Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 LINC02073-201ENST00000588341 2845 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 AC007402.1-201ENST00000440698 3939 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 SPATA31B1P-201ENST00000434692 4016 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 FGF9-201ENST00000382353 4220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 DNM1L-205ENST00000414834 4211 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 ZNF561-204ENST00000424629 4419 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 CAST-234ENST00000511049 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 CYP19A1-202ENST00000396404 2388 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 ADAMTS9-AS2-202ENST00000474768 2388 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 AMZ2-206ENST00000577985 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 MYLK4-201ENST00000274643 5806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 AC004988.1-201ENST00000415237 1771 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 NF1P8-201ENST00000415351 1461 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 MS4A6A-213ENST00000530839 1383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 AC092725.2-201ENST00000567658 1389 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 SMARCA2-252ENST00000636559 6853 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 METTL21EP-201ENST00000298105 713 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 SEC61G-201ENST00000352861 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 RPL7-201ENST00000352983 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 RNA5SP429-201ENST00000363688 109 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 RN7SKP55-201ENST00000364888 307 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 OR10R2-201ENST00000368152 1008 ntAPPRIS P2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 TPT1-204ENST00000379060 764 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 IGLV5-52-201ENST00000390289 379 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 RNU6-1055P-201ENST00000391085 107 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 RPL24P7-201ENST00000399435 453 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 EEF1GP6-201ENST00000402309 905 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 UBE2F-204ENST00000409953 924 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 SPRY4-AS1-201ENST00000414314 521 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 AC023128.2-201ENST00000420880 1223 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 GAPDHP69-201ENST00000425504 1008 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 DLEU1-AS1-201ENST00000428276 731 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 PUDPP2-201ENST00000431423 643 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 GAPDHP34-201ENST00000432112 823 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 LINC01867-201ENST00000435357 604 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 TRIM2-203ENST00000437508 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 AC114755.4-201ENST00000439114 443 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 HSFY3P-201ENST00000444242 1191 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 AC002486.2-201ENST00000447806 590 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 LINC00448-202ENST00000448411 433 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 LINC00692-201ENST00000451284 932 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 ST13P21-201ENST00000453250 1098 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 LINC01795-201ENST00000454367 813 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 AC092155.2-201ENST00000454675 477 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 CXCR6-203ENST00000457814 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 SNORA81.1-201ENST00000458922 177 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 RPS16P9-201ENST00000477220 427 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 RN7SL849P-201ENST00000485236 295 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 AC066616.1-201ENST00000486795 413 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 AL591122.1-201ENST00000487348 492 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 AC006487.2-201ENST00000503624 577 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 AC010627.1-201ENST00000503819 1294 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 CDH12P2-201ENST00000504393 298 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 AC108159.1-201ENST00000505408 489 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 SSX8-201ENST00000506270 579 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 AC097512.1-203ENST00000506425 957 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 AC097451.1-201ENST00000507388 653 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 AC024132.3-201ENST00000513616 649 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 DCAF13P2-201ENST00000514188 555 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 AC104417.1-201ENST00000523974 751 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 AP000442.2-201ENST00000531108 440 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 AP002833.2-201ENST00000531585 462 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 PHBP2-201ENST00000532859 806 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 AC069234.2-202ENST00000535720 583 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 OR11H3P-201ENST00000554547 982 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 AL157871.4-201ENST00000557226 385 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 MT1B-202ENST00000562399 351 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 AP000897.2-201ENST00000579509 1057 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 AC110603.1-201ENST00000580645 468 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 LINC01900-202ENST00000584898 603 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 ZNF525-206ENST00000593918 590 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 Metazoa_SRP.57-201ENST00000597717 283 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 AL591222.2-201ENST00000604443 754 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 MALAT1-214ENST00000618925 424 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 REV3L-214ENST00000619481 969 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 LINC00251-201ENST00000627569 1055 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 PAICS-201ENST00000264221 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 AC022075.1-201ENST00000500682 2830 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 CTNND1-231ENST00000532463 5749 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 RIPK1-202ENST00000380409 3864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 SPATA31C1-201ENST00000420021 3895 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 LAMA2-205ENST00000617695 9678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 LAMA2-206ENST00000618192 9687 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 APOOL-203ENST00000622540 6466 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 IFNW1-201ENST00000380229 1932 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 INPP5F-208ENST00000637174 3168 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 ZNF540-201ENST00000316433 3099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 PRRC2C-201ENST00000338920 10355 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 HMG20A-202ENST00000381714 4112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 LSM8-204ENST00000424702 4030 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 AC091544.5-201ENST00000620192 3815 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 LHX9-201ENST00000367387 7836 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 CHD6-202ENST00000373222 2477 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 ORC3-206ENST00000546266 2470 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 AL133268.1-201ENST00000405676 1401 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 AC061975.5-201ENST00000584928 1441 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 TTC8-217ENST00000622513 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 MAP3K13-201ENST00000265026 9876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 MAPRE2-203ENST00000436190 4323 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 TRPC4-207ENST00000426868 2709 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 151.1 ms