Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 ZNF761-202ENST00000432094 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 MAPK10-244ENST00000639972 2818 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 EGFLAM-AS4-201ENST00000512496 1579 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 GAGE1-204ENST00000619375 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 TMX2-201ENST00000278422 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 MFSD8-256ENST00000641949 1640 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 GRIA4-212ENST00000530497 5059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 CYLD-203ENST00000427738 8503 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AC013562.1-201ENST00000519427 1722 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 ENPP5-202ENST00000371383 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 CAST-234ENST00000511049 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 ZNF658-206ENST00000621410 4025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 RBM41-202ENST00000372487 2579 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 PART1-203ENST00000515734 2569 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 PRKAR2A-AS1-202ENST00000416209 3447 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 ZBTB25-204ENST00000608382 10372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 FBXL13-201ENST00000313221 2744 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 DIAPH3-206ENST00000465066 2735 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 SYTL2-208ENST00000524452 2733 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AMBN-203ENST00000613447 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 NPIPB4-203ENST00000415645 3606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 ATP6V0E1-201ENST00000265093 773 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 MBD3L1-201ENST00000305625 748 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 RNU6-623P-201ENST00000363143 105 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 Y_RNA.201-201ENST00000364052 96 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 RNU12-2P-201ENST00000364789 156 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 C1orf105-201ENST00000367725 888 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 MIR575-201ENST00000385013 94 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 RPL5P8-201ENST00000396820 815 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AF130351.1-202ENST00000400562 808 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 BTF3L4P1-201ENST00000413813 468 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AC104777.3-201ENST00000416350 545 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 ELOCP9-201ENST00000418624 239 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 NENFP1-201ENST00000419476 466 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 RPL23AP85-201ENST00000421838 433 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 FDPSP1-201ENST00000424976 1071 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 RPS4XP16-201ENST00000427198 791 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AL122019.1-201ENST00000438575 798 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 HMGB2-202ENST00000438704 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 MTND2P4-201ENST00000445034 1004 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AC009299.3-202ENST00000445372 538 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AL138930.1-201ENST00000446952 635 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AC104978.1-201ENST00000449387 391 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 PMS2P11-201ENST00000451831 574 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 MRPL35P4-201ENST00000453682 566 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AC006026.3-201ENST00000454029 143 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 LINC01706-201ENST00000455299 748 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 GTF2IP12-201ENST00000456547 356 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 RPF2P2-201ENST00000504693 896 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 GNPDA2-202ENST00000507534 1050 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 MRPS5P3-201ENST00000515577 166 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 POLR2K-203ENST00000522439 543 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AC079089.1-203ENST00000533300 431 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AC092865.1-201ENST00000544395 1023 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AC073896.2-202ENST00000549860 437 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AC090049.1-201ENST00000551075 1011 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AL121839.1-201ENST00000556233 1185 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AL096869.1-201ENST00000557622 559 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AC060809.1-201ENST00000559211 564 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AC090888.1-201ENST00000561335 1141 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AC134312.6-201ENST00000568587 444 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AC010547.3-201ENST00000569271 440 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AC010531.4-201ENST00000570286 576 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AC103987.3-201ENST00000582071 292 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AC015878.1-201ENST00000584611 679 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AC011933.4-201ENST00000585081 403 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 C10orf82-203ENST00000588184 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AL161896.1-201ENST00000597248 508 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 UBA52-209ENST00000597451 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AL020997.3-201ENST00000602843 359 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 DPRXP5-201ENST00000604662 539 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AL583856.2-201ENST00000606298 543 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
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HOXA3O43365 AC122710.3-201ENST00000606566 541 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AC016877.3-201ENST00000606778 504 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AC027271.1-201ENST00000610270 610 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AC024257.5-201ENST00000612739 531 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 NPPA-AS1_1.1-201ENST00000622391 173 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AL049536.1-201ENST00000625043 744 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 MAP4K4-221ENST00000634702 3800 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 LINC01359-206ENST00000634775 888 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 UBR4-204ENST00000375254 15906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 ZNF107-206ENST00000620827 5685 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AGO1-202ENST00000373206 3996 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 ZNF736P9Y-201ENST00000439586 1345 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 SLC24A1-209ENST00000537259 3983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 PSD3-220ENST00000615573 5843 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 PATJ-203ENST00000371158 8505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 TCF12-207ENST00000557843 4076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 METTL2A-204ENST00000616852 3150 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 TRIM77-201ENST00000398290 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 NEPNP-201ENST00000404786 1371 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 NME8-201ENST00000199447 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 ZNF587B-201ENST00000442832 3339 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 LINC02324-201ENST00000531609 1442 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 ZNF568-215ENST00000617745 2441 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 PHF11-201ENST00000357596 1471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AC090132.1-201ENST00000524071 1480 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 RAB6C-AS1-201ENST00000412425 2454 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AC126755.2-201ENST00000545114 1522 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
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