Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 LINC01492-201ENST00000411575 3738 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 MCM8-201ENST00000265187 3442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 CHRM5-201ENST00000383263 5410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 UIMC1-207ENST00000506128 1945 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 CNTNAP4-209ENST00000622250 3783 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 ZNF532-222ENST00000591083 5324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 ALS2CR12-207ENST00000439709 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 AC121761.1-201ENST00000547326 1482 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 TCF7L2-218ENST00000538897 4000 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 ZNF229-203ENST00000613197 4835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 RAB9B-201ENST00000243298 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 API5P1-201ENST00000424316 1510 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 ZNF780A-203ENST00000450241 7500 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 EZH1-222ENST00000592743 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 AMY2A-204ENST00000622339 1862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 MYPN-202ENST00000358913 6013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 CPEB4-202ENST00000334035 6705 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 HSD17B4-202ENST00000414835 2551 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 CTNNA2-202ENST00000361291 3071 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 ANK2-201ENST00000264366 11775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 KLHL5-205ENST00000508137 2926 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 TRIP12-201ENST00000283943 9874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 DNA2-208ENST00000551118 3468 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 ANKRD12-201ENST00000262126 11288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 NME5-201ENST00000265191 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 CCR8-201ENST00000326306 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 VTRNA3-1P-201ENST00000362552 102 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 RNA5SP77-201ENST00000365394 120 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 XAGE5-202ENST00000375501 415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 IFNB1-201ENST00000380232 859 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 AC017035.1-201ENST00000411999 1115 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 AL512504.1-201ENST00000415494 778 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 SLC25A12-202ENST00000422440 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 OR1M1-201ENST00000429566 1035 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 AC108479.1-201ENST00000431142 427 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 AC242426.1-201ENST00000435270 960 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 AL139220.2-214ENST00000437643 614 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 AL691517.1-201ENST00000440833 1235 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 LINC01013-203ENST00000443303 569 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 AL020997.1-201ENST00000446554 349 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 RN7SL254P-201ENST00000460609 284 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 RPL5P12-201ENST00000477071 851 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 RPS10P20-201ENST00000494130 463 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 AC023794.2-201ENST00000504891 528 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 AC119751.4-201ENST00000507498 357 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 ERVH-1-201ENST00000507666 639 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 AC010425.1-201ENST00000511734 554 ntTSL 4 BASIC6.45□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 HMGN1P15-201ENST00000513870 295 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 OR52H2P-201ENST00000514607 902 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 AC022915.3-201ENST00000518620 594 ntTSL 4 BASIC6.45□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 CYCSP25-201ENST00000525280 316 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 AP002498.1-201ENST00000530190 568 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 AC024145.1-201ENST00000535324 775 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 AL133481.2-201ENST00000538322 367 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 AC090680.2-201ENST00000550279 742 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 AC090502.3-201ENST00000552046 529 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 AL161752.1-201ENST00000557721 263 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 AC026956.1-201ENST00000558741 396 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 MTND1P8-201ENST00000571424 950 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 AC134669.2-201ENST00000578584 1008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 AP005433.1-202ENST00000580845 521 ntTSL 4 BASIC6.45□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 AC023421.2-202ENST00000586213 547 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 CHMP1B-AS1-201ENST00000586474 553 ntTSL 4 BASIC6.45□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 AC105094.2-202ENST00000590968 566 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 AC245052.7-201ENST00000601161 359 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 AL391834.1-201ENST00000609609 560 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 AL135999.3-201ENST00000610501 812 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 AL136097.3-201ENST00000611097 505 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 AL136359.1-201ENST00000625090 565 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 OR2AK2-202ENST00000641852 1008 ntAPPRIS P2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 SNX25-202ENST00000504273 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 AC012668.3-202ENST00000417485 1642 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 MAGT1-204ENST00000610432 4019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 GNRHR-201ENST00000226413 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 TIMM21-201ENST00000169551 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 C14orf105-201ENST00000216445 3082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 NBPF25P-202ENST00000619932 3827 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 CSNK1A1-205ENST00000515435 1856 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 SORCS1-209ENST00000612154 6862 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 IL1RAP-212ENST00000443369 2760 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 AP000866.1-202ENST00000529392 2792 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 SPAG9-209ENST00000510283 4949 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 SELP-203ENST00000367788 2427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 AC112243.1-201ENST00000623949 3851 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 MAMDC2-AS1-202ENST00000414515 2097 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 XIAP-205ENST00000434753 8415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 ZNF711-202ENST00000360700 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 DNAJC28-202ENST00000381947 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 ARL14EPL-201ENST00000601302 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 ZNF415-203ENST00000500065 2496 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 DMD-202ENST00000343523 5623 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 MROH3P-201ENST00000435735 2676 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 ABCA11P-202ENST00000504019 2110 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 WASHC4-214ENST00000620430 5807 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 RORA-201ENST00000261523 1951 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 DAZ3-202ENST00000382365 3503 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 TMEM167B-201ENST00000338272 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 TRIM6-205ENST00000445329 2951 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 FHL5-201ENST00000326771 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 CDON-201ENST00000263577 4186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103 ms