Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 USP47-203ENST00000399455 7396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
TCOF1Q13428 LINGO2-202ENST00000379992 3044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
TCOF1Q13428 LINC01415-201ENST00000587320 4071 ntTSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
TCOF1Q13428 RAD51B-210ENST00000487270 2596 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
TCOF1Q13428 ADGRF5-202ENST00000283296 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
TCOF1Q13428 RIOK2-202ENST00000508447 2149 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
TCOF1Q13428 CD200R1-201ENST00000295863 1692 ntTSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
TCOF1Q13428 EZH1-201ENST00000415827 4608 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
TCOF1Q13428 TRG-AS1-201ENST00000629357 3645 ntTSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
TCOF1Q13428 BANK1-206ENST00000504592 3544 ntTSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
TCOF1Q13428 SNORA74A-201ENST00000364089 198 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
TCOF1Q13428 BPHL-201ENST00000380368 797 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
TCOF1Q13428 TMBIM4-203ENST00000398033 844 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
TCOF1Q13428 LINC01442-201ENST00000414201 704 ntTSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
TCOF1Q13428 CASP5-203ENST00000418434 1023 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
TCOF1Q13428 TAB2-AS1-201ENST00000424421 730 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
TCOF1Q13428 SLC8A1-AS1-205ENST00000435515 497 ntTSL 3 BASIC9.22□□□□□ -0.93
TCOF1Q13428 AC006296.2-201ENST00000507932 764 ntTSL 3 BASIC9.22□□□□□ -0.93
TCOF1Q13428 PDE4D-225ENST00000515835 590 ntTSL 4 BASIC9.22□□□□□ -0.93
TCOF1Q13428 AC112191.2-201ENST00000522428 333 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
TCOF1Q13428 CRYAB-205ENST00000526180 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
TCOF1Q13428 MIR6748-201ENST00000610433 71 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
TCOF1Q13428 CASC22-202ENST00000628396 802 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
TCOF1Q13428 SECISBP2L-201ENST00000261847 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
TCOF1Q13428 AC007342.5-201ENST00000571340 2142 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
TCOF1Q13428 FAM13A-AS1-201ENST00000500765 3210 ntTSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
TCOF1Q13428 MYO5C-201ENST00000261839 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
TCOF1Q13428 SYTL2-220ENST00000529581 1910 ntTSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
TCOF1Q13428 AC027088.4-201ENST00000611559 1947 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
TCOF1Q13428 DIAPH3-206ENST00000465066 2735 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
TCOF1Q13428 LRRFIP2-201ENST00000336686 3208 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
TCOF1Q13428 DSCAM-203ENST00000617870 6176 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
TCOF1Q13428 CLASP1-215ENST00000541377 7909 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
TCOF1Q13428 PCDH19-201ENST00000255531 7937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
TCOF1Q13428 RPS24-201ENST00000360830 514 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
TCOF1Q13428 RN7SKP160-201ENST00000363804 340 ntBASIC9.21□□□□□ -0.93
TCOF1Q13428 IFNB1-201ENST00000380232 859 ntAPPRIS P1 BASIC9.21□□□□□ -0.93
TCOF1Q13428 OSBPL10-AS1-202ENST00000418728 458 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.93
TCOF1Q13428 AC093155.2-201ENST00000420734 937 ntBASIC9.21□□□□□ -0.93
TCOF1Q13428 NMD3P2-201ENST00000421815 761 ntBASIC9.21□□□□□ -0.93
TCOF1Q13428 AC112495.1-201ENST00000456037 756 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.93
TCOF1Q13428 AC018742.1-202ENST00000457901 504 ntTSL 3 BASIC9.21□□□□□ -0.93
TCOF1Q13428 PFN1P6-201ENST00000476786 399 ntBASIC9.21□□□□□ -0.93
TCOF1Q13428 SETP21-201ENST00000514799 892 ntBASIC9.21□□□□□ -0.93
TCOF1Q13428 AC109466.1-202ENST00000523648 748 ntTSL 3 BASIC9.21□□□□□ -0.93
TCOF1Q13428 AC022075.3-201ENST00000539009 649 ntTSL 3 BASIC9.21□□□□□ -0.93
TCOF1Q13428 AL133240.1-201ENST00000553537 580 ntTSL 4 BASIC9.21□□□□□ -0.93
