000370921 2447 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 APBB2-201ENST00000295974 8972 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 ARHGEF15-202ENST00000421050 4138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 FN1-209ENST00000432072 7759 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 INTS3-201ENST00000318967 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 CLDN19-203ENST00000539749 3517 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 IL31RA-202ENST00000354961 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 AC027801.2-201ENST00000515692 1816 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 EML4-202ENST00000401738 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 SLC15A5-201ENST00000344941 2923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 ZNF839-209ENST00000559185 2905 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 HMGN3-AS1-201ENST00000604516 2946 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 PTGS1-206ENST00000614910 4894 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 ZWILCH-214ENST00000613446 3181 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 MEGF10-201ENST00000274473 7594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 CDK6-201ENST00000265734 11612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 GAL3ST4-203ENST00000413800 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 PTPN12-203ENST00000415482 2316 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 PRKAG3-203ENST00000439262 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 GALNT11-201ENST00000415421 2555 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 SLC26A5-211ENST00000432958 2588 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 THAP9-AS1-204ENST00000504792 2577 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 DDX27-206ENST00000618172 2567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 GATAD2A-201ENST00000358713 5510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 TRPV2-201ENST00000338560 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 TXNDC2-202ENST00000357775 2830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 BRCC3-204ENST00000369462 2846 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 GPR61-207ENST00000618721 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 BTNL2-203ENST00000454136 1460 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 DIP2C-201ENST00000280886 7888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 SNTG1-201ENST00000517473 1703 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 AL359649.1-201ENST00000607406 1741 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 PLA2G4D-201ENST00000290472 3584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 LYPD6-203ENST00000409381 3578 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 RNF10-201ENST00000325954 3825 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 MCM8-203ENST00000378886 3835 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 NOBOX-202ENST00000483238 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 WDR25-206ENST00000554998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 NFASC-202ENST00000360049 10120 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 NFASC-225ENST00000539706 10135 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 UHRF1-201ENST00000612630 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 STRADA-203ENST00000375840 2209 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 BAK1-203ENST00000442998 2212 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 DSP-201ENST00000379802 9796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 DNAI2-205ENST00000579490 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 ARID1B-230ENST00000637810 5073 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 KANSL1-201ENST00000262419 5309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 TOMM40L-202ENST00000367988 2708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 MDM1-203ENST00000393543 2718 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 RNASE9-209ENST00000557068 2703 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 MUC15-201ENST00000281268 2968 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 ZBTB3-201ENST00000394807 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 SLC24A5-204ENST00000482911 2984 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 GPATCH2-201ENST00000366934 3218 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 CEBPZ-201ENST00000234170 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 SYNJ1-201ENST00000357345 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 SYNJ1-203ENST00000382499 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 FNBP1L-202ENST00000271234 4212 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 C1RL-201ENST00000266542 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 CCDC148-201ENST00000283233 3122 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 ACAA2-201ENST00000285093 3350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 MFAP4-201ENST00000299610 1873 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 ZNF439-201ENST00000304030 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 NDUFA4-201ENST00000339600 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 ARHGAP19-201ENST00000358308 5390 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 RUBCNL-202ENST00000378784 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 FGFR1-208ENST00000397108 2870 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 SLC16A4-203ENST00000437429 2372 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 MFAP4-203ENST00000497081 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 AC137834.1-201ENST00000548184 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 AC110079.1-201ENST00000567913 4395 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 FGF11-202ENST00000572907 2358 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 AC068491.4-201ENST00000622940 3380 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 PIGN-222ENST00000638329 2367 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 PARM1-201ENST00000307428 5011 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 IVD-203ENST00000479013 4251 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 SUPT5H-201ENST00000359191 3770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 MICAL2-231ENST00000537344 3774 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 TBX15-202ENST00000369429 3504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 SETD4-206ENST00000399212 3258 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 GOLM1-202ENST00000388711 3022 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 AC020915.6-201ENST00000637233 3042 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 VPS16-202ENST00000380445 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 PES1-203ENST00000402281 2760 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 INTS9-201ENST00000416984 2759 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 AC079915.1-201ENST00000584382 2780 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 OS9-201ENST00000257966 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 STXBP5L-201ENST00000273666 9496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 IQCG-201ENST00000265239 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 151.2 ms