Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 VCAM1-201ENST00000294728 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
B4DXG7 AC009804.2-201ENST00000637566 3032 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
B4DXG7 BMP10-201ENST00000295379 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
B4DXG7 XKRY2-202ENST00000623874 1581 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
B4DXG7 XKRY-202ENST00000624960 1581 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
B4DXG7 PTPN2-212ENST00000591497 3390 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
B4DXG7 WDR95P-201ENST00000425638 1542 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
B4DXG7 AL592429.1-201ENST00000403909 1473 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
B4DXG7 AC092958.1-201ENST00000467198 2569 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
B4DXG7 STAG2-202ENST00000371144 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
B4DXG7 RNF150-202ENST00000420921 3673 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
B4DXG7 NCOA7-201ENST00000229634 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
B4DXG7 AC124312.1-201ENST00000551312 1325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
B4DXG7 HIST1H1T-201ENST00000338379 718 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
B4DXG7 TINAG-203ENST00000370869 782 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
B4DXG7 EEF1AKMT1-201ENST00000382754 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
B4DXG7 AL139184.1-202ENST00000422303 222 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
B4DXG7 GPN3P1-201ENST00000423883 535 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
B4DXG7 RPSAP32-201ENST00000432681 526 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
B4DXG7 E2F3-IT1-201ENST00000433182 400 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
B4DXG7 AL161793.1-201ENST00000435021 445 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
B4DXG7 PIK3IP1-AS1-201ENST00000440456 554 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
B4DXG7 AL355390.2-201ENST00000446691 880 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
B4DXG7 AC095033.1-201ENST00000451611 1096 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
B4DXG7 MARK2P8-201ENST00000476069 952 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
B4DXG7 SOX2-OT-210ENST00000487240 751 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
B4DXG7 EIF4E2P2-201ENST00000492033 736 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
B4DXG7 IGHV7-34-1-201ENST00000519200 350 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
B4DXG7 TPT1-AS1-207ENST00000520310 563 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
B4DXG7 DCN-209ENST00000546745 1026 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
B4DXG7 AC090709.1-201ENST00000548384 716 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
B4DXG7 AC009387.1-201ENST00000549163 441 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
B4DXG7 AC026471.4-201ENST00000569291 449 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
B4DXG7 TTC39C-AS1-201ENST00000579713 817 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
B4DXG7 AC090616.1-201ENST00000583895 447 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
B4DXG7 AC011891.2-201ENST00000604949 397 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
B4DXG7 LY86-AS1-206ENST00000607278 677 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
B4DXG7 AC112493.1-201ENST00000609836 303 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
B4DXG7 MIR6085-201ENST00000618314 110 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
B4DXG7 ZNF24-201ENST00000261332 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
B4DXG7 SLC4A4-202ENST00000340595 7640 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
B4DXG7 DCTN5-201ENST00000300087 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
B4DXG7 ZNF607-202ENST00000395835 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
B4DXG7 AL157831.2-201ENST00000564681 3095 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
B4DXG7 MYBL1-206ENST00000524176 2148 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
B4DXG7 AC005674.2-201ENST00000561486 3510 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
B4DXG7 CREM-203ENST00000344351 1625 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
B4DXG7 CLRN1-AS1-201ENST00000465576 2045 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
B4DXG7 PKN2-202ENST00000370513 2890 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
B4DXG7 VRK2-206ENST00000435505 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
B4DXG7 MARCH7-201ENST00000259050 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
B4DXG7 LINC01613-201ENST00000561476 2780 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
B4DXG7 ITGB1-201ENST00000302278 3640 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
B4DXG7 AC099673.1-201ENST00000452199 2296 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
B4DXG7 LINC01616-201ENST00000561816 2280 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
B4DXG7 ZNF449-201ENST00000339249 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
B4DXG7 FAM205BP-203ENST00000455647 3752 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
B4DXG7 ZNF699-203ENST00000591998 3358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
B4DXG7 FASTKD1-204ENST00000453153 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
B4DXG7 BABAM2-206ENST00000379632 1752 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
B4DXG7 LINC02318-201ENST00000553785 1334 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
B4DXG7 FBXO25-204ENST00000382824 10386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
B4DXG7 CCAR1-201ENST00000265872 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
B4DXG7 AC123769.1-201ENST00000530992 3192 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
B4DXG7 AC089998.1-201ENST00000548575 3141 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
B4DXG7 OR2J2-203ENST00000641417 2392 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
B4DXG7 ACTR3C-201ENST00000252071 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
B4DXG7 RPL11P4-201ENST00000332269 436 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
B4DXG7 TERB2-201ENST00000340827 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
B4DXG7 SDHAF3-201ENST00000360382 731 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
B4DXG7 RN7SKP250-201ENST00000363924 321 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
B4DXG7 PSMD10-206ENST00000372296 878 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
B4DXG7 IGLV3-16-201ENST00000390311 385 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
B4DXG7 U3.43-201ENST00000410734 213 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
B4DXG7 THEM7P-201ENST00000419556 672 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
B4DXG7 AC009963.4-201ENST00000448535 339 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
B4DXG7 AC002075.1-201ENST00000457396 676 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
B4DXG7 AC117500.1-201ENST00000497352 755 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
B4DXG7 AC016405.1-202ENST00000524348 758 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
B4DXG7 AC084880.3-201ENST00000535921 541 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
B4DXG7 PRH1-204ENST00000539853 837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
B4DXG7 AC008055.1-201ENST00000547032 609 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
B4DXG7 LINC01477-201ENST00000566101 1226 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
B4DXG7 MT1CP-201ENST00000567054 174 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
B4DXG7 AC087392.1-201ENST00000576252 820 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
B4DXG7 WBP1LP11-201ENST00000586141 328 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
B4DXG7 AC073218.2-202ENST00000605962 617 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
B4DXG7 LINC00635-219ENST00000608506 482 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
B4DXG7 MIR6780B-201ENST00000610307 79 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
B4DXG7 AC015574.1-202ENST00000616588 456 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
B4DXG7 AL122023.1-201ENST00000622847 530 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
B4DXG7 SLAMF6-203ENST00000368059 2743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
B4DXG7 AL031656.1-202ENST00000457704 1995 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
B4DXG7 LINC01524-201ENST00000428009 4390 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
B4DXG7 MAGI2-205ENST00000519748 3316 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
B4DXG7 TRAF5-201ENST00000261464 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
B4DXG7 LUZP2-201ENST00000336930 3553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
B4DXG7 KIAA1109-201ENST00000264501 15896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
B4DXG7 GTDC1-204ENST00000392869 10514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
B4DXG7 ATP13A4-204ENST00000400270 1458 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.4 ms