Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F7

GCSAM, Germinal center-associated signaling and motility protein, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSAMQ8N6F7 MUC1-221ENST00000610359 1101 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
GCSAMQ8N6F7 MUC1-227ENST00000615517 951 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
GCSAMQ8N6F7 Metazoa_SRP.77-201ENST00000616915 252 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
GCSAMQ8N6F7 AC068213.1-201ENST00000625124 226 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
GCSAMQ8N6F7 AC007114.2-201ENST00000576014 4281 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
GCSAMQ8N6F7 SMC1A-202ENST00000375340 9930 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
GCSAMQ8N6F7 LINC00284-201ENST00000423211 3208 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
GCSAMQ8N6F7 CYP3A5-201ENST00000222982 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
GCSAMQ8N6F7 POLR2B-202ENST00000381227 4108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
GCSAMQ8N6F7 LINC02047-201ENST00000494761 1371 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
GCSAMQ8N6F7 AC010624.4-201ENST00000597606 1351 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
GCSAMQ8N6F7 BNC1-202ENST00000569704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
GCSAMQ8N6F7 CDY5P-201ENST00000411487 1580 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
GCSAMQ8N6F7 CDY9P-201ENST00000451397 1580 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
GCSAMQ8N6F7 AC024341.1-201ENST00000526444 1552 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
GCSAMQ8N6F7 AC005332.9-201ENST00000620266 2921 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
GCSAMQ8N6F7 MDN1-205ENST00000629399 17400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
GCSAMQ8N6F7 ZNF644-204ENST00000370440 5702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
GCSAMQ8N6F7 IL31RA-202ENST00000354961 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
GCSAMQ8N6F7 ZFY-202ENST00000383052 5113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
GCSAMQ8N6F7 APOL4-203ENST00000352371 3227 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
GCSAMQ8N6F7 UEVLD-202ENST00000320750 1799 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
GCSAMQ8N6F7 EEF1A1P12-201ENST00000443590 1346 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
GCSAMQ8N6F7 FRK-201ENST00000606080 13230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
GCSAMQ8N6F7 L3MBTL3-209ENST00000533560 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
GCSAMQ8N6F7 CTNND1-212ENST00000525902 4984 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
GCSAMQ8N6F7 CTNND1-214ENST00000526772 4966 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
GCSAMQ8N6F7 MEF2C-226ENST00000625674 4343 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
GCSAMQ8N6F7 AC105105.2-201ENST00000590797 4521 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
GCSAMQ8N6F7 AL132656.2-201ENST00000482985 1837 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
GCSAMQ8N6F7 RAD51B-210ENST00000487270 2596 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
GCSAMQ8N6F7 MARVELD2-204ENST00000454295 4376 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
GCSAMQ8N6F7 KLRF1-201ENST00000279545 1091 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
GCSAMQ8N6F7 TMEM31-201ENST00000319560 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
GCSAMQ8N6F7 FAM183A-201ENST00000335282 488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
GCSAMQ8N6F7 TINAG-202ENST00000370864 692 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
GCSAMQ8N6F7 AL023284.3-201ENST00000407767 334 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
GCSAMQ8N6F7 MRPL35-203ENST00000409180 651 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
GCSAMQ8N6F7 FAM183A-205ENST00000410048 500 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
GCSAMQ8N6F7 AL138828.1-204ENST00000413745 898 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
GCSAMQ8N6F7 PVALB-204ENST00000417718 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
GCSAMQ8N6F7 RPL23AP85-201ENST00000421838 433 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
GCSAMQ8N6F7 DPYD-AS2-201ENST00000422259 788 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
GCSAMQ8N6F7 AC114498.1-201ENST00000423796 607 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
GCSAMQ8N6F7 NPM1P26-201ENST00000426339 738 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
GCSAMQ8N6F7 AL390879.2-203ENST00000426943 1121 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
GCSAMQ8N6F7 MTUS2-AS2-202ENST00000434779 720 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
GCSAMQ8N6F7 AL451136.1-201ENST00000435399 325 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
GCSAMQ8N6F7 LINC00446-202ENST00000438327 357 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
