Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 AC009113.2-201ENST00000563182 403 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
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FXNQ16595 AC005410.2-201ENST00000580270 463 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
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FXNQ16595 RNF217-201ENST00000359704 1784 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
FXNQ16595 CAST-203ENST00000338252 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
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FXNQ16595 NUP43-201ENST00000340413 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
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FXNQ16595 AC068305.2-201ENST00000550567 1205 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
FXNQ16595 MIR762HG-201ENST00000564901 648 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
FXNQ16595 FLJ21408-204ENST00000566854 601 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
FXNQ16595 AC104581.3-201ENST00000573621 348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
FXNQ16595 AC099850.2-201ENST00000577660 557 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
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