Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 SLC39A12-202ENST00000377371 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
CTXN3Q4LDR2 OR2AH1P-202ENST00000641232 2744 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CTXN3Q4LDR2 RIMKLB-207ENST00000538135 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
CTXN3Q4LDR2 PCLO-203ENST00000423517 17147 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CTXN3Q4LDR2 NEK2P2-201ENST00000438441 1338 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CTXN3Q4LDR2 CTAGE11P-201ENST00000451540 2353 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CTXN3Q4LDR2 NPY5R-202ENST00000506953 1418 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CTXN3Q4LDR2 NFX1-201ENST00000318524 3513 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CTXN3Q4LDR2 LRRC37A3-202ENST00000334962 2654 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CTXN3Q4LDR2 PLCE1-203ENST00000371385 6500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CTXN3Q4LDR2 NRXN3-203ENST00000428277 4219 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CTXN3Q4LDR2 SH3BGRL-201ENST00000373212 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CTXN3Q4LDR2 MROH9-201ENST00000367758 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CTXN3Q4LDR2 CCDC150-202ENST00000409270 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CTXN3Q4LDR2 EPS8-207ENST00000540613 2204 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CTXN3Q4LDR2 TRAF5-201ENST00000261464 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CTXN3Q4LDR2 ADGRE1-202ENST00000312053 3128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CTXN3Q4LDR2 LINC00598-211ENST00000636621 3241 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CTXN3Q4LDR2 AC010329.1-201ENST00000593903 8328 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CTXN3Q4LDR2 S100A5-201ENST00000368717 506 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CTXN3Q4LDR2 RNU6-891P-201ENST00000384280 111 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CTXN3Q4LDR2 TRAV8-4-201ENST00000390438 469 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CTXN3Q4LDR2 SNORA77.2-201ENST00000408571 112 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CTXN3Q4LDR2 AC095032.2-201ENST00000414923 418 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CTXN3Q4LDR2 TEX38-202ENST00000415500 566 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CTXN3Q4LDR2 IGLV3-4-201ENST00000432300 244 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CTXN3Q4LDR2 HMGN1P2-201ENST00000445197 310 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CTXN3Q4LDR2 BZW1P1-201ENST00000454901 1240 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CTXN3Q4LDR2 AL133351.3-201ENST00000454998 193 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CTXN3Q4LDR2 AC009963.3-201ENST00000458090 486 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CTXN3Q4LDR2 TMEM108-AS1-201ENST00000504993 705 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CTXN3Q4LDR2 AC131182.1-201ENST00000509184 657 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CTXN3Q4LDR2 AC093599.1-201ENST00000515232 562 ntTSL 4 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CTXN3Q4LDR2 AC021146.10-201ENST00000515628 706 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CTXN3Q4LDR2 COX6B1P4-201ENST00000519826 484 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CTXN3Q4LDR2 AC036111.2-201ENST00000533247 901 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CTXN3Q4LDR2 CCDC60-203ENST00000536742 886 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CTXN3Q4LDR2 SNRPGP1-201ENST00000553864 222 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CTXN3Q4LDR2 AC244502.3-201ENST00000555460 457 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CTXN3Q4LDR2 AC127522.1-201ENST00000560531 751 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CTXN3Q4LDR2 CAPN3-210ENST00000561817 915 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CTXN3Q4LDR2 AC104151.1-201ENST00000563764 323 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CTXN3Q4LDR2 MRPS21P8-201ENST00000569196 235 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CTXN3Q4LDR2 LINC01533-204ENST00000590719 435 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CTXN3Q4LDR2 AC245128.3-201ENST00000594721 748 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CTXN3Q4LDR2 IGLVIVOR22-1-201ENST00000603243 397 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CTXN3Q4LDR2 Z98949.1-220ENST00000609809 804 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CTXN3Q4LDR2 AC096586.2-201ENST00000610260 441 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CTXN3Q4LDR2 OFD1P15Y-201ENST00000411536 1392 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CTXN3Q4LDR2 AC010624.4-201ENST00000597606 1351 