TCOF1Q13428 AC005244.1-201ENST00000582566 339 ntBASIC9.21□□□□□ -0.93
TCOF1Q13428 AC008750.7-201ENST00000600765 559 ntTSL 4 BASIC9.21□□□□□ -0.93
TCOF1Q13428 CAST-204ENST00000341926 2487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
TCOF1Q13428 AL359091.1-201ENST00000449048 1734 ntBASIC9.21□□□□□ -0.93
TCOF1Q13428 PTPRT-206ENST00000373198 12746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
TCOF1Q13428 RAPGEF4-203ENST00000397087 4120 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
TCOF1Q13428 FARP1-219ENST00000596580 13532 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.93
TCOF1Q13428 ZNF778-207ENST00000620195 11031 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.93
TCOF1Q13428 ING3-204ENST00000431467 1447 ntTSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.93
TCOF1Q13428 RBMY1F-201ENST00000303766 1887 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
TCOF1Q13428 ARL17A-202ENST00000336125 3945 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
TCOF1Q13428 SLC16A4-201ENST00000369779 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
TCOF1Q13428 PLEKHA5-202ENST00000424268 4391 ntTSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.94
TCOF1Q13428 C20orf194-201ENST00000252032 6869 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
TCOF1Q13428 RNA5SP514-201ENST00000363717 111 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
TCOF1Q13428 AC005323.2-201ENST00000399342 583 ntTSL 3 BASIC9.21□□□□□ -0.94
TCOF1Q13428 AL390115.1-201ENST00000425271 423 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
TCOF1Q13428 AC245884.2-201ENST00000426257 404 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
TCOF1Q13428 CCNB1IP1P1-201ENST00000428976 839 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
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TCOF1Q13428 COX6CP7-201ENST00000597056 208 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
TCOF1Q13428 SLC17A4-202ENST00000397076 2331 ntTSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.94
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TCOF1Q13428 Z93929.1-201ENST00000418200 1475 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
TCOF1Q13428 LINC01505-205ENST00000636028 2298 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
TCOF1Q13428 ATP10B-202ENST00000327245 7566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
TCOF1Q13428 SOX5-205ENST00000451604 4261 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
TCOF1Q13428 FCGR1B-209ENST00000616817 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
TCOF1Q13428 DDAH1-204ENST00000535924 3909 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
TCOF1Q13428 RBBP4-202ENST00000373493 7943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
TCOF1Q13428 FANCD2-205ENST00000431693 2450 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
TCOF1Q13428 CERS3-203ENST00000538112 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
TCOF1Q13428 PCA3-201ENST00000412654 3922 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
TCOF1Q13428 SGO2-201ENST00000357799 4214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
TCOF1Q13428 OR2AG2-202ENST00000641124 4224 ntAPPRIS P1 BASIC9.2□□□□□ -0.94
TCOF1Q13428 OR2AG2-203ENST00000641169 4221 ntAPPRIS P1 BASIC9.2□□□□□ -0.94
TCOF1Q13428 RAB21-201ENST00000261263 15546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
TCOF1Q13428 SSX3-201ENST00000298396 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
TCOF1Q13428 SPTLC1P2-201ENST00000407089 121 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
TCOF1Q13428 PTCD2P2-201ENST00000415579 1095 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
TCOF1Q13428 AC015977.1-201ENST00000418887 292 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
TCOF1Q13428 BX323845.3-201ENST00000428215 527 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
TCOF1Q13428 GAPDHP58-201ENST00000438477 1006 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
TCOF1Q13428 FABP5P2-201ENST00000439042 408 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
TCOF1Q13428 MEOX2-AS1-201ENST00000442176 697 ntTSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.94
TCOF1Q13428 RPL36AP39-201ENST00000445859 318 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
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