Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 LYZL1-201ENST00000375500 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
PSMD6Q15008 AC002511.2-201ENST00000413796 450 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
PSMD6Q15008 RPL7AP51-201ENST00000422016 760 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PSMD6Q15008 EMC3-AS1-205ENST00000438698 534 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PSMD6Q15008 AL355390.2-201ENST00000446691 880 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
PSMD6Q15008 AC095033.1-201ENST00000451611 1096 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
PSMD6Q15008 AC011625.1-201ENST00000455442 526 ntTSL 4 BASIC6.9□□□□□ -1.3
PSMD6Q15008 AC078785.2-201ENST00000462010 1253 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
PSMD6Q15008 RPL5P16-201ENST00000471467 790 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PSMD6Q15008 GLYCTK-AS1-202ENST00000472761 109 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
PSMD6Q15008 RN7SL714P-201ENST00000487050 298 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PSMD6Q15008 AC023794.2-201ENST00000504891 528 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
PSMD6Q15008 CYCSP25-201ENST00000525280 316 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PSMD6Q15008 AL049836.2-201ENST00000553318 513 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
PSMD6Q15008 AC234775.3-201ENST00000564612 656 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PSMD6Q15008 MIR4301-201ENST00000577203 66 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PSMD6Q15008 MIR7515HG-235ENST00000590865 918 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
PSMD6Q15008 AC112491.1-201ENST00000602890 248 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
PSMD6Q15008 Metazoa_SRP.134-201ENST00000610965 327 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PSMD6Q15008 USP16-201ENST00000334352 3004 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
PSMD6Q15008 AC087516.2-201ENST00000558963 3042 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
PSMD6Q15008 AC010401.2-201ENST00000575137 4934 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PSMD6Q15008 GABRA2-206ENST00000507460 5812 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
PSMD6Q15008 SLC4A4-202ENST00000340595 7640 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
PSMD6Q15008 PLEKHH2-201ENST00000282406 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
PSMD6Q15008 DOCK11P1-201ENST00000553480 5932 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
PSMD6Q15008 SLAMF6-203ENST00000368059 2743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
PSMD6Q15008 KIAA0586-214ENST00000619416 8233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
PSMD6Q15008 FTO-215ENST00000636491 1676 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
PSMD6Q15008 BLM-201ENST00000355112 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
PSMD6Q15008 ZNF540-201ENST00000316433 3099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
PSMD6Q15008 ALG10-201ENST00000266483 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
PSMD6Q15008 LINC01450-201ENST00000443406 3263 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PSMD6Q15008 HOMEZ-203ENST00000561013 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PSMD6Q15008 OR51I2-202ENST00000641930 3302 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PSMD6Q15008 HECTD4-211ENST00000550722 15450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PSMD6Q15008 LINC00939-201ENST00000502479 4972 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PSMD6Q15008 UNC5C-205ENST00000610318 9403 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PSMD6Q15008 MAT2B-201ENST00000280969 2226 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PSMD6Q15008 VEZF1-204ENST00000584396 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PSMD6Q15008 LINC01415-201ENST00000587320 4071 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PSMD6Q15008 FANCD2-205ENST00000431693 2450 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PSMD6Q15008 TTF2-201ENST00000369466 9462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PSMD6Q15008 CDH13-209ENST00000567109 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PSMD6Q15008 RACGAP1-203ENST00000454520 3080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PSMD6Q15008 IPO8-209ENST00000544829 3212 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PSMD6Q15008 GPATCH2L-201ENST00000261530 14007 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PSMD6Q15008 CHEK1-216ENST00000534070 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PSMD6Q15008 GSTA5-201ENST00000284562 845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PSMD6Q15008 METTL5-202ENST00000308099 629 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PSMD6Q15008 RNA5SP478-201ENST00000364657 115 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PSMD6Q15008 RFPL3S-201ENST00000382084 1117 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PSMD6Q15008 YWHAZP4-201ENST00000392459 708 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PSMD6Q15008 UBE2F-204ENST00000409953 924 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PSMD6Q15008 AL034345.2-202ENST00000416948 830 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PSMD6Q15008 TEX50-201ENST00000417563 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PSMD6Q15008 AL606534.4-201ENST00000427176 792 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PSMD6Q15008 AL359644.1-204ENST00000440807 440 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PSMD6Q15008 AC009237.1-201ENST00000442127 744 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PSMD6Q15008 AC139712.3-201ENST00000443926 639 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PSMD6Q15008 LINC01370-202ENST00000445606 731 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PSMD6Q15008 AL031275.1-201ENST00000457405 418 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PSMD6Q15008 RARRES2P3-201ENST00000457739 473 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PSMD6Q15008 OR9A1P-202ENST00000484361 945 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PSMD6Q15008 SOX2-OT-210ENST00000487240 751 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PSMD6Q15008 LINC01596-201ENST00000503609 592 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PSMD6Q15008 AC138409.2-202ENST00000507274 458 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PSMD6Q15008 GUSBP9-201ENST00000510138 584 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PSMD6Q15008 AC093816.1-201ENST00000515076 913 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PSMD6Q15008 AC116917.1-201ENST00000520558 305 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PSMD6Q15008 KCTD9P6-201ENST00000522306 950 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PSMD6Q15008 AC009387.1-201ENST00000549163 441 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PSMD6Q15008 AC009120.3-201ENST00000563335 499 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
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PSMD6Q15008 AC007100.1-201ENST00000606382 478 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PSMD6Q15008 SNORA74.4-201ENST00000607595 199 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PSMD6Q15008 AC005899.7-201ENST00000618199 588 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PSMD6Q15008 AL122023.1-201ENST00000622847 530 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PSMD6Q15008 LINC01002-237ENST00000634025 555 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PSMD6Q15008 OR7E91P-202ENST00000642062 1198 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PSMD6Q15008 PLCE1-201ENST00000371375 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PSMD6Q15008 CSDE1-203ENST00000358528 4076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PSMD6Q15008 LINC01043-201ENST00000565936 6897 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PSMD6Q15008 C11orf1-203ENST00000529270 1437 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PSMD6Q15008 NBPF12-205ENST00000617614 4630 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PSMD6Q15008 OR7D4-203ENST00000641669 4965 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PSMD6Q15008 PLCZ1-201ENST00000266505 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PSMD6Q15008 LRRC36-205ENST00000563189 2104 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PSMD6Q15008 OR2H1-201ENST00000377132 2253 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PSMD6Q15008 NPHP3-AS1-202ENST00000504440 2507 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PSMD6Q15008 TCF4-284ENST00000637169 7553 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PSMD6Q15008 SCN2A-202ENST00000375427 8553 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PSMD6Q15008 THAP6-201ENST00000311638 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PSMD6Q15008 AC005674.2-201ENST00000561486 3510 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PSMD6Q15008 NUP210L-201ENST00000271854 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PSMD6Q15008 CYLD-210ENST00000566206 3104 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
PSMD6Q15008 CTAGE5-201ENST00000280082 2554 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
PSMD6Q15008 PDE4D-226ENST00000546160 7690 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
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