Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 LINC00375-201ENST00000433074 601 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 AC119751.5-201ENST00000514077 770 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 BABAM2-206ENST00000379632 1752 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 PRDM15-202ENST00000398548 6654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 KCTD6-201ENST00000355076 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 IPO5-222ENST00000490680 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 RAB30-214ENST00000534141 3746 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 FNIP1-202ENST00000307968 6388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 ZNF518A-201ENST00000316045 7277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 RPL7L1-208ENST00000493763 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 RETREG1-202ENST00000399793 3145 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 LRRC37B-203ENST00000394713 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 DCAF1-203ENST00000504652 5951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 IFNG-AS1-202ENST00000538665 1791 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 IL24-207ENST00000611909 1621 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 NPR3-201ENST00000265074 7344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 ARHGEF11-202ENST00000368194 6889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 ALKAL2-201ENST00000344414 449 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 RN7SKP28-201ENST00000364770 305 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 AL158073.1-201ENST00000426848 1104 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 LINC01350-202ENST00000439633 623 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 NPM1P51-201ENST00000443470 744 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 OR7E157P-201ENST00000494376 911 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 LINC02218-202ENST00000504998 582 ntTSL 4 BASIC3.4□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 RN7SKP92-201ENST00000517266 244 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 AC009054.1-201ENST00000568140 427 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 C16orf97-205ENST00000568524 406 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 AC006504.2-201ENST00000589471 458 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 AC025278.1-201ENST00000593558 515 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 AC125494.2-201ENST00000602431 657 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 THRA1/BTR-203ENST00000604191 571 ntTSL 4 BASIC3.4□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 LDAH-212ENST00000619656 3663 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 BOD1L1-201ENST00000040738 10565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 SLC25A24-202ENST00000370041 3404 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 HPS5-201ENST00000349215 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 AC087516.1-201ENST00000561236 2428 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 LNPEP-202ENST00000395770 3888 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 MROH2B-203ENST00000506092 3745 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 IRF5P1-201ENST00000504852 2164 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 TRIM36-209ENST00000514154 1952 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 SEMA6A-202ENST00000343348 6878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 EPPK1-201ENST00000568225 15530 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 NAT1-210ENST00000545197 1827 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 POLE-201ENST00000320574 7840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 LRRC36-202ENST00000435835 1765 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 LGI1-212ENST00000630184 2936 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 SIPA1L1-211ENST00000555818 7831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 DTNA-226ENST00000596745 1508 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 CPNE4-208ENST00000511604 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 SEMA4D-202ENST00000356444 4503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 PTAFR-202ENST00000373857 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 AC110597.1-201ENST00000562669 3176 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 BDNF-205ENST00000395981 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 WFDC8-202ENST00000357199 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 ATP5F1P3-201ENST00000397213 657 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 RN7SKP177-201ENST00000410567 355 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 SVIL-AS1-202ENST00000414457 1243 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 CCNB1IP1P1-201ENST00000428976 839 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 TRIM60P9Y-201ENST00000438459 816 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 TRIM60P11Y-201ENST00000445313 801 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 LINC00973-201ENST00000473756 962 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 RPS4XP23-201ENST00000487801 237 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 LINS1-207ENST00000560133 1196 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 TXNP4-201ENST00000575018 310 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 AC006338.2-201ENST00000616864 791 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 TRPM3-210ENST00000377111 4618 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 MCFD2-202ENST00000409105 4210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 LPGAT1-202ENST00000366997 7782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 COL5A2-201ENST00000374866 6949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 GTDC1-220ENST00000618778 2317 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 TEKT1-201ENST00000338694 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 AC011815.2-201ENST00000618230 2021 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 INTS6P1-201ENST00000504674 2530 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 LINC02092-201ENST00000455366 2472 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 TAF7L-203ENST00000372907 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 SCG3-201ENST00000220478 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 CCNB3-202ENST00000348603 1201 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 PLGLB2-201ENST00000359481 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 CCNB3-203ENST00000376038 1201 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 TYRP1-201ENST00000381136 872 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 SLC8A1-AS1-201ENST00000413479 800 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 AC006065.1-201ENST00000422539 802 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 RPL5P25-201ENST00000441148 775 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 ADGRL3-AS1-202ENST00000504135 542 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 AC097467.3-212ENST00000512269 568 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 AC097467.3-209ENST00000595760 615 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 DAOA-AS1_2.2-201ENST00000610818 204 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 MIR6085-201ENST00000618314 110 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 LINC00506-201ENST00000628435 525 ntTSL 4 BASIC3.39□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 DAZ2-207ENST00000382449 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 LY75-CD302-201ENST00000504764 5650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 MYOM1-201ENST00000261606 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 KCNJ1-203ENST00000392664 1674 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 ARHGAP19-201ENST00000358308 5390 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 BTK-209ENST00000618050 2417 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 FAM13A-201ENST00000264344 5858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 AC018765.1-201ENST00000623357 3446 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 LCP1-201ENST00000323076 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 XIST-206ENST00000434839 2865 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
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