Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 GPN3P1-201ENST00000423883 535 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 Z99289.1-206ENST00000425503 393 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 AL008723.2-201ENST00000426354 562 ntTSL 4 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 AL158832.1-201ENST00000429661 406 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 MIR205HG-206ENST00000440276 539 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 OR2L9P-201ENST00000444456 913 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 AC092601.1-201ENST00000444526 383 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 LINC01952-202ENST00000450016 281 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 PDCD10-207ENST00000471885 764 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 RN7SL369P-201ENST00000477138 299 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 AC109439.2-201ENST00000502421 564 ntTSL 4 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 NACAP5-201ENST00000509863 636 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 AC139722.1-201ENST00000512502 782 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 RNA5SP206-201ENST00000516703 121 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 TDGP1-201ENST00000543961 1229 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 MYL2-203ENST00000548438 664 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 AC116158.2-201ENST00000559544 553 ntTSL 4 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 AC090651.1-201ENST00000567865 634 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 AC011468.1-201ENST00000569091 675 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 MIR5010-201ENST00000582846 120 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 AC025809.1-201ENST00000585336 560 ntTSL 4 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 LINC01841-201ENST00000586698 573 ntTSL 4 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 AC091132.1-201ENST00000588189 547 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 LINC01966-201ENST00000595809 821 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 AL591167.1-201ENST00000607321 456 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 AC006924.1-201ENST00000610750 559 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 Metazoa_SRP.66-201ENST00000615609 282 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 MIR7159-201ENST00000620587 66 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 AL138693.1-201ENST00000622219 129 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 AL161457.2-202ENST00000629161 743 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 AC099329.1-203ENST00000629885 767 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 LINC01002-237ENST00000634025 555 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 PLCB1-202ENST00000378637 3864 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 DPH5-203ENST00000370109 1316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 MDM2-201ENST00000258148 1361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 HDAC1P2-201ENST00000453661 1398 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 IGIP-201ENST00000333305 3458 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 VNN3-207ENST00000425515 1761 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 BEND2-201ENST00000380030 1938 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 FAR2-201ENST00000182377 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 AKAP7-201ENST00000263050 2238 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 OPRM1-217ENST00000522236 2459 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 RORA-203ENST00000335670 10844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 ZNF184-202ENST00000377419 2899 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 IL23R-201ENST00000347310 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 RACGAP1-203ENST00000454520 3080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 BCORP1-202ENST00000441139 3461 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 ATF7IP-201ENST00000261168 8878 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 PLCE1-203ENST00000371385 6500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 TRAF5-201ENST00000261464 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 RNU4-23P-201ENST00000362839 140 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 PAGE2B-201ENST00000374971 493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 MIR433-201ENST00000384837 93 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 GGA1-205ENST00000405147 575 ntTSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 AL133260.1-201ENST00000405720 405 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 CLHC1-204ENST00000407122 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 C7orf69-201ENST00000418326 675 ntTSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 AC018878.1-201ENST00000419904 433 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 LINC01393-201ENST00000419905 746 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 QKI-206ENST00000424802 954 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 RPL32-206ENST00000435983 620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 UBQLN1P1-207ENST00000441056 1169 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 MORF4-201ENST00000447135 971 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 LINC01456-201ENST00000453902 708 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 VPS25P1-201ENST00000455691 508 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 MTCYBP14-201ENST00000457471 715 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 KCNIP2-211ENST00000461105 858 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 RN7SL39P-201ENST00000462264 297 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 HMGN1P8-201ENST00000463578 288 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 RN7SL393P-201ENST00000463588 296 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 RN7SL104P-201ENST00000498686 293 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 AC018607.1-201ENST00000518552 673 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 AC011131.1-201ENST00000521224 252 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 ARHGAP20-203ENST00000527598 5998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 AP004243.1-201ENST00000529108 1433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 RAB30-209ENST00000532548 644 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 AC124891.1-201ENST00000536322 519 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 NPIPB1P-201ENST00000547442 1129 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 VPS29-210ENST00000552130 1057 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 AL049836.2-201ENST00000553318 513 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 AC013652.2-202ENST00000558948 910 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 AC104151.1-201ENST00000563764 323 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 AL133410.1-201ENST00000574939 546 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 NPIPB1P-202ENST00000588786 828 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 AC092944.2-201ENST00000605443 889 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 AL133243.2-201ENST00000610331 1621 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 MUC1-221ENST00000610359 1101 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 ZNF610-208ENST00000613461 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 MUC1-227ENST00000615517 951 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 ZNF248-209ENST00000615949 518 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 NBPF12-205ENST00000617614 4630 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 AP001541.1-201ENST00000623322 1904 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 AC244205.1-201ENST00000624935 705 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 AL359094.1-201ENST00000627944 566 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 RPL37-201ENST00000274242 7686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 SPTA1-201ENST00000368147 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 FASTKD1-204ENST00000453153 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 SMC1A-202ENST00000375340 9930 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 MBNL2-202ENST00000345429 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 DDX1-208ENST00000621973 2183 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
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