Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 AC090771.1-201ENST00000585803 1618 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 CEACAM1-213ENST00000599389 1342 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 CDH6-201ENST00000265071 8476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 PDGFC-203ENST00000502773 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 ATP8A2P3-201ENST00000426792 1536 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 LINC02447-201ENST00000499242 1500 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 POU2F3-201ENST00000260264 2903 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 AKR1C4-201ENST00000263126 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 MS4A5-201ENST00000300190 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 OR52E6-201ENST00000329322 970 ntAPPRIS P1 BASIC8.36□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 OR10R2-201ENST00000368152 1008 ntAPPRIS P2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 UGT1A6-203ENST00000406651 785 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 HNMT-204ENST00000410115 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 AL133480.1-201ENST00000411561 638 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 SPRY4-AS1-201ENST00000414314 521 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 MTND6P1-201ENST00000417434 424 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 AC016716.2-201ENST00000418621 486 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 AP001136.1-201ENST00000425058 635 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 CHCHD3P1-201ENST00000425516 676 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 NPM1P24-201ENST00000428039 894 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 OFD1P13Y-201ENST00000431179 1232 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 OR2B8P-201ENST00000432841 938 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 CLEC4E-202ENST00000446457 701 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 ST13P21-201ENST00000453250 1098 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 GRIK1-AS1-205ENST00000455392 767 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 STARD13-IT1-201ENST00000456087 452 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 AC131233.1-201ENST00000479200 955 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 PRICKLE2-AS2-201ENST00000484703 496 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 AC079943.2-201ENST00000488999 716 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 AC113404.1-201ENST00000502589 756 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 AC010424.1-201ENST00000506336 297 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 AC034244.1-201ENST00000507687 207 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 DCAF13P2-201ENST00000514188 555 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 AC107463.1-202ENST00000514526 689 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 AC116347.2-201ENST00000514912 523 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 AC090193.1-202ENST00000524355 566 ntTSL 4 BASIC8.36□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 RBMS2P1-201ENST00000525031 1226 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 OR4A1P-201ENST00000532342 920 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 RAB3IP-214ENST00000550847 670 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 LINC00687-203ENST00000558175 696 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 AC026770.1-201ENST00000558994 581 ntTSL 4 BASIC8.36□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 NPM1P47-201ENST00000560843 856 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 AC136619.2-201ENST00000563361 631 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 EIF4A3P1-201ENST00000578499 647 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 WDR45BP1-201ENST00000583470 1029 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 RN7SL126P-201ENST00000616400 299 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 CLECL1-204ENST00000621400 611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 PDE11A-212ENST00000358450 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 RN7SKP23-201ENST00000625159 4301 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 WDR44-202ENST00000371822 3877 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 CCDC152-201ENST00000361970 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 PPFIA2-205ENST00000541570 2976 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 PPP6R3-206ENST00000524904 4292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 NCR3LG1-201ENST00000338965 6438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 AC009690.2-201ENST00000570175 3148 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 TDRD3-209ENST00000621840 2497 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 ANKFY1-201ENST00000341657 7418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 TRIM6-201ENST00000278302 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 IL16-204ENST00000394660 9616 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 AKR1C1-202ENST00000380872 6705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 GCNT3-209ENST00000560585 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 WDR89-202ENST00000394942 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 NPHP1-201ENST00000316534 3756 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 TEP1-201ENST00000262715 10695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 GRIN2A-202ENST00000396573 14450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 DSG3-201ENST00000257189 5525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 OSBPL1A-202ENST00000357041 1869 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 NTS-201ENST00000256010 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 FAM133CP-201ENST00000332869 704 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 MYL1-201ENST00000341685 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 DPPA3-201ENST00000345088 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 PAGE2B-201ENST00000374971 493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 RFPL3S-202ENST00000382086 455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 Y_RNA.553-201ENST00000384670 102 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 KCNJ13-203ENST00000410029 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 RNA5SP280-201ENST00000411230 115 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 USP9YP33-201ENST00000412220 421 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 AC011233.1-201ENST00000422812 283 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 GAPDHP69-201ENST00000425504 1008 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 AL033504.1-201ENST00000427015 773 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 MGAT2P2-201ENST00000427194 797 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 ETDA-201ENST00000427686 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 AC122718.1-201ENST00000439448 744 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 GK-IT1-201ENST00000441146 397 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 AC009263.1-201ENST00000441193 1239 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 AL451164.3-201ENST00000441377 447 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 CLDN34-201ENST00000445307 995 ntAPPRIS P1 BASIC8.35□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 GAPDHP16-201ENST00000448152 962 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 AL513422.1-201ENST00000449531 383 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 LINC01795-201ENST00000454367 813 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 OSTCP1-201ENST00000455507 450 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 AC092832.2-201ENST00000456621 389 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 VN1R6P-201ENST00000458417 907 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 RNU7-125P-201ENST00000458760 62 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 FAM133DP-201ENST00000464802 691 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 RPL23AP8-201ENST00000479812 475 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 RPL9P33-201ENST00000484311 566 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
NEDD1Q8NHV4 AL158068.2-201ENST00000510632 563 ntTSL 4 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.5 ms