Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 ZFYVE9-202ENST00000357206 4567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 TGIF1-211ENST00000548489 1536 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 SLC30A7-203ENST00000370112 7898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 AC010132.4-201ENST00000569883 1368 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 FAM216B-202ENST00000537894 3300 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 ATP8B5P-203ENST00000430846 3962 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 AF127577.4-201ENST00000432230 5929 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
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CUL3Q13618 PTPRT-201ENST00000356100 12480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 PTPRT-202ENST00000373184 12483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 PTPRT-203ENST00000373187 12453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 AC010266.2-201ENST00000564741 3255 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 LINC01677-205ENST00000635636 2362 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 GTF2H3-201ENST00000228955 1472 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 EBF1-211ENST00000622875 4430 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 AC015689.2-201ENST00000528172 1738 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 ADGRL3-210ENST00000508946 4758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 LINC00240-204ENST00000607607 5607 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
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CUL3Q13618 ZNF836-201ENST00000322146 2811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 AC016576.1-201ENST00000637153 3585 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 ATP6V1A-201ENST00000273398 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 DSC3-201ENST00000360428 6939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 NRDC-213ENST00000539524 3417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 CABYR-207ENST00000486759 1664 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 CYP2C8-210ENST00000535898 1799 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 BIN2P1-201ENST00000504996 1530 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 PLAC1-201ENST00000359237 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
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CUL3Q13618 PRB3-201ENST00000381842 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
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CUL3Q13618 CCL20-202ENST00000409189 839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 AL161793.1-201ENST00000435021 445 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
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CUL3Q13618 CYCSP51-201ENST00000443545 318 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 AC103563.5-201ENST00000455643 364 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
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CUL3Q13618 AC139713.2-204ENST00000511042 342 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
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CUL3Q13618 SPANXN5-201ENST00000375511 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
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CUL3Q13618 C8orf34-AS1-201ENST00000512294 1600 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 CYP3A5-201ENST00000222982 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 MRPL47-201ENST00000259038 1126 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 CLDN10-201ENST00000299339 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 PPIAP24-201ENST00000328558 471 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 SEC61G-201ENST00000352861 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 RNA5SP140-201ENST00000364524 92 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 RN7SKP81-201ENST00000365603 331 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 MRPS6P2-201ENST00000381143 370 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 SDHC-203ENST00000392169 369 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 AL353133.1-201ENST00000407695 401 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 RN7SKP17-201ENST00000411242 351 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 AC011752.1-203ENST00000417609 582 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 CDC42P6-201ENST00000421246 576 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 LINC01762-201ENST00000423907 454 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
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CUL3Q13618 AC003989.1-201ENST00000434569 565 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 AC003991.1-210ENST00000434733 1048 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 TAS2R39-201ENST00000446620 1017 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 PHKA2-AS1-202ENST00000452900 656 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 KBTBD8-202ENST00000460576 984 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 C21orf62-202ENST00000479548 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 AC114728.1-201ENST00000488289 483 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 AC131392.1-201ENST00000506490 633 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 LINC01091-201ENST00000508111 645 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 AP002833.2-201ENST00000531585 462 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 TPRXL-210ENST00000532753 478 ntTSL 4 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 OR4A40P-201ENST00000533878 948 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
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