Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 XRCC5-201ENST00000392132 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
SPTBN1Q01082 FBXL13-201ENST00000313221 2744 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SPTBN1Q01082 SPANXN5-201ENST00000375511 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
SPTBN1Q01082 PDE4D-226ENST00000546160 7690 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SPTBN1Q01082 GPRIN3-201ENST00000333209 6260 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SPTBN1Q01082 PIP5K1B-201ENST00000265382 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
SPTBN1Q01082 ZNF625-ZNF20-201ENST00000430024 2651 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SPTBN1Q01082 GIGYF2-246ENST00000629305 7878 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SPTBN1Q01082 ZNF254-208ENST00000616028 3886 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SPTBN1Q01082 CRYGS-201ENST00000307944 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
SPTBN1Q01082 MIR375-201ENST00000362103 64 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SPTBN1Q01082 RNU1-19P-201ENST00000363306 165 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SPTBN1Q01082 SNORA70-201ENST00000384436 135 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SPTBN1Q01082 AC096537.2-201ENST00000413707 714 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SPTBN1Q01082 AL390115.1-201ENST00000425271 423 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SPTBN1Q01082 AC245047.5-201ENST00000437312 556 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SPTBN1Q01082 AC006482.1-201ENST00000448898 273 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SPTBN1Q01082 AC011625.1-201ENST00000455442 526 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SPTBN1Q01082 AC108866.1-203ENST00000504106 529 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SPTBN1Q01082 AC012560.1-203ENST00000510550 595 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SPTBN1Q01082 AL671862.1-201ENST00000515851 349 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SPTBN1Q01082 AC068672.3-201ENST00000524017 824 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SPTBN1Q01082 AC004825.1-201ENST00000555068 586 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SPTBN1Q01082 AC012370.2-201ENST00000597541 1080 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SPTBN1Q01082 LINC01450-201ENST00000443406 3263 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
SPTBN1Q01082 ADAM18-202ENST00000379866 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
SPTBN1Q01082 ZNF546-201ENST00000347077 7987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
SPTBN1Q01082 GPR18-202ENST00000397470 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
SPTBN1Q01082 FUT10-206ENST00000518672 3115 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
SPTBN1Q01082 FAM49B-226ENST00000523509 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
SPTBN1Q01082 RPGRIP1L-206ENST00000564374 3877 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SPTBN1Q01082 NPL-201ENST00000258317 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
SPTBN1Q01082 ABLIM1-202ENST00000369252 7690 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SPTBN1Q01082 SLC2A14-203ENST00000431042 3458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
SPTBN1Q01082 KCNMB2-202ENST00000420517 1563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SPTBN1Q01082 ECHDC1-210ENST00000454859 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
SPTBN1Q01082 MR1-205ENST00000434571 7479 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SPTBN1Q01082 NBPF8-201ENST00000583271 5330 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SPTBN1Q01082 DCDC2-201ENST00000378450 3684 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
SPTBN1Q01082 DCX-208ENST00000636035 9269 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SPTBN1Q01082 RNASEL-202ENST00000539397 4046 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SPTBN1Q01082 AMY1B-202ENST00000370080 1787 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SPTBN1Q01082 OR8U1-201ENST00000302270 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SPTBN1Q01082 OR6X1-201ENST00000327930 1058 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SPTBN1Q01082 MRAP-202ENST00000339944 440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
SPTBN1Q01082 METTL5-205ENST00000409837 936 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
SPTBN1Q01082 AL354890.1-201ENST00000413730 346 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SPTBN1Q01082 SEPT7-AS1-203ENST00000437235 3810 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SPTBN1Q01082 CLDN34-201ENST00000445307 995 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SPTBN1Q01082 SCARNA18.1-201ENST00000516330 83 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SPTBN1Q01082 AC008429.2-201ENST00000523057 864 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SPTBN1Q01082 AC113386.1-201ENST00000523584 381 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SPTBN1Q01082 OR9L1P-201ENST00000529493 933 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SPTBN1Q01082 DAAM1-208ENST00000556135 582 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SPTBN1Q01082 AC104151.1-201ENST00000563764 323 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SPTBN1Q01082 AC005703.3-201ENST00000579159 373 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SPTBN1Q01082 AL049539.1-201ENST00000611964 459 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SPTBN1Q01082 AC130456.6-201ENST00000623745 765 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SPTBN1Q01082 ALPK2-201ENST00000361673 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
SPTBN1Q01082 LINC00282-202ENST00000627246 4008 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SPTBN1Q01082 CLEC5A-206ENST00000546910 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
SPTBN1Q01082 HSD17B4-212ENST00000509514 2314 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
SPTBN1Q01082 BDNF-203ENST00000395978 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
SPTBN1Q01082 AL596244.1-201ENST00000567068 3779 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SPTBN1Q01082 PARP8-212ENST00000505697 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
SPTBN1Q01082 ATXN3-204ENST00000429774 6713 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
SPTBN1Q01082 GART-204ENST00000381831 3490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
SPTBN1Q01082 AC083806.2-201ENST00000617795 2685 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SPTBN1Q01082 TMC1-201ENST00000297784 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
SPTBN1Q01082 AMBN-203ENST00000613447 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SPTBN1Q01082 CTNND1-236ENST00000533667 4990 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
SPTBN1Q01082 ZNF415-204ENST00000594011 2630 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SPTBN1Q01082 C1orf162-202ENST00000369718 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SPTBN1Q01082 AL645927.1-201ENST00000396783 406 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SPTBN1Q01082 AC093155.2-201ENST00000420734 937 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SPTBN1Q01082 KRTAP3-4P-201ENST00000430780 280 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SPTBN1Q01082 MED28P4-201ENST00000433137 572 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SPTBN1Q01082 FOCAD-AS1-201ENST00000439876 359 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SPTBN1Q01082 ZNF619P1-201ENST00000446539 752 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SPTBN1Q01082 RN7SL643P-201ENST00000471845 291 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SPTBN1Q01082 RPL5P14-201ENST00000494197 878 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SPTBN1Q01082 AP000648.1-201ENST00000529682 397 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SPTBN1Q01082 AL031601.1-201ENST00000605702 394 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SPTBN1Q01082 AL591167.1-201ENST00000607321 456 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SPTBN1Q01082 AL139407.1-201ENST00000613826 1175 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SPTBN1Q01082 LINC02341-202ENST00000637462 1295 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SPTBN1Q01082 FSTL5-202ENST00000379164 4757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
SPTBN1Q01082 MACROD2-203ENST00000402914 4425 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
SPTBN1Q01082 SGO1-AS1-205ENST00000634837 1677 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SPTBN1Q01082 ARL17A-202ENST00000336125 3945 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
SPTBN1Q01082 ERAP2-202ENST00000437043 5705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
SPTBN1Q01082 NCOR1-201ENST00000268712 10720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
SPTBN1Q01082 CHN1-204ENST00000409597 1445 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SPTBN1Q01082 AP005139.1-201ENST00000580702 1647 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SPTBN1Q01082 ZNF343-207ENST00000612935 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SPTBN1Q01082 GTF2IRD2P1-201ENST00000449689 2749 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SPTBN1Q01082 SPTLC3-201ENST00000399002 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
SPTBN1Q01082 HIST1H2BD-201ENST00000289316 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
SPTBN1Q01082 OR4Q3-201ENST00000331723 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SPTBN1Q01082 RNFT1P3-201ENST00000340898 1052 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.5 ms