Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 GCNT1P4-201ENST00000404096 329 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 RPA3-204ENST00000406109 434 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 SNORA77.2-201ENST00000408571 112 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 AL162430.2-201ENST00000422306 435 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 QKI-206ENST00000424802 954 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 AC116038.1-201ENST00000432250 408 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 AL136455.1-201ENST00000441083 1240 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 AL122008.4-201ENST00000446433 388 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 UBBP5-201ENST00000446970 266 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 RPL7AP23-201ENST00000482625 776 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 NPM1P27-201ENST00000502784 830 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 GOLGA5P1-201ENST00000507317 980 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 AC018709.1-201ENST00000509111 700 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 AC027343.2-201ENST00000513219 343 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 SNORA81.2-201ENST00000516868 170 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 AC122713.1-201ENST00000518368 1015 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 GLYATL1P2-201ENST00000529451 510 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 AL049836.2-201ENST00000553318 513 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 AC004232.1-201ENST00000571388 208 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 AC023421.2-202ENST00000586213 547 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 AC008770.4-201ENST00000586394 468 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 AL031665.2-201ENST00000620712 209 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 LINC02341-201ENST00000637043 824 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 IPO8-209ENST00000544829 3212 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 CASC18-202ENST00000548557 2503 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 C3orf35-203ENST00000425564 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 ICE2P1-201ENST00000512800 1849 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 ESRRG-203ENST00000361395 5216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 ESRRG-209ENST00000408911 5216 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 AC090518.1-201ENST00000562300 1495 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 RYR2-201ENST00000360064 14850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 FANCD2-205ENST00000431693 2450 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 TLR10-208ENST00000622002 3673 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 KCNJ10-207ENST00000638868 3883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 LINC01378-201ENST00000422145 2516 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 LINC00700-201ENST00000413603 2097 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 SMG1P5-202ENST00000529428 4219 ntBASIC6□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 SMG1P2-201ENST00000566127 4221 ntBASIC6□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 NRG3-202ENST00000372142 3136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 ZFP62-201ENST00000502412 3415 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 ARGFX-201ENST00000334384 992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 S100A7L2-201ENST00000368725 339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 OR2W1-201ENST00000377175 1028 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 AC117402.1-202ENST00000383686 820 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 AL359694.1-201ENST00000403247 604 ntBASIC6□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 CYCSP17-201ENST00000407870 315 ntBASIC6□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 FAM183A-205ENST00000410048 500 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 AL713923.1-201ENST00000414071 378 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 XIST-201ENST00000416330 750 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 AL353148.1-202ENST00000424701 551 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 AKR1D1-203ENST00000432161 1236 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 NAP1L4P3-201ENST00000432820 1147 ntBASIC6□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 AC114812.2-201ENST00000439336 663 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 AMYP1-201ENST00000440059 1023 ntBASIC6□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 AL137186.1-201ENST00000440436 480 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 RNF219-AS1-202ENST00000444769 590 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 AC068759.1-201ENST00000447709 470 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 AC104109.1-201ENST00000498563 436 ntBASIC6□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 AC091868.2-201ENST00000506717 556 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 AL390198.2-201ENST00000510553 222 ntBASIC6□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 AC108103.1-201ENST00000511286 446 ntBASIC6□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 AC108063.1-201ENST00000513586 414 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 SUMO2P19-201ENST00000518920 295 ntBASIC6□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 LDHC-203ENST00000535809 757 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 LDHC-205ENST00000537486 583 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 OR5AP2-201ENST00000544374 1006 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 RPL41P2-201ENST00000544920 409 ntBASIC6□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 MYL2-203ENST00000548438 664 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 HMGN2P47-201ENST00000559378 272 ntBASIC6□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 AC092718.4-201ENST00000566639 716 ntBASIC6□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 TMEM202-202ENST00000567679 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 AP003774.2-201ENST00000569737 558 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 LINC00921-201ENST00000572123 243 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 SYPL1P2-201ENST00000582878 727 ntBASIC6□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 LINC01906-201ENST00000582962 499 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 AC006305.2-201ENST00000589617 552 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 AL583832.1-201ENST00000603227 784 ntBASIC6□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 SMR3B-204ENST00000614072 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 AC010333.3-201ENST00000615100 402 ntBASIC6□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 AC093227.1-201ENST00000588040 1360 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 MYPN-202ENST00000358913 6013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 PDE4D-216ENST00000507116 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 AP002478.1-201ENST00000577848 1455 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 MFSD8-201ENST00000296468 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 CDKL4-201ENST00000378803 1567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 LINC01741-201ENST00000427173 1666 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 GVINP1-201ENST00000526769 8438 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 PGBD4-201ENST00000397766 6612 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 GPM6A-201ENST00000280187 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 MEIOC-202ENST00000409464 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 MBNL2-202ENST00000345429 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 SCRN1-202ENST00000409497 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 ZNF813-201ENST00000396403 6151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 AASDH-203ENST00000502617 3004 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 FAM13C-219ENST00000621119 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 SEL1L3-203ENST00000502949 3500 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 OR8B8-202ENST00000642064 3914 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 LINC01297-204ENST00000621052 4222 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 VCAN-203ENST00000343200 9455 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 DCX-211ENST00000637570 6162 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
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