Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 APOBEC3AP1-201ENST00000511396 287 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 OR4A41P-201ENST00000533053 928 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 AC092490.1-202ENST00000540299 809 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 LINC02451-201ENST00000546982 565 ntTSL 4 BASIC6.45□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 AC121758.1-202ENST00000556917 658 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 DISC1FP1-203ENST00000562678 796 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 AL078601.3-201ENST00000573303 535 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 MTATP6P25-201ENST00000574491 261 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 MIR7515HG-235ENST00000590865 918 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 AC020916.2-201ENST00000591242 360 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 Z98949.1-228ENST00000595093 798 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 LINC01355-202ENST00000604481 400 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 LINGO2-204ENST00000613945 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 CKLF-CMTM1-206ENST00000616804 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 AP003072.5-201ENST00000623872 773 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 AC073488.6-201ENST00000632293 754 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 AL596275.2-208ENST00000641192 594 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 AC097634.1-201ENST00000604491 2467 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 RRH-201ENST00000317735 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 OR4N5-202ENST00000641086 2187 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 AC034229.2-201ENST00000566945 2508 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 LINC01748-203ENST00000634836 3229 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 LINC00939-201ENST00000502479 4972 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 SORBS1-205ENST00000371227 7279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 ZNF160-202ENST00000418871 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 LMO3-202ENST00000320122 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 PAX8-AS1-202ENST00000422956 11799 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 ZNF585B-205ENST00000532828 6210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 SLC24A5-204ENST00000482911 2984 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 NLGN1-202ENST00000401917 1827 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 PDE1A-204ENST00000410103 2000 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 LINC00320-204ENST00000437238 2004 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 SLC35A5-201ENST00000261034 2444 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 ITGB1-201ENST00000302278 3640 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 C3orf14-201ENST00000232519 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 SLC8A1-AS1-202ENST00000417875 344 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 AC007278.2-201ENST00000436582 1200 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 AC092162.2-201ENST00000438143 532 ntTSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 MTND6P8-201ENST00000503471 522 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 OR7E99P-201ENST00000505750 922 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 AC008413.2-201ENST00000507398 342 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 OCIAD1-216ENST00000509122 1204 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 RNA5SP400-201ENST00000517155 111 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 TEK-204ENST00000519097 3836 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 NATP-201ENST00000523491 878 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 RPA2P3-201ENST00000533268 770 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 LRTOMT-218ENST00000541614 726 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 C3orf14-207ENST00000542214 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 AC016993.1-201ENST00000547033 1258 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 AC090115.2-201ENST00000548060 883 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 FAM174B-202ENST00000553393 495 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 MRPS21P8-201ENST00000569196 235 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 ODF4-202ENST00000584943 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 AC016229.2-201ENST00000591331 417 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 DYNLL1P1-201ENST00000595442 269 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 MIR6780B-201ENST00000610307 79 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 LINC01676-209ENST00000623043 896 ntTSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 OR5D13-201ENST00000623930 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 OR52I2-203ENST00000641896 6591 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 CSNK1A1-205ENST00000515435 1856 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 PTPRT-209ENST00000612229 11285 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 HHLA1-201ENST00000414222 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 MTAP-210ENST00000580900 7557 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 AC022507.1-201ENST00000548349 1505 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 PCDH11Y-204ENST00000400457 9039 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 ZNF33B-201ENST00000359467 5958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 OR2G6-202ENST00000641501 5840 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 CD47-201ENST00000355354 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 NBPF12-205ENST00000617614 4630 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 DOCK11P1-201ENST00000553480 5932 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 CNOT1-216ENST00000569240 7660 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 BDNF-212ENST00000525528 4766 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 HSPD1P8-201ENST00000400121 1658 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 WBP11P1-201ENST00000562560 1931 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 ZNF624-201ENST00000311331 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 AMOT-206ENST00000524145 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 AC011416.1-201ENST00000514947 1732 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 RNA5SP375-201ENST00000362975 119 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 OR2L2-201ENST00000366479 1134 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 FAM66C-201ENST00000372173 678 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 PPP1R7-203ENST00000401987 820 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 SOX9-AS1-202ENST00000414600 742 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 AC108479.1-201ENST00000431142 427 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 PSMD10P2-201ENST00000432890 672 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 AC023141.3-201ENST00000436698 278 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 SMIM30-204ENST00000441359 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 AL645936.1-201ENST00000441979 518 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 AC099786.1-201ENST00000446238 670 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 RNU6-775P-201ENST00000459318 96 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 RPL17P2-201ENST00000491913 451 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 FTH1P8-201ENST00000498161 514 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 AC008945.1-201ENST00000505144 499 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 LINC02217-201ENST00000505844 687 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 AC008957.1-203ENST00000508745 589 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 AC018797.1-201ENST00000510791 255 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 LINC02196-201ENST00000512838 568 ntTSL 4 BASIC6.43□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 RNA5SP434-201ENST00000516647 121 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 RN7SKP183-201ENST00000517169 324 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 AL138974.1-201ENST00000551227 741 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 AL136298.1-202ENST00000556520 518 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
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