Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXQ3

C9orf40, Uncharacterized protein C9orf40, humanhuman

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf40Q8IXQ3 AC145285.4-201ENST00000568183 540 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
C9orf40Q8IXQ3 AC124916.2-201ENST00000604416 224 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
C9orf40Q8IXQ3 OXSM-209ENST00000626005 309 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
C9orf40Q8IXQ3 OR7A1P-202ENST00000641542 1158 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
C9orf40Q8IXQ3 MECOM-209ENST00000472280 3593 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
C9orf40Q8IXQ3 ZNF112-201ENST00000337401 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
C9orf40Q8IXQ3 NEDD9-202ENST00000379446 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
C9orf40Q8IXQ3 ZNF192P1-201ENST00000440790 1628 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
C9orf40Q8IXQ3 MARVELD2-204ENST00000454295 4376 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
C9orf40Q8IXQ3 SRSF11-202ENST00000370950 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
C9orf40Q8IXQ3 AL033543.1-201ENST00000623440 13454 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
C9orf40Q8IXQ3 AC104662.2-201ENST00000512921 1388 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
C9orf40Q8IXQ3 ANKRD12-203ENST00000400020 9115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
C9orf40Q8IXQ3 LARP7-210ENST00000509061 2332 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
C9orf40Q8IXQ3 BLM-201ENST00000355112 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
C9orf40Q8IXQ3 TXNRD1-212ENST00000526390 3808 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
C9orf40Q8IXQ3 NDUFS1-201ENST00000233190 11819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
C9orf40Q8IXQ3 CLEC4E-201ENST00000299663 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
C9orf40Q8IXQ3 KIF1B-204ENST00000377086 10669 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
C9orf40Q8IXQ3 AC027575.3-201ENST00000583058 2747 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
C9orf40Q8IXQ3 CD200R1-201ENST00000295863 1692 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
C9orf40Q8IXQ3 MAGEB16-203ENST00000399988 1682 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
C9orf40Q8IXQ3 LINC01684-203ENST00000453784 2908 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
C9orf40Q8IXQ3 CEP44-206ENST00000503780 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
C9orf40Q8IXQ3 VNN3-207ENST00000425515 1761 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
C9orf40Q8IXQ3 WDR35-201ENST00000281405 6918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
C9orf40Q8IXQ3 PDE4D-228ENST00000636120 6659 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
C9orf40Q8IXQ3 POM121L2-202ENST00000444565 3108 ntAPPRIS P2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
C9orf40Q8IXQ3 EXPH5-203ENST00000525344 6542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
C9orf40Q8IXQ3 GRIA2-204ENST00000393815 5260 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
C9orf40Q8IXQ3 GIGYF2-246ENST00000629305 7878 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
C9orf40Q8IXQ3 CPEB4-202ENST00000334035 6705 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
C9orf40Q8IXQ3 TESPA1-210ENST00000531122 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
C9orf40Q8IXQ3 TRAPPC3L-201ENST00000356128 2421 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
C9orf40Q8IXQ3 CEACAM1-207ENST00000403444 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
C9orf40Q8IXQ3 ADCY10-205ENST00000545172 4966 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
C9orf40Q8IXQ3 PCLO-203ENST00000423517 17147 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
C9orf40Q8IXQ3 TMEM202-201ENST00000341689 1012 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
C9orf40Q8IXQ3 RN7SKP237-201ENST00000364663 301 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
C9orf40Q8IXQ3 S100A5-201ENST00000368717 506 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
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C9orf40Q8IXQ3 AC000058.1-201ENST00000415249 536 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
C9orf40Q8IXQ3 AC074035.1-201ENST00000420725 1184 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
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C9orf40Q8IXQ3 AC073257.1-201ENST00000432474 523 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
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C9orf40Q8IXQ3 KRTAP2-5P-201ENST00000446109 396 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
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C9orf40Q8IXQ3 LINC02196-201ENST00000512838 568 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
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C9orf40Q8IXQ3 AC093525.4-201ENST00000562232 459 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
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C9orf40Q8IXQ3 OSBPL9-206ENST00000453295 2842 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
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C9orf40Q8IXQ3 MBNL2-202ENST00000345429 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
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C9orf40Q8IXQ3 SLC16A4-201ENST00000369779 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
C9orf40Q8IXQ3 PSG5-210ENST00000599812 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
C9orf40Q8IXQ3 LINC01297-204ENST00000621052 4222 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
C9orf40Q8IXQ3 ECT2-216ENST00000540509 4406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
C9orf40Q8IXQ3 NPIPB8-202ENST00000529716 2058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
C9orf40Q8IXQ3 AC024651.2-201ENST00000562480 2098 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
C9orf40Q8IXQ3 OLMALINC-203ENST00000641087 3779 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
C9orf40Q8IXQ3 POT1-202ENST00000393329 3950 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
C9orf40Q8IXQ3 TRMT13-202ENST00000370141 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
C9orf40Q8IXQ3 FGF1-216ENST00000621536 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
C9orf40Q8IXQ3 SNX13-213ENST00000611725 6817 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
C9orf40Q8IXQ3 ARHGEF38-201ENST00000265154 1437 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
C9orf40Q8IXQ3 LINC02477-201ENST00000512652 1417 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
C9orf40Q8IXQ3 CHD6-202ENST00000373222 2477 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
C9orf40Q8IXQ3 ZBTB21-205ENST00000398511 5608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
C9orf40Q8IXQ3 GTF3C3-202ENST00000409364 1736 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
C9orf40Q8IXQ3 CYLD-207ENST00000564326 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
C9orf40Q8IXQ3 VEGFD-201ENST00000297904 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
C9orf40Q8IXQ3 ODF2-205ENST00000393527 3653 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
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