Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 AC126120.1-201ENST00000431082 470 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 AL355357.1-201ENST00000433531 417 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 EIF4A1P6-201ENST00000448133 1210 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 RPS27AP2-201ENST00000457576 465 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 BICD1-206ENST00000551086 423 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 AC079414.1-201ENST00000563114 488 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 ARPP19-205ENST00000563566 568 ntTSL 4 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 MIR6798-201ENST00000612887 67 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 OR7A1P-202ENST00000641542 1158 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 UFL1-201ENST00000369278 4224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 MAPK10-261ENST00000641050 3109 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 NCKAP5-203ENST00000405974 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 DAZ3-202ENST00000382365 3503 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 AL359976.1-201ENST00000418655 3528 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
CACNA1SQ13698 Z83820.1-201ENST00000456978 1499 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 TPTE2P2-202ENST00000605924 2113 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 MTIF2-201ENST00000263629 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 NEUROD4-201ENST00000242994 3953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 PAX6-270ENST00000640368 6975 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 PDZK1P1-202ENST00000425209 1350 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 CC2D2B-202ENST00000410012 1792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 TMEM161B-211ENST00000512429 1796 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 ZNF682-201ENST00000358523 2161 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 AC024587.1-201ENST00000505925 2157 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 AL590763.1-201ENST00000398297 1545 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 AC027088.4-201ENST00000611559 1947 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 TMED8-201ENST00000216468 7784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 ERRFI1-202ENST00000467067 2097 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 PRSS37-201ENST00000350549 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 MIR375-201ENST00000362103 64 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 AC009498.1-201ENST00000419860 541 ntTSL 4 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 AL121776.1-201ENST00000429337 372 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 LINC00383-201ENST00000433664 817 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 CASP5-205ENST00000444749 1237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 LINC01831-201ENST00000449772 493 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 RN7SL466P-201ENST00000497546 295 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 LINC02485-202ENST00000511899 770 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 AC018607.1-201ENST00000518552 673 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 MOCS2-208ENST00000527216 707 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 LINC02454-201ENST00000539116 589 ntTSL 4 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 SMARCE1P3-201ENST00000553649 1231 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 AL589674.2-201ENST00000604304 337 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 AL021918.2-201ENST00000613415 194 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 AC021766.1-201ENST00000624404 741 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 AL132640.3-201ENST00000630473 177 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 INPP5F-208ENST00000637174 3168 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 PABPC1P6-201ENST00000445594 1829 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 AC112243.1-201ENST00000623949 3851 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 LYRM4-201ENST00000330636 7312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 RSAD2-201ENST00000382040 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 ADAM29-202ENST00000404450 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 ARCN1-202ENST00000359415 4038 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 PLEKHM3-202ENST00000427836 9807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 CCDC190-202ENST00000367911 1395 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 EZH1-201ENST00000415827 4608 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 ZC2HC1B-201ENST00000237275 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 CRYGS-201ENST00000307944 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 AL391422.1-201ENST00000402155 436 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 HMGB1P20-201ENST00000402555 677 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 OR2AT2P-201ENST00000413438 905 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 AC114803.1-201ENST00000417355 311 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 AC004882.2-201ENST00000420180 244 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 AL359853.3-201ENST00000423879 544 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 AC073283.2-202ENST00000426892 591 ntTSL 4 BASIC7.51□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 NANOGP4-201ENST00000427230 913 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 NPM1P22-201ENST00000427761 952 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 AC009487.1-201ENST00000444164 403 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 MYO5BP2-201ENST00000449815 1277 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 AC018450.1-202ENST00000465880 529 ntTSL 4 BASIC7.51□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 AC073288.1-201ENST00000466291 469 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 IGKV2-18-201ENST00000522607 343 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 AC090458.1-203ENST00000527757 546 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 DPPA2P4-201ENST00000563717 878 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 MEP1B-204ENST00000581447 2308 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 AC096861.1-201ENST00000616652 240 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 AL357562.1-201ENST00000624911 609 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 AC004808.2-201ENST00000627965 773 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 SPRYD4-201ENST00000338146 10779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 PUM1-205ENST00000424085 4631 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 MAPK10-297ENST00000641287 3725 ntAPPRIS P2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 TNPO1P2-201ENST00000426249 2665 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 MELK-211ENST00000545008 2236 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 TMEM170B-201ENST00000379426 8362 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.51□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 MON2-202ENST00000393630 13275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 DPCR1-201ENST00000304311 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 ASB4-202ENST00000325885 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 PLD1-202ENST00000351298 5604 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 ATM-215ENST00000530958 5718 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 TMEM202-201ENST00000341689 1012 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 RN7SKP77-201ENST00000363261 353 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 DAOA-202ENST00000375936 742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 BRD7-202ENST00000394689 2145 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 OR7E101P-201ENST00000400428 513 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 OR6E1P-201ENST00000414424 923 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 OR4K3-201ENST00000425829 947 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 AC026254.2-201ENST00000475295 371 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 AC093599.1-201ENST00000515232 562 ntTSL 4 BASIC7.51□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 CYCSP22-201ENST00000517555 339 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 AC008680.1-201ENST00000523398 283 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 AC137590.1-201ENST00000542422 495 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
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