Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW5

TM6SF1, Transmembrane 6 superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF1Q9BZW5 RRH-201ENST00000317735 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 STS-201ENST00000217961 6521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 ALPK2-201ENST00000361673 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 FRYL-202ENST00000358350 11706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 LRRC7-203ENST00000370958 2375 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 FAM205BP-203ENST00000455647 3752 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 CTAGE5-204ENST00000341749 2912 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 AL626787.1-201ENST00000366136 594 ntTSL 4 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 C6orf48-208ENST00000395788 815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 PPARG-204ENST00000397000 1122 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 AL035696.2-201ENST00000407941 709 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 AC009965.1-201ENST00000411436 570 ntTSL 4 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 AC000058.1-201ENST00000415249 536 ntTSL 4 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 AC244453.3-201ENST00000426275 459 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 AC104463.2-201ENST00000428573 314 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 SMIM30-204ENST00000441359 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 AL645936.1-201ENST00000441979 518 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 AC099670.1-201ENST00000455141 783 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 SNRPCP11-201ENST00000492453 205 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 MRPL57P6-201ENST00000506570 309 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 MGC32805-204ENST00000509993 783 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 AC025766.1-201ENST00000514061 409 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 LDHBP3-201ENST00000514909 822 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 AP003028.1-203ENST00000525832 444 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 LRTOMT-218ENST00000541614 726 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 RN7SL66P-201ENST00000582099 264 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 SETSIP-202ENST00000596516 909 ntAPPRIS P2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 AL355974.3-201ENST00000617383 467 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 AC084816.1-204ENST00000628326 631 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 AF067845.4-201ENST00000633198 480 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 AC010325.3-201ENST00000641084 394 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 CTNND1-212ENST00000525902 4984 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 CTNND1-214ENST00000526772 4966 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 NEDD9-202ENST00000379446 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 LINC01504-201ENST00000436054 2078 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 ZNF607-202ENST00000395835 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 STK3-216ENST00000523601 3107 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 USP37-205ENST00000454775 5019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 LINC02183-201ENST00000637822 1732 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 GNS-202ENST00000418919 4877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 AC092958.1-201ENST00000467198 2569 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 SH3YL1-203ENST00000403657 3540 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 OR4N5-202ENST00000641086 2187 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 ADAMTS9-AS2-201ENST00000460833 3691 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 SLC16A6-201ENST00000327268 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 MTPAP-201ENST00000263063 5601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 IKZF3-210ENST00000377958 1837 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 AC010329.1-201ENST00000593903 8328 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 PSMA6P1-201ENST00000400275 741 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 MRPL35-203ENST00000409180 651 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 RN7SKP144-201ENST00000411108 279 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 RN7SKP108-201ENST00000411367 328 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 AC104823.1-201ENST00000413290 989 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 SCP2-207ENST00000435345 894 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 AC073409.1-201ENST00000451749 269 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 AC068633.1-202ENST00000476460 458 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 LINC02114-201ENST00000503757 801 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 LINC01091-201ENST00000508111 645 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 RNU2-45P-201ENST00000516068 187 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 AL080312.2-201ENST00000613001 630 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 MIR6823-201ENST00000622118 61 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 MVP-219ENST00000629059 120 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 LSAMP-207ENST00000539563 8821 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 CLCN3-201ENST00000347613 3635 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 AC022325.1-201ENST00000502748 2199 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 NOVA1-206ENST00000539517 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 GIGYF2-246ENST00000629305 7878 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 ZNF432-202ENST00000594154 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 TRAPPC2-203ENST00000380579 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 ADGRL2-202ENST00000359929 4674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 EIF3EP1-201ENST00000433978 1316 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 ATP13A4-204ENST00000400270 1458 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 ZC3H11A-202ENST00000367210 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 TMPRSS15-201ENST00000284885 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 LINC00698-203ENST00000468072 1957 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 PCNX4-201ENST00000317623 17339 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 FSTL5-201ENST00000306100 4831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 AC022164.1-201ENST00000568767 2673 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 SCGB1D4-201ENST00000358585 439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 FPGT-TNNI3K-201ENST00000370893 1195 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 PSMD10-206ENST00000372296 878 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 TRAV13-1-201ENST00000390436 360 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 AC245096.1-201ENST00000413104 546 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 AL445465.1-208ENST00000419709 506 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 LINC01058-201ENST00000420694 448 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 AC245884.2-201ENST00000426257 404 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 AL162727.2-201ENST00000428429 395 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 AL022337.1-201ENST00000434510 357 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 AL031963.1-201ENST00000447644 695 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 AC004890.1-201ENST00000461005 181 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 H3F3AP5-201ENST00000475267 429 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 RN7SL836P-201ENST00000476140 296 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 USP9YP2-201ENST00000504503 1000 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 USP9YP1-201ENST00000513521 1002 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 IGHV7-34-1-201ENST00000519200 350 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 AC068672.2-201ENST00000524022 336 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 AC021269.1-201ENST00000526860 705 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 LINC02441-201ENST00000543651 552 ntTSL 4 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 BICD1-206ENST00000551086 423 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 TSSK4-207ENST00000556621 896 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.3 ms