Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 AC090592.1-202ENST00000533049 568 ntTSL 4 BASIC6.41□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 SNHG1-211ENST00000539921 1071 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 AC022509.1-203ENST00000541940 708 ntTSL 4 BASIC6.41□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 AL355112.1-201ENST00000550309 1236 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 AC023908.1-201ENST00000559899 567 ntTSL 4 BASIC6.41□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 AC004034.1-201ENST00000573260 510 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 TTN-AS1-219ENST00000586707 834 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 AC006305.3-201ENST00000590589 454 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 AC020914.2-201ENST00000598220 430 ntTSL 4 BASIC6.41□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 AL671309.1-201ENST00000603750 544 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 AC007255.2-201ENST00000604053 631 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 BNIP3P19-201ENST00000605397 577 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 PPATP2-201ENST00000605635 508 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 AL589740.1-209ENST00000607032 1056 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 AC241377.2-201ENST00000612313 553 ntTSL 4 BASIC6.41□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 GAPDHP41-201ENST00000613707 975 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 RSU1P2-204ENST00000619977 1240 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 SAMD12-AS1-201ENST00000625758 718 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 SMARCA2-231ENST00000634931 939 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 AL590396.2-201ENST00000636511 1041 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 CPED1-201ENST00000310396 5340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 DPCR1-202ENST00000462446 5314 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 TMEM155-203ENST00000394396 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 MECOM-209ENST00000472280 3593 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 MAMDC2-AS1-202ENST00000414515 2097 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 DOCK11-201ENST00000276202 6625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 SETDB2-201ENST00000258672 2138 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 MAP3K20-AS1-203ENST00000423106 2538 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 LRRC39-202ENST00000370137 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 CYLD-201ENST00000311559 5371 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 FMN1-212ENST00000616417 13529 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 AP004243.1-201ENST00000529108 1433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 AC107884.1-202ENST00000622955 2703 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 AC217777.1-201ENST00000570034 1471 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 DAZ2-204ENST00000382431 3637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 AP000866.1-202ENST00000529392 2792 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 ADGRB3-203ENST00000546190 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 ZNF484-202ENST00000375495 2867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 LINC02097-201ENST00000419257 2063 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 LINC01722-201ENST00000456265 3033 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 MATR3-215ENST00000510056 3040 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 MAPK10-287ENST00000641217 3037 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 GPR155-206ENST00000614352 7321 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 RBPJ-214ENST00000507561 1689 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 GJC1-207ENST00000590758 7566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 GCNT2-201ENST00000265012 4214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 PTPRD-214ENST00000540109 6210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 OR13F1-201ENST00000334726 960 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 RN7SKP250-201ENST00000363924 321 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 AL590762.1-201ENST00000391782 432 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 MTIF3-203ENST00000405591 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 E2F3-IT1-201ENST00000433182 400 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 TVP23CP1-201ENST00000450317 639 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 RN7SL168P-201ENST00000463821 279 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 RPS4XP23-201ENST00000487801 237 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 AC069439.2-201ENST00000496403 789 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 LINC02270-201ENST00000505386 610 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 AC139713.2-204ENST00000511042 342 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 AC124854.1-201ENST00000512210 511 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 LINC02482-202ENST00000515205 422 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 RNU6-1334P-201ENST00000516032 105 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 AC027309.1-201ENST00000519976 528 ntTSL 4 BASIC6.4□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 OR4V1P-201ENST00000525394 1140 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 LRTOMT-215ENST00000538478 814 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 PSMA6-204ENST00000553809 879 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 PSMA6-214ENST00000556506 763 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 AC023905.1-201ENST00000559799 1178 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 AC010809.1-201ENST00000560268 562 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 AC004381.1-201ENST00000565498 351 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 AC005180.2-201ENST00000585620 562 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 AC012254.2-203ENST00000588705 561 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 NDUFB9P1-201ENST00000604683 510 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 AC097512.1-201ENST00000511453 1309 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 BDNF-211ENST00000439476 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 LRRC37B-202ENST00000341671 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 LINC01152-201ENST00000472655 3578 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 GDNF-AS1-202ENST00000510986 1941 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 CDON-201ENST00000263577 4186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 SOX5-205ENST00000451604 4261 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 MMRN1-201ENST00000264790 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 OVAAL-201ENST00000442621 1489 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 RIOK2-202ENST00000508447 2149 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 MTO1-202ENST00000370305 2174 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 SERPINB7-206ENST00000540675 2193 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 SRGAP1-207ENST00000631006 8406 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 HPS5-205ENST00000438420 4147 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 CDY11P-201ENST00000447168 1651 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 Z95114.1-201ENST00000624264 14574 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 ZNF283-203ENST00000588797 2428 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 POLR2B-202ENST00000381227 4108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 AC011504.1-201ENST00000623331 4103 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 GUCY1B2-203ENST00000493639 2871 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 FSCB-201ENST00000340446 2938 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 EMC2-201ENST00000220853 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 NME5-201ENST00000265191 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 OR1A1-201ENST00000304094 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 SSX3-202ENST00000376893 800 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 PPIAP26-201ENST00000377951 522 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 MIR621-201ENST00000384919 96 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 RAB5CP1-201ENST00000395972 580 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
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