Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 AL162726.3-201ENST00000637606 1301 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 ASAH1-232ENST00000636691 2472 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 AXDND1-201ENST00000367618 3642 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 DYNC2LI1-201ENST00000260605 1399 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 CPEB2-AS1-202ENST00000501916 1806 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 AC005480.1-202ENST00000555916 3548 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 SHQ1P1-201ENST00000437111 1544 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 CPS1-212ENST00000619804 1542 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 PCDH15-213ENST00000395445 5917 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 LINC01787-201ENST00000435311 1994 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 TSPAN14-207ENST00000429989 16183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 ACACA-231ENST00000614428 9554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 ZNF699-203ENST00000591998 3358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 LINC01722-201ENST00000456265 3033 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 NEDD9-202ENST00000379446 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 AL360271.1-201ENST00000395679 510 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 SMARCE1P6-201ENST00000398372 1216 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 AL139805.1-201ENST00000407837 289 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 SLC3A1-203ENST00000409294 792 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 RN7SKP86-201ENST00000410454 332 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 LINC01820-201ENST00000418415 570 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 RPS17P17-201ENST00000419392 409 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 AC099782.1-201ENST00000425889 474 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 AL358074.1-201ENST00000444800 509 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 ZNF619P1-201ENST00000446539 752 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 EEF1B2P3-201ENST00000447718 678 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 AC008080.2-201ENST00000455149 577 ntTSL 4 BASIC6.4□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 EIF4E2P2-201ENST00000492033 736 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 AC113367.2-201ENST00000505749 160 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 SPINK9-202ENST00000511717 604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 RN7SKP35-201ENST00000517210 151 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 AC025031.1-201ENST00000552634 562 ntTSL 4 BASIC6.4□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 AC009167.1-201ENST00000568317 579 ntTSL 4 BASIC6.4□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 AC136443.4-201ENST00000568759 579 ntTSL 4 BASIC6.4□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 AL133410.1-201ENST00000574939 546 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 AC073333.2-201ENST00000603589 769 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 AC141002.1-201ENST00000607025 279 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 RNF6-202ENST00000381570 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 ECT2-216ENST00000540509 4406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 EXPH5-203ENST00000525344 6542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 BEND2-201ENST00000380030 1938 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
RAB6CQ53S08 LCP1-201ENST00000323076 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
RAB6CQ53S08 HCG18-239ENST00000454129 4433 ntTSL 4 BASIC6.4□□□□□ -1.39
RAB6CQ53S08 CCR2-201ENST00000292301 2671 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
RAB6CQ53S08 IGSF6-201ENST00000268389 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
RAB6CQ53S08 PSMC6-219ENST00000612399 1590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
RAB6CQ53S08 TNFSF4-201ENST00000281834 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
RAB6CQ53S08 SLC2A14-203ENST00000431042 3458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
RAB6CQ53S08 ASCC1-203ENST00000342444 2270 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RAB6CQ53S08 LARP7-210ENST00000509061 2332 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
RAB6CQ53S08 DHRS9-204ENST00000428522 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
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RAB6CQ53S08 SYNE2-216ENST00000555002 11532 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
RAB6CQ53S08 ZFP62-201ENST00000502412 3415 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RAB6CQ53S08 NFIA-204ENST00000371187 2683 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
RAB6CQ53S08 NXF3-201ENST00000395065 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
RAB6CQ53S08 ADAM5-208ENST00000505455 1998 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
RAB6CQ53S08 AC024651.2-201ENST00000562480 2098 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
RAB6CQ53S08 TNP1-201ENST00000236979 407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
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RAB6CQ53S08 LINC01638-201ENST00000418271 552 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
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RAB6CQ53S08 SLC25A51P1-201ENST00000468432 871 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
RAB6CQ53S08 RN7SL362P-201ENST00000494228 267 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
RAB6CQ53S08 AC239584.1-201ENST00000510419 732 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RAB6CQ53S08 LINC02503-201ENST00000510505 812 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RAB6CQ53S08 LACTB2-AS1-203ENST00000518553 817 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
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RAB6CQ53S08 SEPT4-AS1-202ENST00000580589 653 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RAB6CQ53S08 LINC01908-201ENST00000583148 555 ntTSL 4 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RAB6CQ53S08 ZNF682-208ENST00000596019 552 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RAB6CQ53S08 TEX41-218ENST00000596540 882 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RAB6CQ53S08 AP001823.1-201ENST00000604056 1003 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
RAB6CQ53S08 AC090953.1-201ENST00000604305 1092 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
RAB6CQ53S08 AC124916.2-201ENST00000604416 224 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
RAB6CQ53S08 Metazoa_SRP.35-201ENST00000611402 288 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
RAB6CQ53S08 AL512652.1-201ENST00000619006 500 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
RAB6CQ53S08 AC084816.1-204ENST00000628326 631 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RAB6CQ53S08 AC116667.2-201ENST00000641075 823 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
RAB6CQ53S08 USP16-201ENST00000334352 3004 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RAB6CQ53S08 PRDM2-202ENST00000311066 7437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RAB6CQ53S08 FGF1-216ENST00000621536 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
RAB6CQ53S08 LINC02477-201ENST00000512652 1417 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RAB6CQ53S08 PSG10P-201ENST00000501199 1500 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
RAB6CQ53S08 ZNF292-201ENST00000339907 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RAB6CQ53S08 PBX1-221ENST00000612123 6062 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RAB6CQ53S08 AC079753.1-201ENST00000623243 3868 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
RAB6CQ53S08 MAPK10-341ENST00000641657 3860 ntAPPRIS P2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RAB6CQ53S08 CSTF3-201ENST00000323959 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
RAB6CQ53S08 AL020995.1-201ENST00000427524 1680 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RAB6CQ53S08 NAT1-210ENST00000545197 1827 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RAB6CQ53S08 C5orf24-201ENST00000338051 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
RAB6CQ53S08 TRAM2-201ENST00000182527 6908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
RAB6CQ53S08 ADNP-202ENST00000371602 6115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
RAB6CQ53S08 AGBL1-201ENST00000441037 3551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
RAB6CQ53S08 LINC01470-202ENST00000506723 2193 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
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