Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 C2orf16-201ENST00000408964 6200 ntAPPRIS P2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 LGSN-204ENST00000622415 1612 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 PLCE1-203ENST00000371385 6500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 RPL17-C18orf32-203ENST00000584895 1440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 SCARB2-207ENST00000638295 4507 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 CHD6-203ENST00000373233 10818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 AC074141.1-201ENST00000588129 2995 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 TMPRSS11BNL-202ENST00000510782 3202 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 DGKB-202ENST00000402815 5595 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 SLC3A1-203ENST00000409294 792 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 AC018878.1-201ENST00000419904 433 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 OSTCP4-201ENST00000424397 449 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 AL354707.3-201ENST00000427308 331 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 AL450003.1-201ENST00000439447 455 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 AL136460.1-201ENST00000442389 473 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 AC016908.1-201ENST00000442571 1219 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 WDR82P2-201ENST00000444540 928 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 TPRKBP1-201ENST00000456243 481 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 AC092905.1-201ENST00000467527 949 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 AP003385.3-201ENST00000472498 287 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 CAB39P1-201ENST00000502277 460 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 AC107909.1-201ENST00000523226 595 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 AP000851.1-202ENST00000542119 743 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 AL158058.1-201ENST00000549515 647 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 AC078778.2-201ENST00000553061 567 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 AC079793.1-201ENST00000553076 713 ntTSL 4 BASIC6.17□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 AC037479.1-201ENST00000558361 625 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 ANKRD20A5P-203ENST00000580200 566 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 AC025809.1-201ENST00000585336 560 ntTSL 4 BASIC6.17□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 AC027334.1-201ENST00000603257 310 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 BNIP3P35-201ENST00000604530 490 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 SMAGP-208ENST00000605627 577 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 AC073389.3-201ENST00000609434 935 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 TLR10-207ENST00000613579 3801 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 ZNF248-209ENST00000615949 518 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 MIR6823-201ENST00000622118 61 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 AC099329.1-203ENST00000629885 767 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 HPVC1-201ENST00000629899 1198 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 AC003992.1-201ENST00000635364 557 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 AC009452.1-201ENST00000640823 606 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 AC092692.1-201ENST00000623625 2595 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 NCOA6-202ENST00000374796 9311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 ZCCHC6-201ENST00000277141 5724 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 RUNX1T1-234ENST00000521553 1346 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 SH3YL1-203ENST00000403657 3540 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 SBNO1-201ENST00000267176 11121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 AL359955.1-201ENST00000455242 3275 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 DAOA-AS1-201ENST00000448407 2482 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 LIN7C-202ENST00000524596 4290 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 PHLDB2-211ENST00000481953 5474 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 NALCN-201ENST00000251127 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 TOPBP1-201ENST00000260810 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 OR5M2P-202ENST00000641241 4242 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 RXFP2-201ENST00000298386 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 IKZF3-210ENST00000377958 1837 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 ADGRL2-202ENST00000359929 4674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 FYB2-201ENST00000343433 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 MAPK10-261ENST00000641050 3109 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 OCM2-201ENST00000257627 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
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PGGT1BP53609 SMR3B-201ENST00000304915 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 CLECL1-201ENST00000327839 670 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
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PGGT1BP53609 EEF1AKMT1-201ENST00000382754 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
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PGGT1BP53609 AC112492.2-201ENST00000432774 1030 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 AL109807.1-201ENST00000438222 569 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 NPM1P23-201ENST00000440193 849 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 H3F3BP1-201ENST00000440551 403 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 CXCR2P1-202ENST00000443392 1074 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 AL500527.1-201ENST00000448532 255 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 AL513343.1-201ENST00000451818 792 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 LINC01596-201ENST00000503609 592 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
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PGGT1BP53609 ODF1-202ENST00000518835 368 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 AC016405.1-202ENST00000524348 758 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 AC013549.3-201ENST00000528792 419 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 VEPH1-219ENST00000537559 992 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 MYL2-203ENST00000548438 664 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 AC092652.2-201ENST00000552220 622 ntTSL 4 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 AC067805.1-201ENST00000559344 470 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 AC011462.3-201ENST00000598988 540 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 AC022001.1-201ENST00000605193 268 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 Metazoa_SRP.66-201ENST00000615609 282 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 AC089999.3-201ENST00000622440 577 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 ZNF566-202ENST00000424129 2644 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 LINC01527-201ENST00000419578 1997 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 NCOA7-201ENST00000229634 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 SCML2-202ENST00000398048 1334 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 BCORP1-202ENST00000441139 3461 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 CD96-202ENST00000352690 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
PGGT1BP53609 TTC3-201ENST00000354749 9084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
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