Protein–RNA interactions for Protein: P29400

COL4A5, Collagen alpha-5(IV) chain, humanhuman

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Length 1,685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A5P29400 EPS15-203ENST00000371733 5225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 LRIG2-201ENST00000361127 11555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 SYT14-207ENST00000629778 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 C2CD5-202ENST00000396028 3463 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 C2CD5-203ENST00000446597 3490 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 C2CD5-206ENST00000536386 3496 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 AC127070.3-201ENST00000503695 3263 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 AP4S1-212ENST00000622409 4113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 LYRM4-201ENST00000330636 7312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 HLTF-201ENST00000310053 5317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 ZNF229-204ENST00000614049 4507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 ZC3H7A-214ENST00000575984 2632 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 IL31RA-202ENST00000354961 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 RNA5SP183-201ENST00000362452 119 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 TRAJ35-201ENST00000390502 59 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 MRM2-202ENST00000407040 582 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 CA1-201ENST00000431316 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 MIR4435-2HG-209ENST00000441075 704 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 AC104164.1-201ENST00000460282 590 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 AC109481.1-201ENST00000509173 282 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 MRPS16P1-201ENST00000523462 412 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 CRYAB-205ENST00000526180 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 ASCL3-201ENST00000531618 633 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 LINC02327-205ENST00000550990 472 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 SAMMSON-227ENST00000642114 1199 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 EIF4A2-205ENST00000440191 1889 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 PARP4P2-201ENST00000446672 3326 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 NAA15-208ENST00000515576 2456 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 TCF12-214ENST00000559710 1314 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 AL357568.1-201ENST00000421530 1963 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 NLGN4Y-203ENST00000382868 5338 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 KLHL32-207ENST00000620278 2642 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 NRXN1-248ENST00000636345 3595 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
COL4A5P29400 RAI14-228ENST00000515799 3486 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
COL4A5P29400 PLEKHA5-201ENST00000299275 4238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
COL4A5P29400 ZNF735-201ENST00000429565 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
COL4A5P29400 SRRM1P3-201ENST00000426911 2678 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
COL4A5P29400 OR10R3P-201ENST00000361688 942 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
COL4A5P29400 OR2W4P-201ENST00000406496 926 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
COL4A5P29400 TAB2-AS1-201ENST00000424421 730 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
COL4A5P29400 AP001476.3-201ENST00000429512 415 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
COL4A5P29400 DNAJA1P6-201ENST00000437347 354 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
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COL4A5P29400 AC099654.1-201ENST00000442649 407 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
COL4A5P29400 LRRC37A14P-201ENST00000452297 462 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
COL4A5P29400 AC073288.1-201ENST00000466291 469 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
COL4A5P29400 RN7SL329P-201ENST00000467740 299 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
COL4A5P29400 GAPDHP71-201ENST00000511530 1003 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
COL4A5P29400 AC103855.3-201ENST00000528445 606 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
COL4A5P29400 AC090457.1-201ENST00000579775 211 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
COL4A5P29400 FKBP1AP1-201ENST00000594588 318 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
COL4A5P29400 AC116651.1-201ENST00000609724 556 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
COL4A5P29400 ZNF347-202ENST00000452676 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
COL4A5P29400 HORMAD2-202ENST00000403975 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
COL4A5P29400 ERCC4-201ENST00000311895 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
COL4A5P29400 SCAND2P-201ENST00000348993 8975 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
COL4A5P29400 DNAH10-201ENST00000409039 14473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
COL4A5P29400 AC089998.1-201ENST00000548575 3141 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
COL4A5P29400 FAM168A-201ENST00000064778 7296 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
COL4A5P29400 GCNT2-201ENST00000265012 4214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
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COL4A5P29400 ZNF397-202ENST00000330501 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
COL4A5P29400 PPP2R5E-202ENST00000422769 3478 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
COL4A5P29400 TTI1-202ENST00000373448 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
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COL4A5P29400 CAND1-208ENST00000545606 11251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
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COL4A5P29400 LINC01809-201ENST00000448431 303 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
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COL4A5P29400 AC087664.2-202ENST00000521274 515 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
COL4A5P29400 AP002754.2-201ENST00000542121 462 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
COL4A5P29400 MORF4L1-205ENST00000558502 855 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
COL4A5P29400 AC068722.1-202ENST00000559600 655 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
COL4A5P29400 AL109954.2-201ENST00000611020 530 ntTSL 4 BASIC7.2□□□□□ -1.26
COL4A5P29400 AC012254.5-201ENST00000623573 478 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
COL4A5P29400 OSBPL9-205ENST00000447887 2940 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
COL4A5P29400 SORBS1-211ENST00000371247 7354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
COL4A5P29400 ZNF521-214ENST00000584787 4327 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
COL4A5P29400 ZNF195-201ENST00000005082 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
COL4A5P29400 SATB1-209ENST00000454909 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
COL4A5P29400 PARP14-202ENST00000474629 7915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
COL4A5P29400 TANK-205ENST00000405852 2155 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
COL4A5P29400 ZNF718-201ENST00000510175 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
COL4A5P29400 NEMP1-201ENST00000300128 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
COL4A5P29400 AC011525.1-201ENST00000562167 5676 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
COL4A5P29400 PDZRN4-203ENST00000539469 3041 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
COL4A5P29400 ADGRB3-203ENST00000546190 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
COL4A5P29400 YPEL5-202ENST00000379519 2499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
COL4A5P29400 LEPR-203ENST00000371058 2805 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
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