Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 OR9A1P-202ENST00000484361 945 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 RN7SL649P-201ENST00000496974 275 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 AC023818.1-201ENST00000498379 384 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 HMGN1P16-201ENST00000508308 283 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 AC108103.1-201ENST00000511286 446 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 ODF1-202ENST00000518835 368 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 GTF2IP11-201ENST00000526931 420 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 AP001893.3-201ENST00000532357 569 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 RERGL-203ENST00000538724 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 UBE2N-204ENST00000549833 960 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 DAAM1-208ENST00000556135 582 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 AL161752.1-201ENST00000557721 263 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 AC005632.2-201ENST00000564271 828 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 AC009054.1-201ENST00000568140 427 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 MIR3154-201ENST00000577829 84 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 AC010326.3-201ENST00000597780 679 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 LAPTM4BP2-201ENST00000604542 446 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 AC091193.1-201ENST00000604640 448 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 AL008723.3-201ENST00000608926 449 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 AC138627.1-204ENST00000641894 765 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 CALN1-204ENST00000405452 8571 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 CDKAL1-204ENST00000613575 1673 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 ITGB1-201ENST00000302278 3640 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 NCKAP5-203ENST00000405974 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 CR1-201ENST00000367049 7470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 MYBL1-206ENST00000524176 2148 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 PRICKLE1-202ENST00000445766 4075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 ECT2L-205ENST00000541398 4483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 GYPA-214ENST00000641688 1764 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 USP16-201ENST00000334352 3004 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 AC079753.1-201ENST00000623243 3868 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 AC007744.1-201ENST00000607540 2289 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 ESF1-201ENST00000202816 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 SLC14A1-208ENST00000586142 2846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 AC090181.3-201ENST00000624777 1514 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 LINC02008-201ENST00000470263 1951 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 LINC02092-201ENST00000455366 2472 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 KIF20A-205ENST00000508792 2935 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 AC020656.2-201ENST00000613291 5309 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 ZNF528-201ENST00000360465 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 ATP8B5P-203ENST00000430846 3962 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 MGAM2-201ENST00000477922 7867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 AC090220.1-201ENST00000593078 1699 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 OR7A17-202ENST00000641113 3639 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 THRB-203ENST00000396671 7506 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 TMOD2-201ENST00000249700 9191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 ZNF92-201ENST00000328747 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 OR4Q3-201ENST00000331723 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 OR6C1-201ENST00000379668 1064 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 DEFB126-201ENST00000382398 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 MIR188-201ENST00000385034 86 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 RN7SKP144-201ENST00000411108 279 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 AC104777.1-202ENST00000413247 774 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 AC112492.2-201ENST00000432774 1030 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 AC099796.1-201ENST00000433377 683 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 SOCS5P1-201ENST00000440415 949 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 AC113331.2-201ENST00000445557 926 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 AF015262.1-201ENST00000455028 698 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 AC019084.1-201ENST00000457337 432 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 RN7SL362P-201ENST00000494228 267 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 USP17L23-201ENST00000506619 551 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 RNA5SP400-201ENST00000517155 111 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 AC022616.2-201ENST00000523185 300 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 AC073916.1-201ENST00000545095 130 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 C16orf97-205ENST00000568524 406 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 AC005332.4-201ENST00000592752 579 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 ZNF248-209ENST00000615949 518 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 PCBP1-AS1-286ENST00000625888 765 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 AF067845.4-201ENST00000633198 480 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 MYOCOS-203ENST00000637303 564 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 LARP4-203ENST00000398473 6427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 FIGN-201ENST00000333129 9536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 MCFD2-206ENST00000409800 3955 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 CAMSAP2-201ENST00000236925 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 ARIH1-201ENST00000379887 21681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 MEIOB-205ENST00000470044 1857 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 OFD1P15Y-201ENST00000411536 1392 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 CPED1-206ENST00000450913 2501 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 C11orf1-203ENST00000529270 1437 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 MKI67-201ENST00000368653 11417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 AC120036.2-201ENST00000509729 1474 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 C9-201ENST00000263408 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 INTS12-211ENST00000618810 1502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 CPS1-212ENST00000619804 1542 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 AC011369.2-201ENST00000624423 1567 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 EPS8-207ENST00000540613 2204 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 AC005674.2-201ENST00000561486 3510 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 PPFIA2-203ENST00000443686 3782 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 LPAR6-201ENST00000345941 2428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 USP46-202ENST00000451218 4622 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 ZNF605-204ENST00000392321 6156 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 NLGN1-202ENST00000401917 1827 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 HSD17B4-202ENST00000414835 2551 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 MYO3B-202ENST00000408978 5529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 RAD17P2-201ENST00000451754 1977 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 TMCC1P1-201ENST00000518897 1980 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 LINC02388-201ENST00000550678 1975 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 LINC01224-203ENST00000596283 2766 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 BRCA1-203ENST00000357654 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 STAG3L4-201ENST00000352103 530 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.1 ms