Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 AC040977.1-201ENST00000573222 343 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
LMAN2Q12907 OCLM-201ENST00000574641 884 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
LMAN2Q12907 AC074141.1-201ENST00000588129 2995 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
LMAN2Q12907 AC007100.1-201ENST00000606382 478 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
LMAN2Q12907 AP000894.4-201ENST00000610185 483 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
LMAN2Q12907 AL135999.3-201ENST00000610501 812 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
LMAN2Q12907 MIR6085-201ENST00000618314 110 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
LMAN2Q12907 AC253576.2-201ENST00000618815 580 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
LMAN2Q12907 AP001264.1-201ENST00000620602 703 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
LMAN2Q12907 LINC02495-203ENST00000636704 242 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
LMAN2Q12907 AC132825.8-201ENST00000640783 297 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
LMAN2Q12907 CALU-203ENST00000479257 2572 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
LMAN2Q12907 N4BP2-201ENST00000261435 9744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
LMAN2Q12907 MYO3B-203ENST00000409044 5448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
LMAN2Q12907 CCDC125-203ENST00000396499 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
LMAN2Q12907 DCP1A-206ENST00000610213 5994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
LMAN2Q12907 OLFM3-202ENST00000370103 3255 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
LMAN2Q12907 RMST-210ENST00000640149 2844 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
LMAN2Q12907 GSTM2-207ENST00000460717 1449 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
LMAN2Q12907 POLQ-204ENST00000621776 9055 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
LMAN2Q12907 FASTKD1-204ENST00000453153 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
LMAN2Q12907 NLRP13-202ENST00000588751 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
LMAN2Q12907 MEPE-203ENST00000424957 2022 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
LMAN2Q12907 ANKRD44-201ENST00000282272 5147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
LMAN2Q12907 RPL31P11-201ENST00000426558 1558 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
LMAN2Q12907 AL590542.1-201ENST00000449314 1596 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
LMAN2Q12907 CNIH1-201ENST00000216416 4793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
LMAN2Q12907 NUDT13-206ENST00000537969 2151 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
LMAN2Q12907 SELE-201ENST00000333360 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
LMAN2Q12907 NRXN1-248ENST00000636345 3595 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
LMAN2Q12907 MCFD2-202ENST00000409105 4210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
LMAN2Q12907 AC105114.1-201ENST00000624795 1862 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
LMAN2Q12907 CNTNAP4-209ENST00000622250 3783 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
LMAN2Q12907 RNU1-46P-201ENST00000384425 164 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
LMAN2Q12907 AC016769.2-201ENST00000414815 475 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
LMAN2Q12907 LINC01762-201ENST00000423907 454 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
LMAN2Q12907 RPL12P16-201ENST00000431098 498 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
LMAN2Q12907 AC073257.1-201ENST00000432474 523 ntTSL 4 BASIC6.65□□□□□ -1.34
LMAN2Q12907 BCAP29-207ENST00000445771 1157 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
LMAN2Q12907 RN7SL705P-201ENST00000481678 294 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
LMAN2Q12907 PDCD10-216ENST00000492396 814 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
LMAN2Q12907 RNA5SP418-201ENST00000515951 117 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
LMAN2Q12907 SNORA26.10-201ENST00000516427 141 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
LMAN2Q12907 SNORA81.2-201ENST00000516868 170 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
LMAN2Q12907 GLYATL1P2-201ENST00000529451 510 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
LMAN2Q12907 AL162511.1-201ENST00000556542 879 ntTSL 4 BASIC6.65□□□□□ -1.34
LMAN2Q12907 AC015818.6-201ENST00000584274 634 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
LMAN2Q12907 AC026898.1-201ENST00000586404 571 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
LMAN2Q12907 AL589863.1-201ENST00000595383 631 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
LMAN2Q12907 IGKV2OR2-1-201ENST00000605129 304 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
LMAN2Q12907 AC025171.4-201ENST00000607250 1047 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
LMAN2Q12907 SNHG5-219ENST00000623910 631 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
LMAN2Q12907 AC063952.1-203ENST00000634410 658 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
LMAN2Q12907 LINC00598-209ENST00000635966 1148 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
LMAN2Q12907 MIR4302-201ENST00000638058 60 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
LMAN2Q12907 RAP1GDS1-204ENST00000408900 1942 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
LMAN2Q12907 LRRC37A3-203ENST00000339474 2589 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
LMAN2Q12907 DNA2-203ENST00000399180 3207 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
LMAN2Q12907 LINC00598-211ENST00000636621 3241 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
LMAN2Q12907 IBTK-201ENST00000306270 6054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
LMAN2Q12907 GCSAML-210ENST00000536561 4063 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC6.65□□□□□ -1.35
LMAN2Q12907 ZNF229-203ENST00000613197 4835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
LMAN2Q12907 OR56B1-201ENST00000317121 2075 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.35
LMAN2Q12907 TGFB2-202ENST00000366930 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
LMAN2Q12907 GNRHR-201ENST00000226413 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
LMAN2Q12907 NRK-201ENST00000243300 8062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
LMAN2Q12907 AC012361.1-201ENST00000447260 1498 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
LMAN2Q12907 MYBPC1-223ENST00000553190 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
LMAN2Q12907 FOXP1-212ENST00000491238 2250 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
LMAN2Q12907 FOXJ3-204ENST00000372572 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
LMAN2Q12907 AC026316.3-201ENST00000497988 3097 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
LMAN2Q12907 TGFBR3-207ENST00000525962 3927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
LMAN2Q12907 SYNPO2-206ENST00000610556 3934 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
LMAN2Q12907 IL31RA-201ENST00000297015 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
LMAN2Q12907 CTNNA1P1-201ENST00000515849 2728 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
LMAN2Q12907 DAZ1-201ENST00000382510 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
LMAN2Q12907 AC068389.1-202ENST00000526470 3564 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
LMAN2Q12907 RPL11P4-201ENST00000332269 436 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
LMAN2Q12907 RN7SKP78-201ENST00000364711 318 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
LMAN2Q12907 OR2B3-201ENST00000377173 1106 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
LMAN2Q12907 OR2W1-201ENST00000377175 1028 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
LMAN2Q12907 RPL23AP85-201ENST00000421838 433 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
LMAN2Q12907 AL390879.2-203ENST00000426943 1121 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
LMAN2Q12907 AL592146.1-201ENST00000433869 1126 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
LMAN2Q12907 AL353681.1-201ENST00000435828 731 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
LMAN2Q12907 AC110602.1-201ENST00000437414 318 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
LMAN2Q12907 MTND4P15-201ENST00000437913 1033 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
LMAN2Q12907 AL137186.1-201ENST00000440436 480 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
LMAN2Q12907 GTF2IP14-201ENST00000441415 586 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
LMAN2Q12907 AC211433.1-201ENST00000450426 686 ntTSL 4 BASIC6.64□□□□□ -1.35
LMAN2Q12907 HMGB1P7-201ENST00000450921 612 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
LMAN2Q12907 AL139156.3-201ENST00000454802 394 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
LMAN2Q12907 HNRNPDLP2-201ENST00000455248 751 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
LMAN2Q12907 CYCSP53-201ENST00000455540 265 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
LMAN2Q12907 SSBP1-205ENST00000465582 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
LMAN2Q12907 AC092905.1-201ENST00000467527 949 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
LMAN2Q12907 GLYCTK-AS1-202ENST00000472761 109 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
LMAN2Q12907 GM2AP2-201ENST00000491764 562 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
LMAN2Q12907 LINC01596-201ENST00000503609 592 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
LMAN2Q12907 RRM2B-206ENST00000519317 420 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
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