GCSAMQ8N6F7 AL031681.1-201ENST00000443304 400 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
GCSAMQ8N6F7 MGAT2P1-201ENST00000449718 797 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
GCSAMQ8N6F7 CYCSP53-201ENST00000455540 265 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
GCSAMQ8N6F7 KCNIP2-211ENST00000461105 858 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
GCSAMQ8N6F7 TOPORSLP1-202ENST00000469756 969 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
GCSAMQ8N6F7 MRPL57P6-201ENST00000506570 309 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
GCSAMQ8N6F7 OR10D4P-201ENST00000525892 951 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
GCSAMQ8N6F7 AC108136.1-201ENST00000530350 631 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
GCSAMQ8N6F7 PRH1-204ENST00000539853 837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
GCSAMQ8N6F7 AC005832.1-201ENST00000544380 572 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
GCSAMQ8N6F7 AC107032.2-201ENST00000551082 386 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
GCSAMQ8N6F7 ADAMTS7P4-205ENST00000560651 453 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
GCSAMQ8N6F7 TAT-AS1-201ENST00000561529 873 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
GCSAMQ8N6F7 AC004381.1-201ENST00000565498 351 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
GCSAMQ8N6F7 MIR4301-201ENST00000577203 66 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
GCSAMQ8N6F7 MTND2P13-201ENST00000577438 1039 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
GCSAMQ8N6F7 AC007923.1-201ENST00000577970 505 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
GCSAMQ8N6F7 CHMP1B-AS1-201ENST00000586474 553 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
GCSAMQ8N6F7 ZNF137P-202ENST00000597158 308 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
GCSAMQ8N6F7 AC006262.3-201ENST00000597337 258 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
GCSAMQ8N6F7 AC004805.3-201ENST00000603178 310 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
GCSAMQ8N6F7 AC005014.3-201ENST00000605985 190 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
GCSAMQ8N6F7 C5orf63-208ENST00000607731 478 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
GCSAMQ8N6F7 TLR10-207ENST00000613579 3801 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
GCSAMQ8N6F7 KLRF1-208ENST00000617889 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
GCSAMQ8N6F7 LINC00216-201ENST00000623548 1126 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
GCSAMQ8N6F7 TTN-AS1-268ENST00000629094 604 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
GCSAMQ8N6F7 PIGA-216ENST00000637296 2113 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
GCSAMQ8N6F7 AC011346.1-204ENST00000638089 1210 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
GCSAMQ8N6F7 INPP5F-208ENST00000637174 3168 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
GCSAMQ8N6F7 IFIT1-202ENST00000546318 4613 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
GCSAMQ8N6F7 RPE65-201ENST00000262340 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
GCSAMQ8N6F7 SLC14A1-208ENST00000586142 2846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
GCSAMQ8N6F7 NEK5-201ENST00000355568 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
GCSAMQ8N6F7 AC009135.2-201ENST00000624136 1768 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
GCSAMQ8N6F7 CCAT2-201ENST00000630920 1752 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
GCSAMQ8N6F7 GYPA-214ENST00000641688 1764 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
GCSAMQ8N6F7 ARHGEF6-201ENST00000250617 6019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
GCSAMQ8N6F7 GPR1-209ENST00000612892 2565 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
GCSAMQ8N6F7 G6PC-201ENST00000253801 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
GCSAMQ8N6F7 NEK2P2-201ENST00000438441 1338 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
GCSAMQ8N6F7 AC044839.1-206ENST00000635559 1324 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
GCSAMQ8N6F7 CASP5-201ENST00000260315 1414 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
GCSAMQ8N6F7 RPL17-C18orf32-203ENST00000584895 1440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
GCSAMQ8N6F7 SP110-204ENST00000392048 1937 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
GCSAMQ8N6F7 ZNF211-205ENST00000391703 2239 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
GCSAMQ8N6F7 PAPD4-203ENST00000428308 2204 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
GCSAMQ8N6F7 SATL1-202ENST00000509231 2224 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
GCSAMQ8N6F7 AP000547.3-204ENST00000588548 2523 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
GCSAMQ8N6F7 ARPP21-201ENST00000187397 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
GCSAMQ8N6F7 BDNF-211ENST00000439476 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.8 ms