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CTXN3Q4LDR2 CASC19-255ENST00000641733 1385 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CTXN3Q4LDR2 FAM114A2-201ENST00000351797 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CTXN3Q4LDR2 FAM71F1-209ENST00000621392 1591 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CTXN3Q4LDR2 ZNF532-222ENST00000591083 5324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CTXN3Q4LDR2 ERICH3-202ENST00000420661 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CTXN3Q4LDR2 GABRA6-207ENST00000523217 2393 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CTXN3Q4LDR2 RASGEF1B-214ENST00000638048 2386 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CTXN3Q4LDR2 DMD-205ENST00000359836 7339 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CTXN3Q4LDR2 FRMD4B-210ENST00000478263 3761 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CTXN3Q4LDR2 MARVELD2-204ENST00000454295 4376 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CTXN3Q4LDR2 PAK3-202ENST00000360648 2241 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CTXN3Q4LDR2 CXCL8-201ENST00000307407 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CTXN3Q4LDR2 AC078880.4-201ENST00000617627 1749 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CTXN3Q4LDR2 GPR89A-213ENST00000534502 1644 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CTXN3Q4LDR2 PIGN-220ENST00000638167 4195 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CTXN3Q4LDR2 AL162726.3-201ENST00000637606 1301 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CTXN3Q4LDR2 DMXL1-215ENST00000539542 11236 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
CTXN3Q4LDR2 EPS8-213ENST00000543612 2965 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CTXN3Q4LDR2 FRMD5-211ENST00000618556 5059 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CTXN3Q4LDR2 CCRL2-201ENST00000357392 1593 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
CTXN3Q4LDR2 ZNF607-202ENST00000395835 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CTXN3Q4LDR2 TLR4-202ENST00000394487 3908 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
CTXN3Q4LDR2 DMD-202ENST00000343523 5623 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CTXN3Q4LDR2 SPRY3-201ENST00000302805 9019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
CTXN3Q4LDR2 RNU1-24P-201ENST00000364285 165 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CTXN3Q4LDR2 PPP1R7-203ENST00000401987 820 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CTXN3Q4LDR2 FAM107B-217ENST00000478076 790 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CTXN3Q4LDR2 PFN2-209ENST00000481275 560 ntTSL 4 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CTXN3Q4LDR2 TRBV8-1-201ENST00000481590 279 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CTXN3Q4LDR2 DEFB109A-201ENST00000482450 265 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CTXN3Q4LDR2 MGC32805-204ENST00000509993 783 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CTXN3Q4LDR2 AC106800.3-201ENST00000511389 308 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CTXN3Q4LDR2 IGKV1D-22-201ENST00000518953 324 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CTXN3Q4LDR2 AC025423.2-201ENST00000537570 439 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CTXN3Q4LDR2 MED21-206ENST00000546323 575 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CTXN3Q4LDR2 AC090115.2-201ENST00000548060 883 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CTXN3Q4LDR2 LINC02392-201ENST00000548172 537 ntTSL 4 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CTXN3Q4LDR2 AC090844.2-201ENST00000578802 436 ntTSL 4 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CTXN3Q4LDR2 AC005726.4-201ENST00000582858 458 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CTXN3Q4LDR2 AP005136.2-201ENST00000583253 1049 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CTXN3Q4LDR2 BX322635.1-201ENST00000605804 496 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CTXN3Q4LDR2 AC010894.2-203ENST00000606406 499 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CTXN3Q4LDR2 CKLF-CMTM1-206ENST00000616804 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CTXN3Q4LDR2 AL031665.2-201ENST00000620712 209 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CTXN3Q4LDR2 COPS7B-225ENST00000631349 189 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CTXN3Q4LDR2 RSAD2-201ENST00000382040 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
CTXN3Q4LDR2 SLC14A1-208ENST00000586142 2846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
CTXN3Q4LDR2 RTL9-203ENST00000540313 5225 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CTXN3Q4LDR2 ZC3H8-208ENST00000615791 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CTXN3Q4LDR2 AC027575.3-201ENST00000583058 2747 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.3 ms