Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 BTG1P1-201ENST00000540396 508 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
PTPREP23469 MRPL42-204ENST00000548545 692 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
PTPREP23469 LINC02464-201ENST00000552060 368 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
PTPREP23469 PTCSC3-201ENST00000556013 571 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
PTPREP23469 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
PTPREP23469 Metazoa_SRP.146-201ENST00000619409 286 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
PTPREP23469 ZNF710-AS1-202ENST00000620791 2133 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
PTPREP23469 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
PTPREP23469 TRPM3-210ENST00000377111 4618 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
PTPREP23469 ZNF438-202ENST00000361310 3144 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
PTPREP23469 USP6-201ENST00000250066 7976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
PTPREP23469 LINC01142-201ENST00000440404 1457 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
PTPREP23469 C14orf105-201ENST00000216445 3082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
PTPREP23469 STXBP5L-205ENST00000472879 3067 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
PTPREP23469 ABCC5-205ENST00000427120 4697 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
PTPREP23469 GANC-206ENST00000566442 2512 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
PTPREP23469 AC025034.1-201ENST00000552778 1711 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
PTPREP23469 CDY1B-202ENST00000382407 2227 ntAPPRIS P1 BASIC9.39□□□□□ -0.91
PTPREP23469 MELK-201ENST00000298048 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
PTPREP23469 FAM107B-201ENST00000181796 3785 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
PTPREP23469 SOX6-210ENST00000528252 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
PTPREP23469 IFIT1P1-201ENST00000400497 1449 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
PTPREP23469 AC123767.1-201ENST00000519537 1439 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
PTPREP23469 ZNF337-201ENST00000252979 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
PTPREP23469 TPTE2-202ENST00000382978 1677 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
PTPREP23469 CREM-212ENST00000374728 1933 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
PTPREP23469 SEMA3C-203ENST00000419255 2415 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
PTPREP23469 SLC24A1-211ENST00000544319 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
PTPREP23469 AC114776.1-201ENST00000414159 4395 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
PTPREP23469 SELENOP-209ENST00000511224 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
PTPREP23469 CSNK1A1-205ENST00000515435 1856 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
PTPREP23469 KIAA1257-205ENST00000515659 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
PTPREP23469 SULT1C2-202ENST00000326853 2828 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
PTPREP23469 APBB2-224ENST00000513140 4166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
PTPREP23469 NOTCH2-206ENST00000579475 2954 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
PTPREP23469 RTN3-202ENST00000339997 4886 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
PTPREP23469 MYO1A-203ENST00000442789 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
PTPREP23469 CYP4A22-202ENST00000371890 1780 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
PTPREP23469 ADCY10P1-203ENST00000567255 4569 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
PTPREP23469 MRO-211ENST00000610511 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
PTPREP23469 FBXO11-202ENST00000403359 4055 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
PTPREP23469 ADK-201ENST00000286621 1169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
PTPREP23469 OR2M1P-201ENST00000318104 951 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
PTPREP23469 SNORD46-201ENST00000364043 104 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
PTPREP23469 TRDC-201ENST00000390477 720 ntAPPRIS P1 BASIC9.38□□□□□ -0.91
PTPREP23469 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
PTPREP23469 USP32P1-202ENST00000393005 3846 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
PTPREP23469 AAMDC-202ENST00000393427 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
PTPREP23469 MIR1272-201ENST00000408106 129 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
PTPREP23469 LSM5-205ENST00000409952 687 ntTSL 4 BASIC9.38□□□□□ -0.91
PTPREP23469 AC093642.1-201ENST00000412193 565 ntTSL 3 BASIC9.38□□□□□ -0.91
PTPREP23469 AC007742.1-201ENST00000425789 329 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
PTPREP23469 AC104843.2-201ENST00000427666 297 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
PTPREP23469 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
PTPREP23469 MTCO3P21-201ENST00000430791 643 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
PTPREP23469 ELOCP26-201ENST00000436067 329 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
PTPREP23469 HCG20-208ENST00000439406 1202 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
PTPREP23469 AC016396.1-201ENST00000440189 328 ntTSL 3 BASIC9.38□□□□□ -0.91
PTPREP23469 AL445465.1-204ENST00000440220 447 ntTSL 3 BASIC9.38□□□□□ -0.91
PTPREP23469 AL672167.1-201ENST00000441381 464 ntTSL 3 BASIC9.38□□□□□ -0.91
PTPREP23469 MTOR-AS1-202ENST00000445982 705 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
PTPREP23469 AL050341.1-201ENST00000447743 313 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
PTPREP23469 AL929410.2-201ENST00000451170 189 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
PTPREP23469 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
PTPREP23469 RPL7AP52-201ENST00000458096 790 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
PTPREP23469 RPL7P17-201ENST00000470927 724 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
PTPREP23469 AC109454.1-201ENST00000471205 498 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
PTPREP23469 AC111198.1-201ENST00000505575 606 ntTSL 4 BASIC9.38□□□□□ -0.91
PTPREP23469 AC112203.1-201ENST00000506315 1020 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
PTPREP23469 AC112196.1-201ENST00000515092 832 ntTSL 3 BASIC9.38□□□□□ -0.91
PTPREP23469 OR4C9P-201ENST00000532368 925 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
PTPREP23469 AL590385.2-201ENST00000537821 553 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
PTPREP23469 AC079598.4-201ENST00000549647 265 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
PTPREP23469 AC004817.1-201ENST00000553621 721 ntTSL 4 BASIC9.38□□□□□ -0.91
PTPREP23469 LINC00469-203ENST00000579749 583 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
PTPREP23469 AC114488.2-207ENST00000585660 700 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
PTPREP23469 FARSA-AS1-201ENST00000592636 241 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
PTPREP23469 ZNF675-208ENST00000601010 669 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
PTPREP23469 PRR13P3-201ENST00000603578 376 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
PTPREP23469 AC010680.4-201ENST00000605334 543 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
PTPREP23469 PRKCQ-AS1-218ENST00000624974 1132 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
PTPREP23469 AC104073.4-201ENST00000632111 598 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
PTPREP23469 STRADA-246ENST00000640397 1045 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
PTPREP23469 ATG13-203ENST00000524625 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
PTPREP23469 RPS17-209ENST00000561157 1909 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
PTPREP23469 TTC21A-205ENST00000440121 3941 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
PTPREP23469 A2ML1-205ENST00000539547 3460 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
PTPREP23469 LEKR1-201ENST00000356539 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
PTPREP23469 SKA2-201ENST00000330137 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
PTPREP23469 LINC00663-203ENST00000586885 2546 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
PTPREP23469 PSG9-205ENST00000443718 1421 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
PTPREP23469 SZT2-210ENST00000634258 11045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
PTPREP23469 LUARIS-201ENST00000436105 2916 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
PTPREP23469 KIF21A-204ENST00000544797 5040 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
PTPREP23469 AL049776.1-201ENST00000624600 2025 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
PTPREP23469 ROBO2-201ENST00000332191 5437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
PTPREP23469 MAPK8-201ENST00000360332 5438 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
PTPREP23469 CLDN16-201ENST00000264734 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PTPREP23469 ITK-201ENST00000422843 4528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PTPREP23469 ZNF569-202ENST00000392149 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.2 ms