Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 CLEC4E-201ENST00000299663 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 TXNRD1-203ENST00000397736 3832 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 SYTL4-203ENST00000372981 4847 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 IBTK-210ENST00000610980 5195 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 BEND2-201ENST00000380030 1938 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 TYW3-203ENST00000457880 3335 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 MEIS1-201ENST00000272369 4291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 FGG-201ENST00000336098 1659 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 ATP5J2-201ENST00000292475 607 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 DEFB106A-201ENST00000335186 303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 DEFB106B-201ENST00000335479 316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 RN7SKP28-201ENST00000364770 305 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 RNA5SP172-201ENST00000365061 118 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 STMN1-202ENST00000374291 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 TRDC-201ENST00000390477 720 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 CFAP70-204ENST00000394865 1222 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 TBC1D32-204ENST00000398212 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 AL391422.1-201ENST00000402155 436 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 NRIR-202ENST00000414795 506 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 LURAP1L-AS1-201ENST00000417638 799 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 AL391704.2-201ENST00000418379 981 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 AL158070.1-201ENST00000421614 631 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 PTP4A1P7-201ENST00000423476 514 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 AL353148.1-202ENST00000424701 551 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 AP001628.1-201ENST00000431150 285 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 BX119904.1-201ENST00000432026 348 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 PRKAR1AP1-201ENST00000441422 1162 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 AL161626.1-201ENST00000441480 490 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 ELOCP13-201ENST00000443934 329 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 FREM2-AS1-201ENST00000448887 465 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 MTND2P8-201ENST00000450555 1025 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 LINC01105-205ENST00000450794 580 ntTSL 4 BASIC6.31□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 RN7SL561P-201ENST00000488553 281 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 SUMO1P1-201ENST00000497904 306 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 AC113383.1-205ENST00000502253 792 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 AC008427.1-201ENST00000503102 655 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 SNORA58-201ENST00000505219 137 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 AC090568.1-201ENST00000509499 856 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 LINC02503-201ENST00000510505 812 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 RN7SKP265-201ENST00000516448 223 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 IGLV1-62-201ENST00000518003 441 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 IGHVIII-26-1-201ENST00000520387 250 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 AP003548.1-201ENST00000523862 711 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 AP001804.1-201ENST00000526868 919 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 PTER-205ENST00000535784 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 PPFIA2-AS1-202ENST00000549161 1080 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 AC090503.2-201ENST00000551135 981 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 AC013356.3-201ENST00000558601 584 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 AL132640.2-202ENST00000559732 614 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 PEX11A-205ENST00000561257 978 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 LINC00921-201ENST00000572123 243 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 RN7SL697P-201ENST00000582484 299 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 AC061975.3-201ENST00000583209 244 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 RPSAP66-201ENST00000592196 606 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 AL035417.2-201ENST00000603887 796 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 AC078909.2-201ENST00000620584 398 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 AC004943.1-201ENST00000620814 561 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 LINC01002-204ENST00000631644 473 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 FKBP1AP4-201ENST00000631775 336 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 DPCR1-202ENST00000462446 5314 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 ZNF532-201ENST00000336078 6696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 ERG-202ENST00000398897 4651 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 LINC02547-201ENST00000531559 3308 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 HGF-205ENST00000423064 1990 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 ABLIM1-207ENST00000392955 7408 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 THRB-IT1-201ENST00000425296 1754 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 LEKR1-204ENST00000470811 2881 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 PSMC6-218ENST00000606149 1560 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 PDZRN4-201ENST00000298919 3411 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 ZNF710-AS1-202ENST00000620791 2133 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 CLCC1-205ENST00000369969 4343 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 DEPDC1B-201ENST00000265036 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 KANTR-203ENST00000604062 4251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 FOXP2-201ENST00000350908 2638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 PUM2-201ENST00000319801 6002 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 DNM1L-201ENST00000266481 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 NXPE4-202ENST00000424261 1687 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 AC087258.1-203ENST00000545400 1629 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 TCF4-284ENST00000637169 7553 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 TTR-201ENST00000237014 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 FAM205C-201ENST00000340783 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC6.3□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 RNU5E-10P-201ENST00000363506 118 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 MLXIP-203ENST00000377037 805 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 RNU6-468P-201ENST00000384003 109 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 RNU6-481P-201ENST00000384194 107 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 RNU6-796P-201ENST00000391086 107 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 IGBP1-AS2-201ENST00000403371 513 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 HMGB3P19-201ENST00000403971 560 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 GRPEL2P2-201ENST00000421856 670 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 LINC00266-1-202ENST00000425473 629 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 AC092447.3-201ENST00000426027 686 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 AL008723.2-201ENST00000426354 562 ntTSL 4 BASIC6.3□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 AC073900.1-201ENST00000429766 776 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 MRPS21P3-201ENST00000436696 262 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 AC007064.2-201ENST00000442403 500 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 LINC01307-202ENST00000444327 771 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 AL355601.1-201ENST00000444701 427 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 CYCSP44-201ENST00000448560 313 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 AL035420.1-202ENST00000450129 357 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 LINC01006-207ENST00000458645 738 ntTSL 4 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83 ms