Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 ZNF519P4-201ENST00000514008 125 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 ODF1-202ENST00000518835 368 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 AC022973.3-201ENST00000521014 467 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 IGLV3-6-201ENST00000523937 250 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 CRYAB-205ENST00000526180 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 BCAS2P1-201ENST00000528022 632 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 FAM66C-206ENST00000535567 724 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 AC069234.2-202ENST00000535720 583 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
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CCDC142Q17RM4 AL133368.2-201ENST00000556978 386 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
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CCDC142Q17RM4 AC005291.1-201ENST00000577743 641 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 SEPT4-AS1-202ENST00000580589 653 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 AC090371.2-202ENST00000582239 644 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 AC010271.1-201ENST00000599050 558 ntTSL 4 BASIC6.84□□□□□ -1.31
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CCDC142Q17RM4 AP000654.1-201ENST00000602510 1192 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
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CCDC142Q17RM4 AC091193.1-201ENST00000604640 448 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 RPSAP75-201ENST00000605848 301 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 AL135999.3-201ENST00000610501 812 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 TMEM154-204ENST00000613578 486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
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CCDC142Q17RM4 AC005332.9-201ENST00000620266 2921 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 ARL17A-202ENST00000336125 3945 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
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CCDC142Q17RM4 LINC01224-203ENST00000596283 2766 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 PCDH18-202ENST00000412923 5102 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
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CCDC142Q17RM4 CDKAL1-204ENST00000613575 1673 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 CTNND1-212ENST00000525902 4984 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 CTNND1-214ENST00000526772 4966 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 CLCC1-204ENST00000369968 4151 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 LCP2-201ENST00000046794 4678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 CACNA1E-202ENST00000358338 14700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 MECOM-209ENST00000472280 3593 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 THAP6-201ENST00000311638 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 IL1RL1-202ENST00000311734 3994 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 LRRC49-204ENST00000544974 6605 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 TMEM167B-201ENST00000338272 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
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CCDC142Q17RM4 LINC01618-201ENST00000514957 727 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
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CCDC142Q17RM4 MYL12A-209ENST00000580887 899 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
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CCDC142Q17RM4 ZC3H11A-204ENST00000367214 3451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 ADAM7-204ENST00000520720 1870 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 ESRRG-208ENST00000391890 5542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 IFIT1-202ENST00000546318 4613 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 RPGRIP1L-205ENST00000563746 4193 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 ZC3H12C-202ENST00000453089 9542 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 DYNC2LI1-201ENST00000260605 1399 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 SSX5-201ENST00000311798 1384 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 LAMA2-201ENST00000421865 9640 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 AC011346.1-201ENST00000638059 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 AC001226.2-204ENST00000638101 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 ZNF532-222ENST00000591083 5324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 XRCC5-201ENST00000392132 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 STT3A-214ENST00000531491 2160 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 MBNL1-204ENST00000324210 5465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 MFSD8-213ENST00000641134 1327 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 ZNF233-205ENST00000592581 2938 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 GTF2H5-201ENST00000607778 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 TMPRSS11F-201ENST00000356291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 OR2M3-202ENST00000641626 9913 ntAPPRIS P1 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 SDHAF3-201ENST00000360382 731 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 PSMA6P1-201ENST00000400275 741 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 MTND3P20-201ENST00000407663 186 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
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