Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

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Length 2,028 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 C3orf14-207ENST00000542214 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
CCDC88CQ9P219 AC012555.2-201ENST00000549448 413 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.45
CCDC88CQ9P219 AL354740.1-205ENST00000586413 1230 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
CCDC88CQ9P219 AC012370.2-201ENST00000597541 1080 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
CCDC88CQ9P219 LINC01435-212ENST00000601212 742 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
CCDC88CQ9P219 IGKV2OR2-10-201ENST00000613976 311 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
CCDC88CQ9P219 RASSF9-201ENST00000361228 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
CCDC88CQ9P219 ZNF727-201ENST00000456806 1679 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.45
CCDC88CQ9P219 SPANXN5-201ENST00000375511 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 POT1-202ENST00000393329 3950 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 SRGAP1-206ENST00000543397 5652 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 AC020743.2-201ENST00000639870 1370 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 SCN2A-215ENST00000637266 8610 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 AC068733.2-201ENST00000605434 1418 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 SORCS1-210ENST00000622431 6701 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 GLIPR1L2-202ENST00000378692 1903 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 PCDH15-227ENST00000614895 9249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 OR3A3-203ENST00000641141 3800 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 SMG1-201ENST00000330588 1588 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 ESRRG-201ENST00000359162 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 MCM8-201ENST00000265187 3442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 GPR89A-213ENST00000534502 1644 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 CDKL5-205ENST00000623535 12533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 CFAP61-201ENST00000245957 4082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 FAM47E-202ENST00000502320 6249 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 GSTA5-201ENST00000284562 845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 DYDC1-202ENST00000372204 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 MIR621-201ENST00000384919 96 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 RPL12P11-201ENST00000439970 501 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 AC007998.1-201ENST00000474156 672 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 LINC02512-201ENST00000509548 429 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 AC108103.1-201ENST00000511286 446 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 OR4A40P-201ENST00000533878 948 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 CCDC60-203ENST00000536742 886 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 CTNNA3-205ENST00000545309 555 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 AC027667.1-201ENST00000545814 304 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 AL355075.2-201ENST00000555435 478 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 LINC01906-201ENST00000582962 499 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 AC100863.1-201ENST00000584843 560 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 AC073333.2-201ENST00000603589 769 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 AC096708.4-201ENST00000620563 552 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 AC011455.2-201ENST00000599320 3336 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 AC073342.2-201ENST00000595842 1800 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 USP16-201ENST00000334352 3004 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 ALG13-203ENST00000394780 4133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 SREK1IP1-204ENST00000513458 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 BRAFP1-201ENST00000445336 2703 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 AC006305.1-201ENST00000382897 2558 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 PCDH11Y-204ENST00000400457 9039 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 IL21-AS1-201ENST00000417927 3748 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 TNP1-201ENST00000236979 407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 SDHAF3-201ENST00000360382 731 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 FIG4-202ENST00000368941 791 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 AL096800.1-201ENST00000405326 893 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 CDY8P-201ENST00000428380 1279 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 LINC00390-201ENST00000432331 340 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 CDY20P-201ENST00000447528 1279 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 AL133351.3-201ENST00000454998 193 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 AL022319.1-201ENST00000458183 1167 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 AP002884.1-201ENST00000479691 655 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 LINC02114-201ENST00000503757 801 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 AC106800.3-201ENST00000511389 308 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 AC011853.1-201ENST00000518911 454 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 UTP14C-201ENST00000521776 5529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 PSMA4-209ENST00000559082 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
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CCDC88CQ9P219 TEX41-218ENST00000596540 882 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 AL683813.2-201ENST00000605245 502 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 AL596275.2-208ENST00000641192 594 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 ZNF607-202ENST00000395835 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 AC016747.4-201ENST00000462959 1383 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
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CCDC88CQ9P219 KIAA2012-205ENST00000541917 3543 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 ZNF192P1-201ENST00000440790 1628 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 PARP8-212ENST00000505697 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 CDKAL1-204ENST00000613575 1673 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 TNRC6B-201ENST00000301923 15958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 AP002004.1-203ENST00000531091 1768 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 AC078842.2-201ENST00000447529 1835 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 FAM13C-219ENST00000621119 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 SLC16A4-201ENST00000369779 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 LINC02275-201ENST00000508313 4365 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 CRB1-209ENST00000535699 5140 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 NRDC-213ENST00000539524 3417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 OR4Q3-201ENST00000331723 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 DPH5-201ENST00000342173 1143 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 HMGN1P20-201ENST00000411849 300 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 AL138831.1-201ENST00000415144 209 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 ODF2-AS1-201ENST00000420801 407 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 AC115283.1-201ENST00000427353 400 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 AF130359.1-201ENST00000444868 438 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 AC073288.1-201ENST00000466291 469 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 LINC01214-201ENST00000471222 335 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 IGKV3D-34-201ENST00000522638 302 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 LINC00534-203ENST00000523406 812 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 AC023968.1-201ENST00000560719 475 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 MIR4502-201ENST00000580432 81 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 ODF4-202ENST00000584943 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 LINC00907-202ENST00000585639 915 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 AL138895.2-201ENST00000603019 178 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
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