Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 ZNF24-204ENST00000589881 7419 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
COL4A6Q14031 CEACAM1-203ENST00000352591 3170 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
COL4A6Q14031 NCKAP5-203ENST00000405974 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
COL4A6Q14031 PREPL-203ENST00000378520 2308 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
COL4A6Q14031 PSG11-201ENST00000306322 990 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
COL4A6Q14031 AL353740.1-201ENST00000366253 575 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
COL4A6Q14031 FAM66C-201ENST00000372173 678 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
COL4A6Q14031 AL596448.1-201ENST00000415024 392 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
COL4A6Q14031 AL160163.1-201ENST00000417465 403 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
COL4A6Q14031 CASP5-203ENST00000418434 1023 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
COL4A6Q14031 LINC02246-202ENST00000418954 717 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
COL4A6Q14031 AL359644.1-204ENST00000440807 440 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
COL4A6Q14031 AC009237.1-201ENST00000442127 744 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
COL4A6Q14031 AC073288.1-201ENST00000466291 469 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
COL4A6Q14031 AC023245.1-201ENST00000468501 517 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
COL4A6Q14031 RN7SL727P-201ENST00000482164 296 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
COL4A6Q14031 AC006499.3-201ENST00000506077 748 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
COL4A6Q14031 AP003469.1-202ENST00000521884 478 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
COL4A6Q14031 AF181450.1-201ENST00000522980 410 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
COL4A6Q14031 AL035078.1-201ENST00000531962 820 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
COL4A6Q14031 AC007569.1-202ENST00000547282 303 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
COL4A6Q14031 AC006530.1-201ENST00000555980 571 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
COL4A6Q14031 ULK4P1-201ENST00000564495 875 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
COL4A6Q14031 AC005726.5-201ENST00000585189 298 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
COL4A6Q14031 AL445649.1-201ENST00000615941 691 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
COL4A6Q14031 RN7SL544P-201ENST00000617232 284 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
COL4A6Q14031 RN7SL763P-201ENST00000620922 284 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
COL4A6Q14031 NUFIP1-201ENST00000379161 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
COL4A6Q14031 IFIT1-202ENST00000546318 4613 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
COL4A6Q14031 NEPNP-201ENST00000404786 1371 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
COL4A6Q14031 SMARCA2-252ENST00000636559 6853 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
COL4A6Q14031 KCNJ1-205ENST00000392666 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
COL4A6Q14031 SGIP1-201ENST00000237247 3997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
COL4A6Q14031 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
COL4A6Q14031 TCF7L2-210ENST00000369397 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
COL4A6Q14031 STAMBP-201ENST00000339566 6277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
COL4A6Q14031 OR5A2-202ENST00000641361 6655 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
COL4A6Q14031 AC092821.3-202ENST00000641304 2767 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
COL4A6Q14031 ATXN3-204ENST00000429774 6713 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
COL4A6Q14031 WDR7-213ENST00000615645 5257 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
COL4A6Q14031 LINC02401-201ENST00000550185 3059 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
COL4A6Q14031 CARF-212ENST00000434998 1955 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
COL4A6Q14031 CLIC5-201ENST00000185206 6023 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
COL4A6Q14031 ODF2L-202ENST00000317336 4376 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
COL4A6Q14031 NKRF-204ENST00000542113 3351 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
COL4A6Q14031 AC006019.2-201ENST00000451116 3044 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
COL4A6Q14031 SATB1-209ENST00000454909 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
COL4A6Q14031 ZNF440-201ENST00000304060 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
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COL4A6Q14031 TXNIP-201ENST00000425134 1225 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
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COL4A6Q14031 AL606490.8-201ENST00000441624 319 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
COL4A6Q14031 BZW1P1-201ENST00000454901 1240 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
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COL4A6Q14031 LGALS8-217ENST00000525042 903 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
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COL4A6Q14031 LINC02250-201ENST00000422117 2491 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
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COL4A6Q14031 SOX6-208ENST00000527619 2699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
COL4A6Q14031 ZNF610-208ENST00000613461 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
COL4A6Q14031 ARNTL2-207ENST00000542388 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
COL4A6Q14031 UTY-209ENST00000537580 6490 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
COL4A6Q14031 LINC01606-203ENST00000519160 2292 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
COL4A6Q14031 SNW1-205ENST00000555761 1855 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
COL4A6Q14031 SLC7A2-201ENST00000004531 7560 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
COL4A6Q14031 KIAA1217-202ENST00000376451 7383 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
COL4A6Q14031 FO082842.1-201ENST00000423552 1370 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
COL4A6Q14031 PCA3-201ENST00000412654 3922 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
COL4A6Q14031 AC022173.1-201ENST00000418554 577 ntTSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
COL4A6Q14031 NMD3P2-201ENST00000421815 761 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
COL4A6Q14031 MRPS22-205ENST00000478464 1065 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
COL4A6Q14031 MOCS2-208ENST00000527216 707 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
COL4A6Q14031 AC009656.1-201ENST00000531966 478 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
COL4A6Q14031 PCNAP4-201ENST00000532690 730 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
COL4A6Q14031 MIR3691-201ENST00000578066 90 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
COL4A6Q14031 LINC01476-202ENST00000584262 635 ntTSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
COL4A6Q14031 ZNF230-204ENST00000585632 579 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
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