Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 RAB5CP1-201ENST00000395972 580 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
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FOXF2Q12947 AL391863.2-201ENST00000411838 681 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 AL160272.1-201ENST00000421509 521 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 AC019205.1-201ENST00000421830 730 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 GPN3P1-201ENST00000423883 535 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 AL139158.1-201ENST00000424719 340 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 AL136980.1-201ENST00000426764 543 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
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FOXF2Q12947 AL392046.1-201ENST00000450742 569 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
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FOXF2Q12947 AC022784.1-201ENST00000512942 699 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 UBTFL10-201ENST00000528532 562 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 AC079089.1-204ENST00000530194 572 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
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FOXF2Q12947 AC124891.1-201ENST00000536322 519 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
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FOXF2Q12947 AC107958.1-201ENST00000556576 290 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 AC013652.2-202ENST00000558948 910 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 AC020661.4-201ENST00000561388 500 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 RORA-AS2-202ENST00000561413 576 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 AC079414.1-201ENST00000563114 488 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
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FOXF2Q12947 AP005901.2-201ENST00000581690 525 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 AC011921.2-201ENST00000589465 152 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
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FOXF2Q12947 AL353811.1-202ENST00000602614 618 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 AL121652.1-201ENST00000608851 448 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
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FOXF2Q12947 PCA3_2.1-201ENST00000612507 409 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
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FOXF2Q12947 ATF2-205ENST00000409499 801 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 SULT1C2-204ENST00000409880 1206 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 FAM183A-205ENST00000410048 500 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 NFIA-AS2-202ENST00000421455 768 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 AC244453.3-201ENST00000426275 459 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 AKR1D1-203ENST00000432161 1236 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 LINC01826-201ENST00000432894 584 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
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FOXF2Q12947 LINC01013-203ENST00000443303 569 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 CRYGGP-201ENST00000443337 145 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 AL020997.1-201ENST00000446554 349 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 AC136489.1-203ENST00000450246 736 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 RPS26P41-201ENST00000450370 284 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 AC011196.1-201ENST00000451816 595 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 PRELID3BP7-201ENST00000503606 469 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 NAMPTP2-201ENST00000505629 1115 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 AC021088.1-201ENST00000506519 805 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 AC097491.1-201ENST00000507857 672 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
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